RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476204.5

HOXB-AS3-208, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4

Gene HOXB-AS3, Length 539 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CTSWP56202 376 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXB-AS3-208ENST00000476204 C3orf67Q6ZVT6 689 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXB-AS3-208ENST00000476204 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GRAPQ13588 217 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
HOXB-AS3-208ENST00000476204 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RPS8P62241 208 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FOXO4P98177 505 aa24.34■■□□□ 1.49
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TMEM57Q8N5G2 664 aa24.34■■□□□ 1.49
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RTL9Q8NET4 1388 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SP8Q8IXZ3 490 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 C7orf43Q8WVR3 580 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LMBR1LQ6UX01 489 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RTKN2Q8IZC4 609 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SUCLG2Q96I99 432 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TNNQ9UQP3 1299 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 C21orf2O43822 256 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PLIN1O60240 522 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CCDC57Q2TAC2 916 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ITPRIPQ8IWB1 547 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GNAI2P04899 355 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RLBP1P12271 317 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KAZALD1Q96I82 304 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GREM2Q9H772 168 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DDX19BQ9UMR2 479 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DLEC1Q9Y238 1755 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ITGA6P23229 1130 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CCDC93Q567U6 631 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 EPHA10Q5JZY3 1008 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PANK1Q8TE04 598 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MEIS3Q99687 375 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CHMP3Q9Y3E7 222 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MVPQ14764 893 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-208ENST00000476204 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-208ENST00000476204 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-208ENST00000476204 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LAMB2P55268 1798 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TAF7LQ5H9L4 462 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-208ENST00000476204 VPS33BQ9H267 617 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SLX4Q8IY92 1834 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FAM161AQ3B820 660 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MPNDQ8N594 471 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ANKRD44Q8N8A2 993 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SUPT20HQ8NEM7 779 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-208ENST00000476204 COG6Q9Y2V7 657 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-208ENST00000476204 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LTBP3Q9NS15 1303 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MYH3P11055 1940 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.46
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PSMD1Q99460 953 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ANKRD2Q9GZV1 360 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FBXO3Q9UK99 471 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MTX1Q13505 466 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TAOK3Q9H2K8 898 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ATP8B2P98198 1209 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LMNB1P20700 586 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXB-AS3-208ENST00000476204 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NFKBIEO00221 500 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ATP2B4P23634 1241 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB-AS3-208ENST00000476204 AAMPQ13685 434 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CNNM1Q9NRU3 951 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SRGAP3O43295 1099 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXB-AS3-208ENST00000476204 OLFM4Q6UX06 510 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXB-AS3-208ENST00000476204 EYA3Q99504 573 aa24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms