RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-204ENST00000468347 SFI1A8K8P3 1242 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-204ENST00000468347 TEAD4Q15561 434 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-204ENST00000468347 BEND4Q6ZU67 534 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-204ENST00000468347 MAP4K3Q8IVH8 894 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-204ENST00000468347 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-204ENST00000468347 RHPN1Q8TCX5 695 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-204ENST00000468347 FAM168AQ92567 244 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-204ENST00000468347 SIRT1Q96EB6 747 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-204ENST00000468347 HSH2DQ96JZ2 352 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-204ENST00000468347 MFSD14AQ96MC6 490 aa5.22□□□□□ -1.57
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SHQ1-204ENST00000468347 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
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SHQ1-204ENST00000468347 KCNK4Q9NYG8 393 aa5.11□□□□□ -1.59
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SHQ1-204ENST00000468347 SHISA5Q8N114 240 aa5.1□□□□□ -1.59
SHQ1-204ENST00000468347 PLD4Q96BZ4 506 aa5.1□□□□□ -1.59
SHQ1-204ENST00000468347 ZFATQ9P243 1243 aa5.1□□□□□ -1.59
SHQ1-204ENST00000468347 GPR37L1O60883 481 aa5.09□□□□□ -1.59
SHQ1-204ENST00000468347 SLFNL1Q499Z3 407 aa5.09□□□□□ -1.59
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