RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-211ENST00000467464 SCN4AP35499 1836 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 IL16Q14005 1332 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 PPIP5K2O43314 1243 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 CCDC30Q5VVM6 783 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 RIC3Q7Z5B4 369 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 MYD88Q99836 296 aa15.47■□□□□ 0.07
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PTPRF-211ENST00000467464 MPNDQ8N594 471 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
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PTPRF-211ENST00000467464 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
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PTPRF-211ENST00000467464 CDHR2Q9BYE9 1310 aa15.42■□□□□ 0.06
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PTPRF-211ENST00000467464 WASHC4Q2M389 1173 aa15.38■□□□□ 0.05
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PTPRF-211ENST00000467464 TMEM88BA6NKF7 163 aa15.37■□□□□ 0.05
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PTPRF-211ENST00000467464 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
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PTPRF-211ENST00000467464 TTLL11Q8NHH1 800 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-211ENST00000467464 TRPM4Q8TD43 1214 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-211ENST00000467464 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-211ENST00000467464 DBNDD1Q9H9R9 158 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-211ENST00000467464 KCNQ5Q9NR82 932 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-211ENST00000467464 PGAP2Q9UHJ9 254 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-211ENST00000467464 C6orf229H3BNL8 230 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-211ENST00000467464 PSMD14O00487 310 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-211ENST00000467464 RIMBP2O15034 1052 aa15.35■□□□□ 0.05
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