RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488161.1

C7orf49-212, humanhuman

TSL 3

Gene C7orf49, Length 124 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf49-212ENST00000488161 RRAGCQ9HB90 399 aa8.46□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 GLTPD2A6NH11 291 aa8.45□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 DDNO94850 711 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 IARSP41252 1262 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa8.45□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa8.45□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 POTECB2RU33 542 aa8.44□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 E9PSI1 815 aa8.44□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 NEXNQ0ZGT2 675 aa8.44□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 AOC3Q16853 763 aa8.44□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 RTKN2Q8IZC4 609 aa8.44□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 PSMD1Q99460 953 aa8.44□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 KDM2BQ8NHM5 1336 aa8.44□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 CDHR2Q9BYE9 1310 aa8.44□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 A0A1B0GUL6 1792 aa8.43□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 PPIP5K2O43314 1243 aa8.43□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 PDE8AO60658 829 aa8.43□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 POTEIP0CG38 1075 aa8.43□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 POTEJP0CG39 1038 aa8.43□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 CASP7P55210 303 aa8.43□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 CTSWP56202 376 aa8.43□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 GCKRQ14397 625 aa8.43□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 BEND3Q5T5X7 828 aa8.43□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 SLC4A10Q6U841 1118 aa8.43□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 SSH1Q8WYL5 1049 aa8.43□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 CHMP4AQ9BY43 222 aa8.43□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 GREM2Q9H772 168 aa8.43□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 H7C1W4 665 aa8.42□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 GPSM2P81274 684 aa8.42□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 FAM161AQ3B820 660 aa8.42□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa8.42□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 SP8Q8IXZ3 490 aa8.42□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 LARGE2Q8N3Y3 721 aa8.42□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 MPNDQ8N594 471 aa8.42□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 LINS1Q8NG48 757 aa8.42□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 SCN9AQ15858 1988 aa8.41□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 FZD9O00144 591 aa8.41□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 BBOX1O75936 387 aa8.41□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 RPS8P62241 208 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.41□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 CCDC152Q4G0S7 254 aa8.41□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 EPHA10Q5JZY3 1008 aa8.41□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 TTLL11Q8NHH1 800 aa8.41□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 POLLQ9UGP5 575 aa8.41□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 GJA3Q9Y6H8 435 aa8.41□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 SCN4AP35499 1836 aa8.4□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa8.4□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 YDJCA8MPS7 323 aa8.4□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 RIMBP2O15034 1052 aa8.4□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 TOMM70O94826 608 aa8.4□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 HTRA3P83110 453 aa8.4□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 DPY19L2Q6NUT2 758 aa8.4□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 NIM1KQ8IY84 436 aa8.4□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 JDP2Q8WYK2 163 aa8.4□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 DBNDD1Q9H9R9 158 aa8.4□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 SMC4Q9NTJ3 1288 aa8.4□□□□□ -1.06
C7orf49-212ENST00000488161 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
C7orf49-212ENST00000488161 SHTN1A0MZ66 631 aa8.39□□□□□ -1.07
C7orf49-212ENST00000488161 C6orf229H3BNL8 230 aa8.39□□□□□ -1.07
C7orf49-212ENST00000488161 RAD17O75943 681 aa8.39□□□□□ -1.07
C7orf49-212ENST00000488161 UFL1O94874 794 aa8.39□□□□□ -1.07
C7orf49-212ENST00000488161 HSPA6P17066 643 aa8.39□□□□□ -1.07
C7orf49-212ENST00000488161 ITGA6P23229 1130 aa8.39□□□□□ -1.07
C7orf49-212ENST00000488161 FOXO4P98177 505 aa8.39□□□□□ -1.07
C7orf49-212ENST00000488161 KIAA2012Q0VF49 1180 aa8.39□□□□□ -1.07
C7orf49-212ENST00000488161 DOK7Q18PE1 504 aa8.39□□□□□ -1.07
C7orf49-212ENST00000488161 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa8.39□□□□□ -1.07
C7orf49-212ENST00000488161 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
C7orf49-212ENST00000488161 SUCLG2Q96I99 432 aa8.39□□□□□ -1.07
C7orf49-212ENST00000488161 PLA2G12BQ9BX93 195 aa8.39□□□□□ -1.07
C7orf49-212ENST00000488161 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
C7orf49-212ENST00000488161 TNNQ9UQP3 1299 aa8.39□□□□□ -1.07
C7orf49-212ENST00000488161 CHMP3Q9Y3E7 222 aa8.39□□□□□ -1.07
C7orf49-212ENST00000488161 RTL9Q8NET4 1388 aa8.38□□□□□ -1.07
C7orf49-212ENST00000488161 GRM8O00222 908 aa8.38□□□□□ -1.07
C7orf49-212ENST00000488161 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
C7orf49-212ENST00000488161 SCNN1DP51172 638 aa8.38□□□□□ -1.07
C7orf49-212ENST00000488161 EIF6P56537 245 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
C7orf49-212ENST00000488161 CXCL9Q07325 125 aa8.38□□□□□ -1.07
C7orf49-212ENST00000488161 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
C7orf49-212ENST00000488161 TMC4Q7Z404 712 aa8.38□□□□□ -1.07
C7orf49-212ENST00000488161 SUPT20HQ8NEM7 779 aa8.38□□□□□ -1.07
C7orf49-212ENST00000488161 TBC1D16Q8TBP0 767 aa8.38□□□□□ -1.07
C7orf49-212ENST00000488161 KAZALD1Q96I82 304 aa8.38□□□□□ -1.07
C7orf49-212ENST00000488161 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
C7orf49-212ENST00000488161 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
C7orf49-212ENST00000488161 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms