RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469241.2

PKD1-205, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, humanhuman

TSL 2

Gene PKD1, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1-205ENST00000469241 CNTROBQ8N137 903 aa26.76■■□□□ 1.87
PKD1-205ENST00000469241 FAM89AQ96GI7 184 aa26.76■■□□□ 1.87
PKD1-205ENST00000469241 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
PKD1-205ENST00000469241 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
PKD1-205ENST00000469241 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
PKD1-205ENST00000469241 SCNN1DP51172 638 aa26.74■■□□□ 1.87
PKD1-205ENST00000469241 ZNRF3Q9ULT6 936 aa26.74■■□□□ 1.87
PKD1-205ENST00000469241 LTBP1Q14766 1721 aa26.73■■□□□ 1.87
PKD1-205ENST00000469241 CNTNAP1P78357 1384 aa26.73■■□□□ 1.87
PKD1-205ENST00000469241 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
PKD1-205ENST00000469241 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
PKD1-205ENST00000469241 EPS15P42566 896 aa26.72■■□□□ 1.87
PKD1-205ENST00000469241 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.72■■□□□ 1.87
PKD1-205ENST00000469241 TAF1P21675 1872 aa26.72■■□□□ 1.87
PKD1-205ENST00000469241 KIAA2012Q0VF49 1180 aa26.71■■□□□ 1.87
PKD1-205ENST00000469241 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
PKD1-205ENST00000469241 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
PKD1-205ENST00000469241 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
PKD1-205ENST00000469241 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
PKD1-205ENST00000469241 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
PKD1-205ENST00000469241 CXCL9Q07325 125 aa26.69■■□□□ 1.86
PKD1-205ENST00000469241 LRRC37AA6NMS7 1700 aa26.68■■□□□ 1.86
PKD1-205ENST00000469241 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
PKD1-205ENST00000469241 CIAPIN1Q6FI81 312 aa26.68■■□□□ 1.86
PKD1-205ENST00000469241 C8orf58Q8NAV2 365 aa26.68■■□□□ 1.86
PKD1-205ENST00000469241 MYD88Q99836 296 aa26.68■■□□□ 1.86
PKD1-205ENST00000469241 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
PKD1-205ENST00000469241 GPRC5DQ9NZD1 345 aa26.68■■□□□ 1.86
PKD1-205ENST00000469241 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
PKD1-205ENST00000469241 TNIP1Q15025 636 aa26.67■■□□□ 1.86
PKD1-205ENST00000469241 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.67■■□□□ 1.86
PKD1-205ENST00000469241 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
PKD1-205ENST00000469241 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.67■■□□□ 1.86
PKD1-205ENST00000469241 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
PKD1-205ENST00000469241 PCNTO95613 3336 aa26.67■■□□□ 1.86
PKD1-205ENST00000469241 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
PKD1-205ENST00000469241 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
PKD1-205ENST00000469241 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
PKD1-205ENST00000469241 RAD17O75943 681 aa26.65■■□□□ 1.86
PKD1-205ENST00000469241 VEGFBP49765 207 aa26.65■■□□□ 1.86
PKD1-205ENST00000469241 TNS4Q8IZW8 715 aa26.65■■□□□ 1.86
PKD1-205ENST00000469241 DUOX1Q9NRD9 1551 aa26.65■■□□□ 1.86
PKD1-205ENST00000469241 WASHC4Q2M389 1173 aa26.64■■□□□ 1.86
PKD1-205ENST00000469241 CDHR2Q9BYE9 1310 aa26.64■■□□□ 1.85
PKD1-205ENST00000469241 C6orf229H3BNL8 230 aa26.63■■□□□ 1.85
PKD1-205ENST00000469241 DEFB115Q30KQ5 88 aa26.63■■□□□ 1.85
PKD1-205ENST00000469241 CCDC184Q52MB2 194 aa26.63■■□□□ 1.85
PKD1-205ENST00000469241 CCDC191Q8NCU4 936 aa26.63■■□□□ 1.85
PKD1-205ENST00000469241 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
PKD1-205ENST00000469241 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
PKD1-205ENST00000469241 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
PKD1-205ENST00000469241 RASSF10A6NK89 507 aa26.61■■□□□ 1.85
PKD1-205ENST00000469241 RPS8P62241 208 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
PKD1-205ENST00000469241 GPSM2P81274 684 aa26.61■■□□□ 1.85
PKD1-205ENST00000469241 AIDAQ96BJ3 306 aa26.61■■□□□ 1.85
PKD1-205ENST00000469241 EYA3Q99504 573 aa26.61■■□□□ 1.85
PKD1-205ENST00000469241 STK31Q9BXU1 1019 aa26.61■■□□□ 1.85
PKD1-205ENST00000469241 RIMBP2O15034 1052 aa26.6■■□□□ 1.85
PKD1-205ENST00000469241 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
PKD1-205ENST00000469241 TSPYL6Q8N831 410 aa26.6■■□□□ 1.85
PKD1-205ENST00000469241 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
PKD1-205ENST00000469241 YDJCA8MPS7 323 aa26.59■■□□□ 1.85
PKD1-205ENST00000469241 CCDC27Q2M243 656 aa26.59■■□□□ 1.85
PKD1-205ENST00000469241 CCDC152Q4G0S7 254 aa26.59■■□□□ 1.85
PKD1-205ENST00000469241 DBNDD1Q9H9R9 158 aa26.59■■□□□ 1.85
PKD1-205ENST00000469241 COL4A1P02462 1669 aa26.58■■□□□ 1.85
PKD1-205ENST00000469241 TRAF5O00463 557 aa26.58■■□□□ 1.85
PKD1-205ENST00000469241 PDE8AO60658 829 aa26.58■■□□□ 1.85
PKD1-205ENST00000469241 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.58■■□□□ 1.85
PKD1-205ENST00000469241 H7C1D1 291 aa26.57■■□□□ 1.84
PKD1-205ENST00000469241 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP26.57■■□□□ 1.84
PKD1-205ENST00000469241 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
PKD1-205ENST00000469241 WWC1Q8IX03 1113 aa26.57■■□□□ 1.84
PKD1-205ENST00000469241 MRS2Q9HD23 443 aa26.57■■□□□ 1.84
PKD1-205ENST00000469241 SEC31BQ9NQW1 1179 aa26.57■■□□□ 1.84
PKD1-205ENST00000469241 POLLQ9UGP5 575 aa26.57■■□□□ 1.84
PKD1-205ENST00000469241 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
PKD1-205ENST00000469241 TRPM7Q96QT4 1865 aa26.57■■□□□ 1.84
PKD1-205ENST00000469241 NEXNQ0ZGT2 675 aa26.56■■□□□ 1.84
PKD1-205ENST00000469241 KSR2Q6VAB6 950 aa26.56■■□□□ 1.84
PKD1-205ENST00000469241 TBC1D16Q8TBP0 767 aa26.56■■□□□ 1.84
PKD1-205ENST00000469241 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
PKD1-205ENST00000469241 FOXN1O15353 648 aa26.55■■□□□ 1.84
PKD1-205ENST00000469241 ANP32CO43423 234 aa26.55■■□□□ 1.84
PKD1-205ENST00000469241 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
PKD1-205ENST00000469241 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
PKD1-205ENST00000469241 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa26.55■■□□□ 1.84
PKD1-205ENST00000469241 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
PKD1-205ENST00000469241 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.54■■□□□ 1.84
PKD1-205ENST00000469241 G3V3G9 751 aa26.54■■□□□ 1.84
PKD1-205ENST00000469241 PSMD14O00487 310 aa26.54■■□□□ 1.84
PKD1-205ENST00000469241 ECE2O60344 883 aa26.54■■□□□ 1.84
PKD1-205ENST00000469241 CAPN15O75808 1086 aa26.54■■□□□ 1.84
PKD1-205ENST00000469241 DOK7Q18PE1 504 aa26.54■■□□□ 1.84
PKD1-205ENST00000469241 DCAF8Q5TAQ9 597 aa26.54■■□□□ 1.84
PKD1-205ENST00000469241 MICALL2Q8IY33 904 aa26.54■■□□□ 1.84
PKD1-205ENST00000469241 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.54■■□□□ 1.84
PKD1-205ENST00000469241 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PKD1-205ENST00000469241 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PKD1-205ENST00000469241 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms