RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476510.5

GTPBP2-208, Transcript of GTP binding protein 2, human

TSL 5

Gene GTPBP2, Length 2,816 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP2-208	ENST00000476510	SSFA2	P28290	1259 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	SUSD4	Q5VX71	490 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	COPRS	Q9NQ92	184 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		13.4	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	ERC2	O15083	957 aa		13.4	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	GNPAT	O15228	680 aa		13.4	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		13.4	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	AK9	Q5TCS8	1911 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	DDIT3	P35638	169 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	TNNI3K	Q59H18	835 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	USP26	Q9BXU7	913 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	SNAP23	O00161	211 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	TRIM37	O94972	964 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	GPATCH3	Q96I76	525 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	ITGA6	P23229	1130 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	CNTROB	Q8N137	903 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	KLHL34	Q8N239	644 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	CAMTA2	O94983	1202 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	SNRK	Q9NRH2	765 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	PAPPA	Q13219	1627 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	EYA2	O00167	538 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	FAM227B	Q96M60	508 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	FSD1	Q9BTV5	496 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	PALD1	Q9ULE6	856 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	ESPN	B1AK53	854 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	REC8	O95072	547 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	ADORA1	P30542	326 aa		13.35	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	GORAB	Q5T7V8	394 aa		13.35	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	CTSW	P56202	376 aa		13.35	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		13.35	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		13.35	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	COL15A1	P39059	1388 aa		13.35	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510		A0A1B0GUL7	405 aa		13.35	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	NPHP1	O15259	732 aa		13.35	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		13.34	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	METTL24	Q5JXM2	366 aa		13.34	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	MCTP1	Q6DN14	999 aa		13.34	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		13.34	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	TAF5L	O75529	589 aa		13.34	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	13.34	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	PI16	Q6UXB8	463 aa		13.34	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		13.34	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		13.33	□□□□□ -0.27
GTPBP2-208	ENST00000476510	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		13.33	□□□□□ -0.28
GTPBP2-208	ENST00000476510	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
GTPBP2-208	ENST00000476510	GOLIM4	O00461	696 aa		13.33	□□□□□ -0.28
GTPBP2-208	ENST00000476510	DTNB	O60941	627 aa		13.33	□□□□□ -0.28
GTPBP2-208	ENST00000476510	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
GTPBP2-208	ENST00000476510	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		13.33	□□□□□ -0.28
GTPBP2-208	ENST00000476510	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		13.33	□□□□□ -0.28
GTPBP2-208	ENST00000476510	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		13.33	□□□□□ -0.28
GTPBP2-208	ENST00000476510	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		13.33	□□□□□ -0.28
GTPBP2-208	ENST00000476510	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		13.32	□□□□□ -0.28
GTPBP2-208	ENST00000476510	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
GTPBP2-208	ENST00000476510	ERFE	Q4G0M1	354 aa		13.32	□□□□□ -0.28
GTPBP2-208	ENST00000476510	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
GTPBP2-208	ENST00000476510	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
GTPBP2-208	ENST00000476510	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
GTPBP2-208	ENST00000476510	PDE8A	O60658	829 aa		13.32	□□□□□ -0.28
GTPBP2-208	ENST00000476510	ZPR1	O75312	459 aa		13.32	□□□□□ -0.28

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms