RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483968.5

PIK3CB-210, Transcript of phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PIK3CB, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CB-210ENST00000483968 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
PIK3CB-210ENST00000483968 EPHX2P34913 555 aa29.08■■■□□ 2.25
PIK3CB-210ENST00000483968 AOC3Q16853 763 aa29.08■■■□□ 2.25
PIK3CB-210ENST00000483968 CCDC30Q5VVM6 783 aa29.08■■■□□ 2.25
PIK3CB-210ENST00000483968 JMYQ8N9B5 988 aa29.08■■■□□ 2.25
PIK3CB-210ENST00000483968 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
PIK3CB-210ENST00000483968 NIM1KQ8IY84 436 aa29.07■■■□□ 2.24
PIK3CB-210ENST00000483968 MYD88Q99836 296 aa29.07■■■□□ 2.24
PIK3CB-210ENST00000483968 VPS33BQ9H267 617 aa29.07■■■□□ 2.24
PIK3CB-210ENST00000483968 GJA3Q9Y6H8 435 aa29.07■■■□□ 2.24
PIK3CB-210ENST00000483968 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
PIK3CB-210ENST00000483968 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
PIK3CB-210ENST00000483968 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
PIK3CB-210ENST00000483968 MPNDQ8N594 471 aa29.06■■■□□ 2.24
PIK3CB-210ENST00000483968 IL16Q14005 1332 aa29.05■■■□□ 2.24
PIK3CB-210ENST00000483968 SUPT20HQ8NEM7 779 aa29.05■■■□□ 2.24
PIK3CB-210ENST00000483968 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
PIK3CB-210ENST00000483968 PASKQ96RG2 1323 aa29.04■■■□□ 2.24
PIK3CB-210ENST00000483968 SCNN1DP51172 638 aa29.04■■■□□ 2.24
PIK3CB-210ENST00000483968 TMC4Q7Z404 712 aa29.04■■■□□ 2.24
PIK3CB-210ENST00000483968 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
PIK3CB-210ENST00000483968 CHMP4AQ9BY43 222 aa29.04■■■□□ 2.24
PIK3CB-210ENST00000483968 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
PIK3CB-210ENST00000483968 KIAA2012Q0VF49 1180 aa29.02■■■□□ 2.24
PIK3CB-210ENST00000483968 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
PIK3CB-210ENST00000483968 CCDC191Q8NCU4 936 aa29.02■■■□□ 2.24
PIK3CB-210ENST00000483968 DDX58O95786 925 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
PIK3CB-210ENST00000483968 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
PIK3CB-210ENST00000483968 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
PIK3CB-210ENST00000483968 CREBZFQ9NS37 354 aa29■■■□□ 2.23
PIK3CB-210ENST00000483968 ZNRF3Q9ULT6 936 aa29■■■□□ 2.23
PIK3CB-210ENST00000483968 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa29■■■□□ 2.23
PIK3CB-210ENST00000483968 CACNA1FO60840 1977 aa28.99■■■□□ 2.23
PIK3CB-210ENST00000483968 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
PIK3CB-210ENST00000483968 EPS15P42566 896 aa28.99■■■□□ 2.23
PIK3CB-210ENST00000483968 CXCL9Q07325 125 aa28.99■■■□□ 2.23
PIK3CB-210ENST00000483968 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
PIK3CB-210ENST00000483968 CLEC11AQ9Y240 323 aa28.99■■■□□ 2.23
PIK3CB-210ENST00000483968 FANCIQ9NVI1 1328 aa28.97■■■□□ 2.23
PIK3CB-210ENST00000483968 PI4KAP2A4QPH2 592 aa28.97■■■□□ 2.23
PIK3CB-210ENST00000483968 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
PIK3CB-210ENST00000483968 KSR2Q6VAB6 950 aa28.97■■■□□ 2.23
PIK3CB-210ENST00000483968 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa28.97■■■□□ 2.23
PIK3CB-210ENST00000483968 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
PIK3CB-210ENST00000483968 STK31Q9BXU1 1019 aa28.97■■■□□ 2.23
PIK3CB-210ENST00000483968 IGKV5-2P06315 115 aa28.96■■■□□ 2.23
PIK3CB-210ENST00000483968 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
PIK3CB-210ENST00000483968 G2E3Q7L622 706 aa28.96■■■□□ 2.23
PIK3CB-210ENST00000483968 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
PIK3CB-210ENST00000483968 MYH3P11055 1940 aa28.96■■■□□ 2.23
PIK3CB-210ENST00000483968 SEC31BQ9NQW1 1179 aa28.95■■■□□ 2.22
PIK3CB-210ENST00000483968 RPS8P62241 208 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
PIK3CB-210ENST00000483968 WDR63Q8IWG1 891 aa28.94■■■□□ 2.22
PIK3CB-210ENST00000483968 CNTROBQ8N137 903 aa28.94■■■□□ 2.22
PIK3CB-210ENST00000483968 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
PIK3CB-210ENST00000483968 YDJCA8MPS7 323 aa28.93■■■□□ 2.22
PIK3CB-210ENST00000483968 PDE8AO60658 829 aa28.93■■■□□ 2.22
PIK3CB-210ENST00000483968 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
PIK3CB-210ENST00000483968 GPSM2P81274 684 aa28.93■■■□□ 2.22
PIK3CB-210ENST00000483968 GPRC5DQ9NZD1 345 aa28.93■■■□□ 2.22
PIK3CB-210ENST00000483968 POLLQ9UGP5 575 aa28.93■■■□□ 2.22
PIK3CB-210ENST00000483968 SLC4A2P04920 1241 aa28.92■■■□□ 2.22
PIK3CB-210ENST00000483968 CIAPIN1Q6FI81 312 aa28.92■■■□□ 2.22
PIK3CB-210ENST00000483968 CDHR2Q9BYE9 1310 aa28.92■■■□□ 2.22
PIK3CB-210ENST00000483968 RAD17O75943 681 aa28.91■■■□□ 2.22
PIK3CB-210ENST00000483968 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
PIK3CB-210ENST00000483968 CCDC152Q4G0S7 254 aa28.91■■■□□ 2.22
PIK3CB-210ENST00000483968 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
PIK3CB-210ENST00000483968 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
PIK3CB-210ENST00000483968 WASHC4Q2M389 1173 aa28.9■■■□□ 2.22
PIK3CB-210ENST00000483968 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
PIK3CB-210ENST00000483968 TMEM88BA6NKF7 163 aa28.89■■■□□ 2.22
PIK3CB-210ENST00000483968 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
PIK3CB-210ENST00000483968 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
PIK3CB-210ENST00000483968 CNTNAP1P78357 1384 aa28.88■■■□□ 2.21
PIK3CB-210ENST00000483968 SCN9AQ15858 1988 aa28.88■■■□□ 2.21
PIK3CB-210ENST00000483968 NEURL1BA8MQ27 555 aa28.88■■■□□ 2.21
PIK3CB-210ENST00000483968 C6orf229H3BNL8 230 aa28.88■■■□□ 2.21
PIK3CB-210ENST00000483968 VAMP4O75379 141 aa28.88■■■□□ 2.21
PIK3CB-210ENST00000483968 FLIIQ13045 1269 aa28.88■■■□□ 2.21
PIK3CB-210ENST00000483968 IFFO2Q5TF58 517 aa28.88■■■□□ 2.21
PIK3CB-210ENST00000483968 FAM9BQ8IZU0 186 aa28.88■■■□□ 2.21
PIK3CB-210ENST00000483968 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
PIK3CB-210ENST00000483968 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
PIK3CB-210ENST00000483968 NEXNQ0ZGT2 675 aa28.87■■■□□ 2.21
PIK3CB-210ENST00000483968 TNIP1Q15025 636 aa28.87■■■□□ 2.21
PIK3CB-210ENST00000483968 TBC1D16Q8TBP0 767 aa28.87■■■□□ 2.21
PIK3CB-210ENST00000483968 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
PIK3CB-210ENST00000483968 DBNDD1Q9H9R9 158 aa28.87■■■□□ 2.21
PIK3CB-210ENST00000483968 PODXL2Q9NZ53 605 aa28.87■■■□□ 2.21
PIK3CB-210ENST00000483968 SPEF2Q9C093 1822 aa28.87■■■□□ 2.21
PIK3CB-210ENST00000483968 TRPM7Q96QT4 1865 aa28.87■■■□□ 2.21
PIK3CB-210ENST00000483968 RIMBP2O15034 1052 aa28.86■■■□□ 2.21
PIK3CB-210ENST00000483968 CTSWP56202 376 aa28.85■■■□□ 2.21
PIK3CB-210ENST00000483968 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP28.84■■■□□ 2.21
PIK3CB-210ENST00000483968 TTLL11Q8NHH1 800 aa28.84■■■□□ 2.21
PIK3CB-210ENST00000483968 BCL2L13Q9BXK5 485 aa28.84■■■□□ 2.21
PIK3CB-210ENST00000483968 SHTN1A0MZ66 631 aa28.83■■■□□ 2.21
PIK3CB-210ENST00000483968 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
PIK3CB-210ENST00000483968 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms