RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453996.6

CTU2-202, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-202ENST00000453996 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CTU2-202ENST00000453996 FBXO3Q9UK99 471 aa26.1■■□□□ 1.77
CTU2-202ENST00000453996 TTLL11Q8NHH1 800 aa26.09■■□□□ 1.77
CTU2-202ENST00000453996 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CTU2-202ENST00000453996 C4AP0C0L4 1744 aa26.08■■□□□ 1.77
CTU2-202ENST00000453996 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CTU2-202ENST00000453996 RBM25P49756 843 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
CTU2-202ENST00000453996 TAF7LQ5H9L4 462 aa26.07■■□□□ 1.76
CTU2-202ENST00000453996 CNTROBQ8N137 903 aa26.07■■□□□ 1.76
CTU2-202ENST00000453996 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CTU2-202ENST00000453996 NARFQ9UHQ1 456 aa26.07■■□□□ 1.76
CTU2-202ENST00000453996 FAM177BA6PVY3 158 aa26.06■■□□□ 1.76
CTU2-202ENST00000453996 TRIM37O94972 964 aa26.06■■□□□ 1.76
CTU2-202ENST00000453996 NTSR2O95665 410 aa26.06■■□□□ 1.76
CTU2-202ENST00000453996 LRRC24Q50LG9 513 aa26.06■■□□□ 1.76
CTU2-202ENST00000453996 GPR108Q9NPR9 543 aa26.06■■□□□ 1.76
CTU2-202ENST00000453996 EP400Q96L91 3159 aa26.06■■□□□ 1.76
CTU2-202ENST00000453996 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
CTU2-202ENST00000453996 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
CTU2-202ENST00000453996 GREM2Q9H772 168 aa26.05■■□□□ 1.76
CTU2-202ENST00000453996 COL24A1Q17RW2 1714 aa26.05■■□□□ 1.76
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CTU2-202ENST00000453996 CHMLP26374 656 aa26.05■■□□□ 1.76
CTU2-202ENST00000453996 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa26.04■■□□□ 1.76
CTU2-202ENST00000453996 SLC27A3Q5K4L6 730 aa26.04■■□□□ 1.76
CTU2-202ENST00000453996 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
CTU2-202ENST00000453996 LRRC4BQ9NT99 713 aa26.04■■□□□ 1.76
CTU2-202ENST00000453996 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
CTU2-202ENST00000453996 ZNF609O15014 1411 aa26.04■■□□□ 1.76
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CTU2-202ENST00000453996 ZPR1O75312 459 aa26.03■■□□□ 1.76
CTU2-202ENST00000453996 REC8O95072 547 aa26.03■■□□□ 1.76
CTU2-202ENST00000453996 USPL1Q5W0Q7 1092 aa26.03■■□□□ 1.76
CTU2-202ENST00000453996 SMIM5Q71RC9 77 aa26.03■■□□□ 1.76
CTU2-202ENST00000453996 UBR3Q6ZT12 1888 aa26.02■■□□□ 1.76
CTU2-202ENST00000453996 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
CTU2-202ENST00000453996 RXRBP28702 533 aa26.02■■□□□ 1.76
CTU2-202ENST00000453996 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.02■■□□□ 1.76
CTU2-202ENST00000453996 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa26.02■■□□□ 1.76
CTU2-202ENST00000453996 CEP126Q9P2H0 1117 aa26.01■■□□□ 1.75
CTU2-202ENST00000453996 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
CTU2-202ENST00000453996 CASZ1Q86V15 1759 aa26■■□□□ 1.75
CTU2-202ENST00000453996 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
CTU2-202ENST00000453996 TBC1D9BQ66K14 1250 aa26■■□□□ 1.75
CTU2-202ENST00000453996 AMIGO3Q86WK7 504 aa26■■□□□ 1.75
CTU2-202ENST00000453996 EVI5LQ96CN4 794 aa26■■□□□ 1.75
CTU2-202ENST00000453996 DBNDD2Q9BQY9 259 aa26■■□□□ 1.75
CTU2-202ENST00000453996 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CTU2-202ENST00000453996 ATP5JP18859 108 aa25.99■■□□□ 1.75
CTU2-202ENST00000453996 USP26Q9BXU7 913 aa25.99■■□□□ 1.75
CTU2-202ENST00000453996 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.98■■□□□ 1.75
CTU2-202ENST00000453996 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.98■■□□□ 1.75
