RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
SH3BP1-204ENST00000459646 AIDAQ96BJ3 306 aa11.09□□□□□ -0.63
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNRF3Q9ULT6 936 aa11.09□□□□□ -0.63
SH3BP1-204ENST00000459646 G3V3G9 751 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 C6orf229H3BNL8 230 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 RAD17O75943 681 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 GOLGA2Q08379 1002 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 GRAPQ13588 217 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 DEFB115Q30KQ5 88 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 DCAF8Q5TAQ9 597 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 PASKQ96RG2 1323 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 COL4A5P29400 1685 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 TRPM7Q96QT4 1865 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 HOXB7P09629 217 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 VEGFBP49765 207 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 CXCL9Q07325 125 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 TNIP1Q15025 636 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 CIAPIN1Q6FI81 312 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 MYD88Q99836 296 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 PCNTO95613 3336 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 SCNN1DP51172 638 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP11.06□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 WASHC4Q2M389 1173 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 ISCA1Q9BUE6 129 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 VPS33BQ9H267 617 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 IFT57Q9NWB7 429 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 CNTNAP1P78357 1384 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 TRAF5O00463 557 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 LTBP1Q14766 1721 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 TMC4Q7Z404 712 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 C8orf58Q8NAV2 365 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 SNED1Q8TER0 1413 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF408Q9H9D4 720 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 GPRC5DQ9NZD1 345 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 H7C1D1 291 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 DDX58O95786 925 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 RPS8P62241 208 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 KIAA2012Q0VF49 1180 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 DOK7Q18PE1 504 aa11.04□□□□□ -0.64
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SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC30Q5VVM6 783 aa11.04□□□□□ -0.64
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SH3BP1-204ENST00000459646 CHMP4AQ9BY43 222 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 DBNDD1Q9H9R9 158 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 FOXN1O15353 648 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF853P0CG23 659 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 GPSM2P81274 684 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 EYA3Q99504 573 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 STK31Q9BXU1 1019 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 SEC31BQ9NQW1 1179 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
SH3BP1-204ENST00000459646 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC184Q52MB2 194 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP1-204ENST00000459646 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
SH3BP1-204ENST00000459646 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
SH3BP1-204ENST00000459646 BEGAINQ9BUH8 593 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP1-204ENST00000459646 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
SH3BP1-204ENST00000459646 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
SH3BP1-204ENST00000459646 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
SH3BP1-204ENST00000459646 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP1-204ENST00000459646 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
SH3BP1-204ENST00000459646 SPEF2Q9C093 1822 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP1-204ENST00000459646 SHTN1A0MZ66 631 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP1-204ENST00000459646 RASSF10A6NK89 507 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP1-204ENST00000459646 YDJCA8MPS7 323 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP1-204ENST00000459646 CELF2O95319 508 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
SH3BP1-204ENST00000459646 ECE1P42892 770 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP1-204ENST00000459646 LBX1P52954 281 aa11.01□□□□□ -0.65
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SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC152Q4G0S7 254 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP1-204ENST00000459646 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
SH3BP1-204ENST00000459646 CYP4F22Q6NT55 531 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP1-204ENST00000459646 MICALL2Q8IY33 904 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP1-204ENST00000459646 TSPYL6Q8N831 410 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC191Q8NCU4 936 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP1-204ENST00000459646 CAPNS2Q96L46 248 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP1-204ENST00000459646 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
SH3BP1-204ENST00000459646 POLLQ9UGP5 575 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP1-204ENST00000459646 PSMD14O00487 310 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP1-204ENST00000459646 ECE2O60344 883 aa11□□□□□ -0.65
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