RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460041.5

HOXB-AS3-202, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 728 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
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HOXB-AS3-202ENST00000460041 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
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HOXB-AS3-202ENST00000460041 LBX1P52954 281 aa13.42□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CST9Q5W186 159 aa13.42□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TRIM35Q9UPQ4 493 aa13.42□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TLL2Q9Y6L7 1015 aa13.42□□□□□ -0.26
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HOXB-AS3-202ENST00000460041 CHPF2Q9P2E5 772 aa13.4□□□□□ -0.26
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HOXB-AS3-202ENST00000460041 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CFAP44Q96MT7 982 aa13.39□□□□□ -0.27
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HOXB-AS3-202ENST00000460041 NEUROD2Q15784 382 aa13.38□□□□□ -0.27
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HOXB-AS3-202ENST00000460041 PSME4Q14997 1843 aa13.38□□□□□ -0.27
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HOXB-AS3-202ENST00000460041 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP13.37□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CYP4F22Q6NT55 531 aa13.37□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CDC37L1Q7L3B6 337 aa13.37□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CCDC146Q8IYE0 955 aa13.37□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 BEGAINQ9BUH8 593 aa13.37□□□□□ -0.27
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HOXB-AS3-202ENST00000460041 RAD17O75943 681 aa13.36□□□□□ -0.27
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HOXB-AS3-202ENST00000460041 WASHC4Q2M389 1173 aa13.36□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FAM89AQ96GI7 184 aa13.36□□□□□ -0.27
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HOXB-AS3-202ENST00000460041 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa13.35□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZNF853P0CG23 659 aa13.35□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TRPM4Q8TD43 1214 aa13.35□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa13.34□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RPS12P25398 132 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DUSP27Q5VZP5 1158 aa13.34□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ABHD8Q96I13 439 aa13.34□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PODXL2Q9NZ53 605 aa13.34□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MYH3P11055 1940 aa13.34□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZNF609O15014 1411 aa13.33□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PSMD14O00487 310 aa13.33□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
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HOXB-AS3-202ENST00000460041 MICALL2Q8IY33 904 aa13.33□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 EYA3Q99504 573 aa13.33□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MBIPQ9NS73 344 aa13.33□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 POLLQ9UGP5 575 aa13.33□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 AKAP11Q9UKA4 1901 aa13.33□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 AOC2O75106 756 aa13.32□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GPSM2P81274 684 aa13.32□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TBC1D16Q8TBP0 767 aa13.32□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CHMP4AQ9BY43 222 aa13.32□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DBNDD1Q9H9R9 158 aa13.32□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IFT57Q9NWB7 429 aa13.32□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SHTN1A0MZ66 631 aa13.31□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 C6orf229H3BNL8 230 aa13.31□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ECE2O60344 883 aa13.31□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GNAI1P63096 354 aa13.31□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GOLGA2Q08379 1002 aa13.31□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NOGQ13253 232 aa13.31□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GRM1Q13255 1194 aa13.31□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RIC3Q7Z5B4 369 aa13.31□□□□□ -0.28
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