RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 AACSQ86V21 672 aa12.7□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 NLRP10Q86W26 655 aa12.7□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 PI4K2BQ8TCG2 481 aa12.7□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 SYT17Q9BSW7 474 aa12.7□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 PLA2G12BQ9BX93 195 aa12.7□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 SIL1Q9H173 461 aa12.7□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 CHMP3Q9Y3E7 222 aa12.7□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa12.69□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa12.69□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 ERC2O15083 957 aa12.69□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 BECN1Q14457 450 aa12.69□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 KLHDC4Q8TBB5 520 aa12.69□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 ECHDC1Q9NTX5 307 aa12.69□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa12.69□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa12.68□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 GPTP24298 496 aa12.68□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 SMIM5Q71RC9 77 aa12.68□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF34Q8IZ26 560 aa12.68□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 AK7Q96M32 723 aa12.68□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 REC8O95072 547 aa12.67□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 RILPL2Q969X0 211 aa12.67□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM89AQ96GI7 184 aa12.67□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 NUP98P52948 1817 aa12.67□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 KIF13BQ9NQT8 1826 aa12.67□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 CIAO1O76071 339 aa12.66□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 CAMTA2O94983 1202 aa12.66□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 SSFA2P28290 1259 aa12.66□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 MSL1Q68DK7 614 aa12.66□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 CNTROBQ8N137 903 aa12.66□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 BCORQ6W2J9 1755 aa12.66□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 UBN2Q6ZU65 1347 aa12.65□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 EYA2O00167 538 aa12.65□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 PHF14O94880 888 aa12.65□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 CSF1RP07333 972 aa12.65□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 CHMLP26374 656 aa12.65□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 POLD1P28340 1107 aa12.65□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 IL15P40933 162 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 TFCP2Q12800 502 aa12.65□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC57Q2TAC2 916 aa12.65□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 PARP10Q53GL7 1025 aa12.65□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 TNNI3KQ59H18 835 aa12.65□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 FLAD1Q8NFF5 587 aa12.65□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa12.65□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 FBXO3Q9UK99 471 aa12.65□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF652Q9Y2D9 606 aa12.65□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa12.65□□□□□ -0.38
GTPBP1-211ENST00000487538 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 RGL2O15211 777 aa12.64□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 GNPATO15228 680 aa12.64□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 CTSWP56202 376 aa12.64□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 ATG9AQ7Z3C6 839 aa12.64□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 NLGN2Q8NFZ4 835 aa12.64□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 GPR108Q9NPR9 543 aa12.64□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 PDE8AO60658 829 aa12.63□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 USP26Q9BXU7 913 aa12.63□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 SCN7AQ01118 1682 aa12.63□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 SH3TC1Q8TE82 1336 aa12.62□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 AK9Q5TCS8 1911 aa12.62□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC4A3P48751 1232 aa12.62□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 TAF7LQ5H9L4 462 aa12.62□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 SUSD4Q5VX71 490 aa12.62□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 CLEC4GQ6UXB4 293 aa12.62□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 SYNE4Q8N205 404 aa12.62□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 TTLL11Q8NHH1 800 aa12.62□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 EVI5LQ96CN4 794 aa12.62□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF609O15014 1411 aa12.62□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 CHD4Q14839 1912 aa12.61□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa12.61□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 RPS6KA4O75676 772 aa12.61□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 ATP5JP18859 108 aa12.61□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 LRRC24Q50LG9 513 aa12.61□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 KIF2CQ99661 725 aa12.61□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 TBC1D2Q9BYX2 928 aa12.61□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP12.61□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 C10orf71Q711Q0 1435 aa12.61□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 MYH3P11055 1940 aa12.6□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 HIP1O00291 1037 aa12.6□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 HSCBQ8IWL3 235 aa12.6□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 SNX21Q969T3 373 aa12.6□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
GTPBP1-211ENST00000487538 GREM2Q9H772 168 aa12.6□□□□□ -0.39
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