RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461691.6

ZBED1-204, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene ZBED1, Length 947 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-204ENST00000461691 CHMP4AQ9BY43 222 aa18.08■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 CREBZFQ9NS37 354 aa18.08■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 TMC4Q7Z404 712 aa18.07■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 PASKQ96RG2 1323 aa18.06■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 CCDC30Q5VVM6 783 aa18.06■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 LRRC37AA6NMS7 1700 aa18.06■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 LTBP1Q14766 1721 aa18.05■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 DDX58O95786 925 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 SCNN1DP51172 638 aa18.04■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 CCDC27Q2M243 656 aa18.04■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 ZNRF3Q9ULT6 936 aa18.04■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 ANP32CO43423 234 aa18.03■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 EPS15P42566 896 aa18.03■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 KIAA2012Q0VF49 1180 aa18.03■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 CNTROBQ8N137 903 aa18.03■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 MYD88Q99836 296 aa18.03■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 MRS2Q9HD23 443 aa18.03■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 TMEM88BA6NKF7 163 aa18.02■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 CXCL9Q07325 125 aa18.02■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 WWC1Q8IX03 1113 aa18.02■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 TSPYL6Q8N831 410 aa18.02■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 CCDC191Q8NCU4 936 aa18.02■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
ZBED1-204ENST00000461691 DUOX1Q9NRD9 1551 aa18.01■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 CIAPIN1Q6FI81 312 aa18■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 STK31Q9BXU1 1019 aa18■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 GPRC5DQ9NZD1 345 aa18■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 CNTNAP1P78357 1384 aa18■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 IL16Q14005 1332 aa17.99■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 RPS8P62241 208 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 TNIP1Q15025 636 aa17.99■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa17.99■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 COL4A1P02462 1669 aa17.99■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 RAD17O75943 681 aa17.98■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 WASHC4Q2M389 1173 aa17.98■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 TRPM7Q96QT4 1865 aa17.97■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 C6orf229H3BNL8 230 aa17.97■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 PDE8AO60658 829 aa17.97■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 GPSM2P81274 684 aa17.97■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 CCDC152Q4G0S7 254 aa17.97■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 KSR2Q6VAB6 950 aa17.97■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 BCL2L13Q9BXK5 485 aa17.97■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 CACNA1FO60840 1977 aa17.97■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 CDHR2Q9BYE9 1310 aa17.97■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 PI4KAP2A4QPH2 592 aa17.96■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 YDJCA8MPS7 323 aa17.96■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 NEXNQ0ZGT2 675 aa17.96■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa17.96■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 EYA3Q99504 573 aa17.96■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 SEC31BQ9NQW1 1179 aa17.96■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 MYH3P11055 1940 aa17.96■□□□□ 0.47
ZBED1-204ENST00000461691 RIMBP2O15034 1052 aa17.95■□□□□ 0.46
ZBED1-204ENST00000461691 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
ZBED1-204ENST00000461691 POLLQ9UGP5 575 aa17.95■□□□□ 0.46
ZBED1-204ENST00000461691 SLC4A2P04920 1241 aa17.94■□□□□ 0.46
ZBED1-204ENST00000461691 IGKV5-2P06315 115 aa17.94■□□□□ 0.46
ZBED1-204ENST00000461691 DBNDD1Q9H9R9 158 aa17.94■□□□□ 0.46
ZBED1-204ENST00000461691 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
ZBED1-204ENST00000461691 VEGFBP49765 207 aa17.93■□□□□ 0.46
ZBED1-204ENST00000461691 DEFB115Q30KQ5 88 aa17.93■□□□□ 0.46
ZBED1-204ENST00000461691 G2E3Q7L622 706 aa17.93■□□□□ 0.46
ZBED1-204ENST00000461691 WDR63Q8IWG1 891 aa17.93■□□□□ 0.46
ZBED1-204ENST00000461691 TBC1D16Q8TBP0 767 aa17.93■□□□□ 0.46
ZBED1-204ENST00000461691 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
ZBED1-204ENST00000461691 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
ZBED1-204ENST00000461691 FANCIQ9NVI1 1328 aa17.93■□□□□ 0.46
ZBED1-204ENST00000461691 RASSF10A6NK89 507 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1-204ENST00000461691 H7C1D1 291 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1-204ENST00000461691 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP17.92■□□□□ 0.46
ZBED1-204ENST00000461691 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1-204ENST00000461691 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
ZBED1-204ENST00000461691 PODXL2Q9NZ53 605 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1-204ENST00000461691 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1-204ENST00000461691 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
ZBED1-204ENST00000461691 TRAF5O00463 557 aa17.91■□□□□ 0.46
ZBED1-204ENST00000461691 PSMD14O00487 310 aa17.91■□□□□ 0.46
ZBED1-204ENST00000461691 ECE2O60344 883 aa17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms