RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 MPNDQ8N594 471 aa29.34■■■□□ 2.29
TRDMT1-211ENST00000495022 HYPKQ9NX55 129 aa29.34■■■□□ 2.29
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNRF3Q9ULT6 936 aa29.34■■■□□ 2.29
TRDMT1-211ENST00000495022 ISCA1Q9BUE6 129 aa29.33■■■□□ 2.29
TRDMT1-211ENST00000495022 VEGFBP49765 207 aa29.32■■■□□ 2.28
TRDMT1-211ENST00000495022 DUSP27Q5VZP5 1158 aa29.32■■■□□ 2.28
TRDMT1-211ENST00000495022 MBIPQ9NS73 344 aa29.32■■■□□ 2.28
TRDMT1-211ENST00000495022 RASSF10A6NK89 507 aa29.31■■■□□ 2.28
TRDMT1-211ENST00000495022 KIAA2012Q0VF49 1180 aa29.31■■■□□ 2.28
TRDMT1-211ENST00000495022 DUOX1Q9NRD9 1551 aa29.31■■■□□ 2.28
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF853P0CG23 659 aa29.3■■■□□ 2.28
TRDMT1-211ENST00000495022 CXCL9Q07325 125 aa29.3■■■□□ 2.28
TRDMT1-211ENST00000495022 GPRC5DQ9NZD1 345 aa29.3■■■□□ 2.28
TRDMT1-211ENST00000495022 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
TRDMT1-211ENST00000495022 CDHR2Q9BYE9 1310 aa29.28■■■□□ 2.28
TRDMT1-211ENST00000495022 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
TRDMT1-211ENST00000495022 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
TRDMT1-211ENST00000495022 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
TRDMT1-211ENST00000495022 DEFB115Q30KQ5 88 aa29.27■■■□□ 2.28
TRDMT1-211ENST00000495022 IFT57Q9NWB7 429 aa29.27■■■□□ 2.28
TRDMT1-211ENST00000495022 FOXN1O15353 648 aa29.26■■■□□ 2.28
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM89AQ96GI7 184 aa29.26■■■□□ 2.28
TRDMT1-211ENST00000495022 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa29.26■■■□□ 2.27
TRDMT1-211ENST00000495022 CIAPIN1Q6FI81 312 aa29.26■■■□□ 2.27
TRDMT1-211ENST00000495022 APAF1O14727 1248 aa29.25■■■□□ 2.27
TRDMT1-211ENST00000495022 GNAI1P63096 354 aa29.25■■■□□ 2.27
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF428Q96B54 188 aa29.25■■■□□ 2.27
TRDMT1-211ENST00000495022 AIDAQ96BJ3 306 aa29.25■■■□□ 2.27
TRDMT1-211ENST00000495022 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
TRDMT1-211ENST00000495022 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
TRDMT1-211ENST00000495022 TNIP1Q15025 636 aa29.24■■■□□ 2.27
TRDMT1-211ENST00000495022 THSD7BQ9C0I4 1608 aa29.23■■■□□ 2.27
TRDMT1-211ENST00000495022 WBP1LQ9NX94 342 aa29.23■■■□□ 2.27
TRDMT1-211ENST00000495022 GOLGA2Q08379 1002 aa29.22■■■□□ 2.27
TRDMT1-211ENST00000495022 PRDM10Q9NQV6 1147 aa29.22■■■□□ 2.27
TRDMT1-211ENST00000495022 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
TRDMT1-211ENST00000495022 RAD17O75943 681 aa29.21■■■□□ 2.27
TRDMT1-211ENST00000495022 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
TRDMT1-211ENST00000495022 RIC3Q7Z5B4 369 aa29.21■■■□□ 2.27
TRDMT1-211ENST00000495022 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
TRDMT1-211ENST00000495022 COL4A1P02462 1669 aa29.21■■■□□ 2.27
TRDMT1-211ENST00000495022 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
TRDMT1-211ENST00000495022 CAPN15O75808 1086 aa29.2■■■□□ 2.26
TRDMT1-211ENST00000495022 BCL2L13Q9BXK5 485 aa29.2■■■□□ 2.26
TRDMT1-211ENST00000495022 YDJCA8MPS7 323 aa29.19■■■□□ 2.26
TRDMT1-211ENST00000495022 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP29.19■■■□□ 2.26
TRDMT1-211ENST00000495022 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
TRDMT1-211ENST00000495022 TRAF5O00463 557 aa29.18■■■□□ 2.26
TRDMT1-211ENST00000495022 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
TRDMT1-211ENST00000495022 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
TRDMT1-211ENST00000495022 CST9Q5W186 159 aa29.18■■■□□ 2.26
TRDMT1-211ENST00000495022 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
TRDMT1-211ENST00000495022 CHMP4AQ9BY43 222 aa29.18■■■□□ 2.26
TRDMT1-211ENST00000495022 PGAP2Q9UHJ9 254 aa29.18■■■□□ 2.26
TRDMT1-211ENST00000495022 WASHC4Q2M389 1173 aa29.17■■■□□ 2.26
TRDMT1-211ENST00000495022 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
TRDMT1-211ENST00000495022 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
TRDMT1-211ENST00000495022 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
TRDMT1-211ENST00000495022 MYH3P11055 1940 aa29.17■■■□□ 2.26
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TRDMT1-211ENST00000495022 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
TRDMT1-211ENST00000495022 ECE1P42892 770 aa29.15■■■□□ 2.26
TRDMT1-211ENST00000495022 TLL2Q9Y6L7 1015 aa29.15■■■□□ 2.26
TRDMT1-211ENST00000495022 RPS8P62241 208 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC191Q8NCU4 936 aa29.14■■■□□ 2.26
TRDMT1-211ENST00000495022 POLLQ9UGP5 575 aa29.14■■■□□ 2.26
TRDMT1-211ENST00000495022 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
TRDMT1-211ENST00000495022 SCN9AQ15858 1988 aa29.14■■■□□ 2.26
TRDMT1-211ENST00000495022 GPSM2P81274 684 aa29.13■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 C8orf58Q8NAV2 365 aa29.13■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 DPF2Q92785 391 aa29.13■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 CAPNS2Q96L46 248 aa29.13■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 MYD88Q99836 296 aa29.13■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 PSME4Q14997 1843 aa29.13■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 C6orf229H3BNL8 230 aa29.13■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 H7C1D1 291 aa29.13■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC30Q5VVM6 783 aa29.13■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 EYA3Q99504 573 aa29.13■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 CACNA1FO60840 1977 aa29.12■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 TRPM4Q8TD43 1214 aa29.12■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 DBNDD1Q9H9R9 158 aa29.12■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 PSMD14O00487 310 aa29.11■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 DDX58O95786 925 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 MICALL2Q8IY33 904 aa29.11■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 CELF2O95319 508 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 LBX1P52954 281 aa29.1■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 CYP4F22Q6NT55 531 aa29.1■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 TBC1D16Q8TBP0 767 aa29.1■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 PODXL2Q9NZ53 605 aa29.1■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 RIMBP2O15034 1052 aa29.09■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC152Q4G0S7 254 aa29.09■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 CDC37L1Q7L3B6 337 aa29.09■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 SHTN1A0MZ66 631 aa29.08■■■□□ 2.25
TRDMT1-211ENST00000495022 ECE2O60344 883 aa29.08■■■□□ 2.25
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