RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470356.3

HMG20B-209, Transcript of high mobility group 20B, human

TSL 1 (best)

Gene HMG20B, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HMG20B-209	ENST00000470356	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		40.48	■■■■■ 4.07
HMG20B-209	ENST00000470356	PASK	Q96RG2	1323 aa		40.48	■■■■■ 4.07
HMG20B-209	ENST00000470356	AOC3	Q16853	763 aa		40.48	■■■■■ 4.07
HMG20B-209	ENST00000470356	CCDC27	Q2M243	656 aa		40.48	■■■■■ 4.07
HMG20B-209	ENST00000470356	PCNT	O95613	3336 aa		40.47	■■■■■ 4.07
HMG20B-209	ENST00000470356	IFFO2	Q5TF58	517 aa		40.47	■■■■■ 4.07
HMG20B-209	ENST00000470356	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		40.47	■■■■■ 4.07
HMG20B-209	ENST00000470356	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	40.46	■■■■■ 4.07
HMG20B-209	ENST00000470356	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		40.46	■■■■■ 4.07
HMG20B-209	ENST00000470356	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	40.44	■■■■■ 4.06
HMG20B-209	ENST00000470356	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	40.43	■■■■■ 4.06
HMG20B-209	ENST00000470356	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	40.43	■■■■■ 4.06
HMG20B-209	ENST00000470356	WWC1	Q8IX03	1113 aa		40.43	■■■■■ 4.06
HMG20B-209	ENST00000470356	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		40.43	■■■■■ 4.06
HMG20B-209	ENST00000470356	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	40.42	■■■■■ 4.06
HMG20B-209	ENST00000470356	SCNN1D	P51172	638 aa		40.42	■■■■■ 4.06
HMG20B-209	ENST00000470356	TSPYL6	Q8N831	410 aa		40.42	■■■■■ 4.06
HMG20B-209	ENST00000470356	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		40.41	■■■■■ 4.06
HMG20B-209	ENST00000470356	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	40.41	■■■■■ 4.06
HMG20B-209	ENST00000470356	LTBP1	Q14766	1721 aa		40.41	■■■■■ 4.06
HMG20B-209	ENST00000470356	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		40.4	■■■■■ 4.06
HMG20B-209	ENST00000470356	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	40.4	■■■■■ 4.06
HMG20B-209	ENST00000470356	MRS2	Q9HD23	443 aa		40.4	■■■■■ 4.06
HMG20B-209	ENST00000470356	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	40.39	■■■■■ 4.06
HMG20B-209	ENST00000470356	EPS15	P42566	896 aa		40.39	■■■■■ 4.06
HMG20B-209	ENST00000470356	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	40.39	■■■■■ 4.06
HMG20B-209	ENST00000470356	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		40.39	■■■■■ 4.06
HMG20B-209	ENST00000470356	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	40.39	■■■■■ 4.06
HMG20B-209	ENST00000470356	MYD88	Q99836	296 aa		40.39	■■■■■ 4.06
HMG20B-209	ENST00000470356	ANP32C	O43423	234 aa		40.38	■■■■■ 4.05
HMG20B-209	ENST00000470356	CXCL9	Q07325	125 aa		40.38	■■■■■ 4.05
HMG20B-209	ENST00000470356	CNTROB	Q8N137	903 aa		40.38	■■■■■ 4.05
HMG20B-209	ENST00000470356	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	40.37	■■■■■ 4.05
HMG20B-209	ENST00000470356	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	40.37	■■■■■ 4.05
HMG20B-209	ENST00000470356	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	40.36	■■■■■ 4.05
HMG20B-209	ENST00000470356	IL16	Q14005	1332 aa		40.35	■■■■■ 4.05
HMG20B-209	ENST00000470356	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		40.34	■■■■■ 4.05
HMG20B-209	ENST00000470356	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		40.34	■■■■■ 4.05
HMG20B-209	ENST00000470356	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	40.33	■■■■■ 4.05
HMG20B-209	ENST00000470356	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	40.33	■■■■■ 4.05
HMG20B-209	ENST00000470356	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	40.33	■■■■■ 4.05
HMG20B-209	ENST00000470356	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	40.33	■■■■■ 4.05
HMG20B-209	ENST00000470356	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	40.32	■■■■■ 4.05
HMG20B-209	ENST00000470356	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		40.32	■■■■■ 4.05
HMG20B-209	ENST00000470356	STK31	Q9BXU1	1019 aa		40.31	■■■■■ 4.04
HMG20B-209	ENST00000470356	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	40.31	■■■■■ 4.04
HMG20B-209	ENST00000470356	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		40.3	■■■■■ 4.04
HMG20B-209	ENST00000470356	KSR2	Q6VAB6	950 aa		40.3	■■■■■ 4.04
HMG20B-209	ENST00000470356	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		40.3	■■■■■ 4.04
HMG20B-209	ENST00000470356	COL4A1	P02462	1669 aa		40.3	■■■■■ 4.04
HMG20B-209	ENST00000470356	TNIP1	Q15025	636 aa		40.29	■■■■■ 4.04
HMG20B-209	ENST00000470356	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	40.29	■■■■■ 4.04
HMG20B-209	ENST00000470356	CNTNAP1	P78357	1384 aa		40.28	■■■■■ 4.04
HMG20B-209	ENST00000470356	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	40.27	■■■■■ 4.04
HMG20B-209	ENST00000470356	WASHC4	Q2M389	1173 aa		40.27	■■■■■ 4.04
HMG20B-209	ENST00000470356	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	40.27	■■■■■ 4.04
HMG20B-209	ENST00000470356	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		40.26	■■■■■ 4.04
HMG20B-209	ENST00000470356	PDE8A	O60658	829 aa		40.26	■■■■■ 4.04
HMG20B-209	ENST00000470356	RAD17	O75943	681 aa		40.26	■■■■■ 4.04
HMG20B-209	ENST00000470356	GPSM2	P81274	684 aa		40.26	■■■■■ 4.04
HMG20B-209	ENST00000470356	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		40.26	■■■■■ 4.04
HMG20B-209	ENST00000470356	YDJC	A8MPS7	323 aa		40.25	■■■■■ 4.03
HMG20B-209	ENST00000470356	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	40.25	■■■■■ 4.03
HMG20B-209	ENST00000470356	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	40.25	■■■■■ 4.03
HMG20B-209	ENST00000470356	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		40.25	■■■■■ 4.03
HMG20B-209	ENST00000470356	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		40.25	■■■■■ 4.03
HMG20B-209	ENST00000470356	POLL	Q9UGP5	575 aa		40.25	■■■■■ 4.03
HMG20B-209	ENST00000470356	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		40.24	■■■■■ 4.03
HMG20B-209	ENST00000470356	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	40.24	■■■■■ 4.03
HMG20B-209	ENST00000470356	C6orf229	H3BNL8	230 aa		40.23	■■■■■ 4.03
HMG20B-209	ENST00000470356	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		40.22	■■■■■ 4.03
HMG20B-209	ENST00000470356	CACNA1F	O60840	1977 aa		40.21	■■■■■ 4.03
HMG20B-209	ENST00000470356	SLC4A2	P04920	1241 aa		40.21	■■■■■ 4.03
HMG20B-209	ENST00000470356	IGKV5-2	P06315	115 aa		40.21	■■■■■ 4.03
HMG20B-209	ENST00000470356	WDR63	Q8IWG1	891 aa		40.21	■■■■■ 4.03
HMG20B-209	ENST00000470356	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		40.2	■■■■■ 4.03
HMG20B-209	ENST00000470356	EYA3	Q99504	573 aa		40.2	■■■■■ 4.03
HMG20B-209	ENST00000470356	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	40.19	■■■■■ 4.02
HMG20B-209	ENST00000470356	G2E3	Q7L622	706 aa		40.19	■■■■■ 4.02
HMG20B-209	ENST00000470356	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		40.19	■■■■■ 4.02
HMG20B-209	ENST00000470356	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		40.19	■■■■■ 4.02
HMG20B-209	ENST00000470356	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		40.18	■■■■■ 4.02
HMG20B-209	ENST00000470356	RIMBP2	O15034	1052 aa		40.18	■■■■■ 4.02
HMG20B-209	ENST00000470356	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		40.17	■■■■■ 4.02
HMG20B-209	ENST00000470356	VEGFB	P49765	207 aa		40.16	■■■■■ 4.02
HMG20B-209	ENST00000470356	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	40.16	■■■■■ 4.02
HMG20B-209	ENST00000470356	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		40.15	■■■■■ 4.02
HMG20B-209	ENST00000470356	RASSF10	A6NK89	507 aa		40.15	■■■■■ 4.02
HMG20B-209	ENST00000470356	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	40.15	■■■■■ 4.02
HMG20B-209	ENST00000470356	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	40.15	■■■■■ 4.02
HMG20B-209	ENST00000470356	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		40.14	■■■■■ 4.02
HMG20B-209	ENST00000470356	MYH3	P11055	1940 aa		40.14	■■■■■ 4.02
HMG20B-209	ENST00000470356	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		40.13	■■■■■ 4.01
HMG20B-209	ENST00000470356	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	40.13	■■■■■ 4.01
HMG20B-209	ENST00000470356	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		40.13	■■■■■ 4.01
HMG20B-209	ENST00000470356	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		40.13	■■■■■ 4.01
HMG20B-209	ENST00000470356	CTSW	P56202	376 aa		40.12	■■■■■ 4.01
HMG20B-209	ENST00000470356	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	40.12	■■■■■ 4.01
HMG20B-209	ENST00000470356	DPF2	Q92785	391 aa		40.12	■■■■■ 4.01
HMG20B-209	ENST00000470356	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	40.12	■■■■■ 4.01

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