CTU2-202ENST00000453996 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa25.98■■□□□ 1.75
CTU2-202ENST00000453996 RTL9Q8NET4 1388 aa25.98■■□□□ 1.75
CTU2-202ENST00000453996 ADRA2BP18089 450 aa25.97■■□□□ 1.75
CTU2-202ENST00000453996 BECN1Q14457 450 aa25.97■■□□□ 1.75
CTU2-202ENST00000453996 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.97■■□□□ 1.75
CTU2-202ENST00000453996 BOLA2Q9H3K6 86 aa25.97■■□□□ 1.75
CTU2-202ENST00000453996 AKAP2Q9Y2D5 859 aa25.97■■□□□ 1.75
CTU2-202ENST00000453996 PHF14O94880 888 aa25.97■■□□□ 1.75
CTU2-202ENST00000453996 RFC4P35249 363 aa25.97■■□□□ 1.75
CTU2-202ENST00000453996 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.97■■□□□ 1.75
CTU2-202ENST00000453996 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.97■■□□□ 1.75
CTU2-202ENST00000453996 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CTU2-202ENST00000453996 SETDB2Q96T68 719 aa25.96■■□□□ 1.75
CTU2-202ENST00000453996 NYXQ9GZU5 481 aa25.96■■□□□ 1.75
CTU2-202ENST00000453996 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.96■■□□□ 1.75
CTU2-202ENST00000453996 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.96■■□□□ 1.75
CTU2-202ENST00000453996 SPEF2Q9C093 1822 aa25.95■■□□□ 1.75
CTU2-202ENST00000453996 A0A1B0GUL7 405 aa25.95■■□□□ 1.75
CTU2-202ENST00000453996 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.95■■□□□ 1.75
CTU2-202ENST00000453996 TIMM10P62072 90 aa25.95■■□□□ 1.74
CTU2-202ENST00000453996 ERFEQ4G0M1 354 aa25.95■■□□□ 1.74
CTU2-202ENST00000453996 FBXO41Q8TF61 875 aa25.95■■□□□ 1.74
CTU2-202ENST00000453996 METTL24Q5JXM2 366 aa25.94■■□□□ 1.74
CTU2-202ENST00000453996 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa25.93■■□□□ 1.74
CTU2-202ENST00000453996 TXNRD1Q16881 649 aa25.92■■□□□ 1.74
CTU2-202ENST00000453996 HIP1O00291 1037 aa25.92■■□□□ 1.74
CTU2-202ENST00000453996 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CTU2-202ENST00000453996 KIF2CQ99661 725 aa25.92■■□□□ 1.74
CTU2-202ENST00000453996 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CTU2-202ENST00000453996 SLC4A3P48751 1232 aa25.91■■□□□ 1.74
CTU2-202ENST00000453996 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
CTU2-202ENST00000453996 RUFY2Q8WXA3 655 aa25.91■■□□□ 1.74
CTU2-202ENST00000453996 HAUS7Q99871 368 aa25.91■■□□□ 1.74
CTU2-202ENST00000453996 ANO2Q9NQ90 1003 aa25.91■■□□□ 1.74
CTU2-202ENST00000453996 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
CTU2-202ENST00000453996 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CTU2-202ENST00000453996 SGSM2O43147 1006 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU2-202ENST00000453996 SSFA2P28290 1259 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU2-202ENST00000453996 FSD1Q9BTV5 496 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU2-202ENST00000453996 MROH5Q6ZUA9 1318 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU2-202ENST00000453996 ABCC12Q96J65 1359 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU2-202ENST00000453996 PLSCR1O15162 318 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU2-202ENST00000453996 ATP2B3Q16720 1220 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU2-202ENST00000453996 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU2-202ENST00000453996 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU2-202ENST00000453996 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.89■■□□□ 1.74
CTU2-202ENST00000453996 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
CTU2-202ENST00000453996 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
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