RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497721.5

LRIG1-208, Transcript of leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1, human

TSL 4

Gene LRIG1, Length 598 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRIG1-208	ENST00000497721	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
LRIG1-208	ENST00000497721	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
LRIG1-208	ENST00000497721	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LRIG1-208	ENST00000497721	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LRIG1-208	ENST00000497721	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LRIG1-208	ENST00000497721	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LRIG1-208	ENST00000497721	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LRIG1-208	ENST00000497721	BBOX1	O75936	387 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LRIG1-208	ENST00000497721	EPHX2	P34913	555 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LRIG1-208	ENST00000497721	EPS15	P42566	896 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LRIG1-208	ENST00000497721	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
LRIG1-208	ENST00000497721	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
LRIG1-208	ENST00000497721	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
LRIG1-208	ENST00000497721	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
LRIG1-208	ENST00000497721	CHADL	Q6NUI6	762 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LRIG1-208	ENST00000497721	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
LRIG1-208	ENST00000497721	MPND	Q8N594	471 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LRIG1-208	ENST00000497721	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LRIG1-208	ENST00000497721	KLRG1	Q96E93	195 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LRIG1-208	ENST00000497721	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
LRIG1-208	ENST00000497721	HACL1	Q9UJ83	578 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LRIG1-208	ENST00000497721	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LRIG1-208	ENST00000497721	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LRIG1-208	ENST00000497721	PCNT	O95613	3336 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LRIG1-208	ENST00000497721	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	SCN9A	Q15858	1988 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	SLC4A2	P04920	1241 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	IGKV5-2	P06315	115 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	NIM1K	Q8IY84	436 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	GPC2	Q8N158	579 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	RIMBP2	O15034	1052 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	VAMP4	O75379	141 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	SCNN1D	P51172	638 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	GPSM2	P81274	684 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	10.07	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	CXCL9	Q07325	125 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	KSR2	Q6VAB6	950 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	POLL	Q9UGP5	575 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	IL16	Q14005	1332 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	SHTN1	A0MZ66	631 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	YDJC	A8MPS7	323 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	RAD17	O75943	681 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	LDHD	Q86WU2	507 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	STK31	Q9BXU1	1019 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	C6orf229	H3BNL8	230 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	PDE8A	O60658	829 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	DOK7	Q18PE1	504 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	WDR63	Q8IWG1	891 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	PASK	Q96RG2	1323 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721		F6X3S4	739 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	FLII	Q13045	1269 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	CNTROB	Q8N137	903 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	WASHC4	Q2M389	1173 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	JMY	Q8N9B5	988 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	VPS33B	Q9H267	617 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721	PSME4	Q14997	1843 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LRIG1-208	ENST00000497721		H7C1W4	665 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LRIG1-208	ENST00000497721	TRAF5	O00463	557 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LRIG1-208	ENST00000497721	PSMD14	O00487	310 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LRIG1-208	ENST00000497721	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
LRIG1-208	ENST00000497721	CTSW	P56202	376 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LRIG1-208	ENST00000497721	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LRIG1-208	ENST00000497721	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LRIG1-208	ENST00000497721	DLK2	Q6UY11	383 aa		10.02	□□□□□ -0.81

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