RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477448.1

SOBP-202, Transcript of sine oculis binding protein homolog, humanhuman

TSL 5

Gene SOBP, Length 1,535 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBP-202ENST00000477448 CARMIL3Q8ND23 1372 aa32.28■■■□□ 2.76
SOBP-202ENST00000477448 HMMRO75330 724 aa32.28■■■□□ 2.76
SOBP-202ENST00000477448 NTSR2O95665 410 aa32.28■■■□□ 2.76
SOBP-202ENST00000477448 NRXN2Q9P2S2 1712 aa32.28■■■□□ 2.76
SOBP-202ENST00000477448 BCS1LQ9Y276 419 aa32.27■■■□□ 2.76
SOBP-202ENST00000477448 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.76
SOBP-202ENST00000477448 SYNE4Q8N205 404 aa32.26■■■□□ 2.76
SOBP-202ENST00000477448 PLA2G12BQ9BX93 195 aa32.26■■■□□ 2.76
SOBP-202ENST00000477448 FAM177BA6PVY3 158 aa32.26■■■□□ 2.75
SOBP-202ENST00000477448 FOXO4P98177 505 aa32.26■■■□□ 2.75
SOBP-202ENST00000477448 SSH3Q8TE77 659 aa32.26■■■□□ 2.75
SOBP-202ENST00000477448 SH3TC1Q8TE82 1336 aa32.25■■■□□ 2.75
SOBP-202ENST00000477448 POLA2Q14181 598 aa32.25■■■□□ 2.75
SOBP-202ENST00000477448 PRR5LQ6MZQ0 368 aa32.25■■■□□ 2.75
SOBP-202ENST00000477448 SRGAP3O43295 1099 aa32.24■■■□□ 2.75
SOBP-202ENST00000477448 SMC5Q8IY18 1101 aa32.24■■■□□ 2.75
SOBP-202ENST00000477448 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
SOBP-202ENST00000477448 DCTPP1Q9H773 170 aa32.22■■■□□ 2.75
SOBP-202ENST00000477448 GCC1Q96CN9 775 aa32.21■■■□□ 2.75
SOBP-202ENST00000477448 PIM2Q9P1W9 311 aa32.21■■■□□ 2.75
SOBP-202ENST00000477448 CHD4Q14839 1912 aa32.21■■■□□ 2.75
SOBP-202ENST00000477448 NYXQ9GZU5 481 aa32.21■■■□□ 2.75
SOBP-202ENST00000477448 LMBR1LQ6UX01 489 aa32.2■■■□□ 2.74
SOBP-202ENST00000477448 NUTM1Q86Y26 1132 aa32.2■■■□□ 2.74
SOBP-202ENST00000477448 CNBD1Q8NA66 436 aa32.19■■■□□ 2.74
SOBP-202ENST00000477448 NPHP1O15259 732 aa32.18■■■□□ 2.74
SOBP-202ENST00000477448 PDE8AO60658 829 aa32.18■■■□□ 2.74
SOBP-202ENST00000477448 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
SOBP-202ENST00000477448 C2CD5Q86YS7 1000 aa32.18■■■□□ 2.74
SOBP-202ENST00000477448 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
SOBP-202ENST00000477448 ERFEQ4G0M1 354 aa32.16■■■□□ 2.74
SOBP-202ENST00000477448 CSF1RP07333 972 aa32.16■■■□□ 2.74
SOBP-202ENST00000477448 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
SOBP-202ENST00000477448 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
SOBP-202ENST00000477448 TPTE2Q6XPS3 522 aa32.16■■■□□ 2.74
SOBP-202ENST00000477448 BRIP1Q9BX63 1249 aa32.16■■■□□ 2.74
SOBP-202ENST00000477448 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
SOBP-202ENST00000477448 CTSWP56202 376 aa32.15■■■□□ 2.74
SOBP-202ENST00000477448 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa32.14■■■□□ 2.74
SOBP-202ENST00000477448 ABCC12Q96J65 1359 aa32.14■■■□□ 2.74
SOBP-202ENST00000477448 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
SOBP-202ENST00000477448 H0YIN7 160 aa32.13■■■□□ 2.73
SOBP-202ENST00000477448 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP32.13■■■□□ 2.73
SOBP-202ENST00000477448 ST5P78524 1137 aa32.13■■■□□ 2.73
SOBP-202ENST00000477448 SLC10A5Q5PT55 438 aa32.13■■■□□ 2.73
SOBP-202ENST00000477448 TTLL11Q8NHH1 800 aa32.13■■■□□ 2.73
SOBP-202ENST00000477448 CHMP3Q9Y3E7 222 aa32.13■■■□□ 2.73
SOBP-202ENST00000477448 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa32.12■■■□□ 2.73
SOBP-202ENST00000477448 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa32.12■■■□□ 2.73
SOBP-202ENST00000477448 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa32.11■■■□□ 2.73
SOBP-202ENST00000477448 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
