RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	MORC1	Q86VD1	984 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	SERPINB2	P05120	415 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP2K5	Q13163	448 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	NARF	Q9UHQ1	456 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM161A	Q3B820	660 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	SLF2	Q8IX21	1173 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	COL15A1	P39059	1388 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	RCCD1	A6NED2	376 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	14.72	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	PANK3	Q9H999	370 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	NPHP1	O15259	732 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP4C	P60510	307 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC39A6	Q13433	755 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	NFKBIE	O00221	500 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	ERFE	Q4G0M1	354 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	LGR6	Q9HBX8	967 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	TJP1	Q07157	1748 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A087WZG4	1122 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	IRF6	O14896	467 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	C21orf2	O43822	256 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	STARD3NL	O95772	234 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	WBP1L	Q9NX94	342 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	PCNT	O95613	3336 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	SBF1	O95248	1867 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	PDE6B	P35913	854 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF40	O75150	1001 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	ZMYND10	O75800	440 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	HMOX1	P09601	288 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	IL13	P35225	146 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	AIDA	Q96BJ3	306 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	POTEC	B2RU33	542 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	14.65	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	ST5	P78524	1137 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	SOGA3	Q5TF21	947 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	CNBD1	Q8NA66	436 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	CNKSR1	Q969H4	720 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	SETDB2	Q96T68	719 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXN1	O15353	648 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	TEF	Q10587	303 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR14	Q9BWN1	585 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	14.61	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	LDHD	Q86WU2	507 aa		14.6	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	MRC1	P22897	1456 aa		14.6	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		14.6	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		14.6	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	STYK1	Q6J9G0	422 aa		14.59	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC102A	Q96A19	550 aa		14.59	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		14.59	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		14.59	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	CNTNAP1	P78357	1384 aa		14.59	□□□□□ -0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		14.58	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	14.58	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	MASTL	Q96GX5	879 aa		14.58	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	14.58	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC93	Q567U6	631 aa		14.57	□□□□□ -0.08

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