RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460130.5

TCL6-204, Transcript of T cell leukemia/lymphoma 6, human

TSL 3 BASIC

Gene TCL6, Length 911 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCL6-204	ENST00000460130	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	SASH1	O94885	1247 aa		15	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		15	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		15	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	COPRS	Q9NQ92	184 aa		15	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	STAP2	Q9UGK3	403 aa		15	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	DDR1	Q08345	913 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	TTC22	Q5TAA0	569 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	SYNE4	Q8N205	404 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	FAM89A	Q96GI7	184 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	ZBTB7A	O95365	584 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	NTSR2	O95665	410 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	SERPINB2	P05120	415 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	MMP10	P09238	476 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	PDE1A	P54750	535 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	NYX	Q9GZU5	481 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	NPHP1	O15259	732 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	CSF1R	P07333	972 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	ERFE	Q4G0M1	354 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	MTFR1L	Q9H019	292 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TCL6-204	ENST00000460130	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	CNBD1	Q8NA66	436 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	AK9	Q5TCS8	1911 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	AOX1	Q06278	1338 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	PDE8A	O60658	829 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	SDS	P20132	328 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	MX1	P20591	662 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	ST5	P78524	1137 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	ABCC12	Q96J65	1359 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	LRP5	O75197	1615 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	POLD1	P28340	1107 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	14.92	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	SIL1	Q9H173	461 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	TAF1	P21675	1872 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	COL4A1	P02462	1669 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		14.9	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	NLRP3	Q96P20	1036 aa		14.9	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
TCL6-204	ENST00000460130	EYA2	O00167	538 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TCL6-204	ENST00000460130	CTSW	P56202	376 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TCL6-204	ENST00000460130	TFCP2	Q12800	502 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TCL6-204	ENST00000460130	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
TCL6-204	ENST00000460130	LRRC24	Q50LG9	513 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TCL6-204	ENST00000460130	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TCL6-204	ENST00000460130	BCL11A	Q9H165	835 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TCL6-204	ENST00000460130	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
TCL6-204	ENST00000460130		A0A1B0GUL6	1792 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TCL6-204	ENST00000460130	SPEF2	Q9C093	1822 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TCL6-204	ENST00000460130	CDC45	O75419	566 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TCL6-204	ENST00000460130	CIAO1	O76071	339 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TCL6-204	ENST00000460130	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
TCL6-204	ENST00000460130	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TCL6-204	ENST00000460130	SPON1	Q9HCB6	807 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TCL6-204	ENST00000460130	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TCL6-204	ENST00000460130	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TCL6-204	ENST00000460130	PTGER2	P43116	358 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TCL6-204	ENST00000460130	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	14.87	□□□□□ -0.03
TCL6-204	ENST00000460130	AACS	Q86V21	672 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TCL6-204	ENST00000460130	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TCL6-204	ENST00000460130	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TCL6-204	ENST00000460130	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
TCL6-204	ENST00000460130	GREM2	Q9H772	168 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TCL6-204	ENST00000460130	GPR108	Q9NPR9	543 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TCL6-204	ENST00000460130	FBXO3	Q9UK99	471 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TCL6-204	ENST00000460130	RTL9	Q8NET4	1388 aa		14.86	□□□□□ -0.03

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