SOBP-202ENST00000477448 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
SOBP-202ENST00000477448 PDE6BP35913 854 aa32.1■■■□□ 2.73
SOBP-202ENST00000477448 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
SOBP-202ENST00000477448 SURF6O75683 361 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
SOBP-202ENST00000477448 FAM161AQ3B820 660 aa32.1■■■□□ 2.73
SOBP-202ENST00000477448 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP32.1■■■□□ 2.73
SOBP-202ENST00000477448 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP32.1■■■□□ 2.73
SOBP-202ENST00000477448 NUCB1Q02818 461 aa32.09■■■□□ 2.73
SOBP-202ENST00000477448 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP32.09■■■□□ 2.73
SOBP-202ENST00000477448 COPRSQ9NQ92 184 aa32.09■■■□□ 2.73
SOBP-202ENST00000477448 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP32.08■■■□□ 2.73
SOBP-202ENST00000477448 ANKRD45Q5TZF3 282 aa32.07■■■□□ 2.72
SOBP-202ENST00000477448 TTLL6Q8N841 843 aa32.07■■■□□ 2.72
SOBP-202ENST00000477448 KLHDC4Q8TBB5 520 aa32.07■■■□□ 2.72
SOBP-202ENST00000477448 GREM2Q9H772 168 aa32.07■■■□□ 2.72
SOBP-202ENST00000477448 RIC1Q4ADV7 1423 aa32.07■■■□□ 2.72
SOBP-202ENST00000477448 CCDC57Q2TAC2 916 aa32.05■■■□□ 2.72
SOBP-202ENST00000477448 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa32.05■■■□□ 2.72
SOBP-202ENST00000477448 RTL9Q8NET4 1388 aa32.05■■■□□ 2.72
SOBP-202ENST00000477448 RAB11FIP3O75154 756 aa32.05■■■□□ 2.72
SOBP-202ENST00000477448 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
SOBP-202ENST00000477448 CHD1LQ86WJ1 897 aa32.05■■■□□ 2.72
SOBP-202ENST00000477448 SKAP1Q86WV1 359 aa32.05■■■□□ 2.72
SOBP-202ENST00000477448 APBB1O00213 710 aa32.04■■■□□ 2.72
SOBP-202ENST00000477448 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
SOBP-202ENST00000477448 CCDC152Q4G0S7 254 aa32.04■■■□□ 2.72
SOBP-202ENST00000477448 C3orf67Q6ZVT6 689 aa32.04■■■□□ 2.72
SOBP-202ENST00000477448 SPEF2Q9C093 1822 aa32.04■■■□□ 2.72
SOBP-202ENST00000477448 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
SOBP-202ENST00000477448 DLEC1Q9Y238 1755 aa32.03■■■□□ 2.72
SOBP-202ENST00000477448 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa32.03■■■□□ 2.72
SOBP-202ENST00000477448 SRGNP10124 158 aa32.03■■■□□ 2.72
SOBP-202ENST00000477448 ITGA6P23229 1130 aa32.03■■■□□ 2.72
SOBP-202ENST00000477448 TAF1P21675 1872 aa32.03■■■□□ 2.72
SOBP-202ENST00000477448 NLRP3Q96P20 1036 aa32.02■■■□□ 2.72
SOBP-202ENST00000477448 SIL1Q9H173 461 aa32.02■■■□□ 2.72
SOBP-202ENST00000477448 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP32.02■■■□□ 2.72
SOBP-202ENST00000477448 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa32.01■■■□□ 2.72
SOBP-202ENST00000477448 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP32.01■■■□□ 2.72
SOBP-202ENST00000477448 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP32.01■■■□□ 2.72
SOBP-202ENST00000477448 LRRCC1Q9C099 1032 aa32.01■■■□□ 2.72
SOBP-202ENST00000477448 LNPKQ9C0E8 428 aa32.01■■■□□ 2.72
SOBP-202ENST00000477448 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP32■■■□□ 2.71
SOBP-202ENST00000477448 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP31.99■■■□□ 2.71
SOBP-202ENST00000477448 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP31.99■■■□□ 2.71
SOBP-202ENST00000477448 ERC1Q8IUD2 1116 aa31.99■■■□□ 2.71
SOBP-202ENST00000477448 RHPN1Q8TCX5 695 aa31.99■■■□□ 2.71
SOBP-202ENST00000477448 KIF1BPQ96EK5 621 aa31.99■■■□□ 2.71
SOBP-202ENST00000477448 MASTLQ96GX5 879 aa31.99■■■□□ 2.71
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