RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 LINS1Q8NG48 757 aa18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1-205ENST00000466097 PSMD1Q99460 953 aa18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1-205ENST00000466097 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1-205ENST00000466097 LRRC37AA6NMS7 1700 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1-205ENST00000466097 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
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SH3BP1-205ENST00000466097 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP18.76■□□□□ 0.59
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SH3BP1-205ENST00000466097 GCKRQ14397 625 aa18.75■□□□□ 0.59
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SH3BP1-205ENST00000466097 SP8Q8IXZ3 490 aa18.75■□□□□ 0.59
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SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
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SH3BP1-205ENST00000466097 SEC31BQ9NQW1 1179 aa18.69■□□□□ 0.58
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SH3BP1-205ENST00000466097 COL4A5P29400 1685 aa18.65■□□□□ 0.58
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SH3BP1-205ENST00000466097 FAM161AQ3B820 660 aa18.63■□□□□ 0.57
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SH3BP1-205ENST00000466097 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-205ENST00000466097 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
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SH3BP1-205ENST00000466097 CHMP3Q9Y3E7 222 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-205ENST00000466097 XDHP47989 1333 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1-205ENST00000466097 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa18.61■□□□□ 0.57
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SH3BP1-205ENST00000466097 GGA1Q9UJY5 639 aa18.61■□□□□ 0.57
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