RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478914.1

XRCC6-208, Transcript of X-ray repair cross complementing 6, human

TSL 2

Gene XRCC6, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
XRCC6-208	ENST00000478914	FAM89A	Q96GI7	184 aa		11.26	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	STK31	Q9BXU1	1019 aa		11.26	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		11.26	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	COL4A5	P29400	1685 aa		11.25	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	EPHX2	P34913	555 aa		11.25	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	AOC3	Q16853	763 aa		11.25	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	CCDC27	Q2M243	656 aa		11.25	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		11.25	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		11.24	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	POTEI	P0CG38	1075 aa		11.24	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	POTEJ	P0CG39	1038 aa		11.24	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	WWC1	Q8IX03	1113 aa		11.24	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	MYD88	Q99836	296 aa		11.24	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	SPEF2	Q9C093	1822 aa		11.23	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		11.23	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	SLC51A	Q86UW1	340 aa		11.23	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		11.23	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	CREBZF	Q9NS37	354 aa		11.23	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	IL16	Q14005	1332 aa		11.23	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		11.22	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	LTBP1	Q14766	1721 aa		11.22	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	TSPYL6	Q8N831	410 aa		11.22	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	JMY	Q8N9B5	988 aa		11.22	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		11.22	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	PDE8A	O60658	829 aa		11.21	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		11.21	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	TNIP1	Q15025	636 aa		11.21	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		11.21	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		11.21	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
XRCC6-208	ENST00000478914	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		11.2	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	PASK	Q96RG2	1323 aa		11.2	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	C6orf229	H3BNL8	230 aa		11.2	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		11.2	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	KSR2	Q6VAB6	950 aa		11.2	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	TNS4	Q8IZW8	715 aa		11.2	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	CNTROB	Q8N137	903 aa		11.2	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	EYA3	Q99504	573 aa		11.2	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		11.2	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		11.19	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		11.19	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914		G3V3G9	751 aa		11.19	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	SLC4A2	P04920	1241 aa		11.19	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	EPS15	P42566	896 aa		11.19	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	SCNN1D	P51172	638 aa		11.19	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	CXCL9	Q07325	125 aa		11.19	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	WASHC4	Q2M389	1173 aa		11.19	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		11.19	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	WDR63	Q8IWG1	891 aa		11.19	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		11.19	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		11.19	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		11.19	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		11.18	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		11.18	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	RAD17	O75943	681 aa		11.18	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	GPSM2	P81274	684 aa		11.18	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		11.18	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	COL4A1	P02462	1669 aa		11.17	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	PSME4	Q14997	1843 aa		11.17	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	RIMBP2	O15034	1052 aa		11.17	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		11.17	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		11.17	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		11.17	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	CNTNAP1	P78357	1384 aa		11.16	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	PCNT	O95613	3336 aa		11.16	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914		H7C1D1	291 aa		11.16	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	CTSW	P56202	376 aa		11.16	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	FLII	Q13045	1269 aa		11.16	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
XRCC6-208	ENST00000478914	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		11.16	□□□□□ -0.62

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