RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449305.5

CCDC18-AS1-217, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC18-AS1, Length 748 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa18.8■□□□□ 0.6
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CCDC57Q2TAC2 916 aa18.8■□□□□ 0.6
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NUTM1Q86Y26 1132 aa18.8■□□□□ 0.6
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KIF1BPQ96EK5 621 aa18.8■□□□□ 0.6
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PDE4AP27815 886 aa18.79■□□□□ 0.6
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ITGA6P23229 1130 aa18.75■□□□□ 0.59
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SASH1O94885 1247 aa18.73■□□□□ 0.59
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NRXN2Q9P2S2 1712 aa18.72■□□□□ 0.59
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ST5P78524 1137 aa18.72■□□□□ 0.59
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DDR1Q08345 913 aa18.72■□□□□ 0.59
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa18.72■□□□□ 0.59
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP18.72■□□□□ 0.59
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SPEF2Q9C093 1822 aa18.72■□□□□ 0.59
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 C3orf67Q6ZVT6 689 aa18.69■□□□□ 0.58
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GPR108Q9NPR9 543 aa18.68■□□□□ 0.58
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SEC31BQ9NQW1 1179 aa18.68■□□□□ 0.58
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CEP126Q9P2H0 1117 aa18.68■□□□□ 0.58
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TAF1P21675 1872 aa18.68■□□□□ 0.58
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 AOX1Q06278 1338 aa18.68■□□□□ 0.58
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PDE1AP54750 535 aa18.67■□□□□ 0.58
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MSL1Q68DK7 614 aa18.67■□□□□ 0.58
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SLC16A10Q8TF71 515 aa18.67■□□□□ 0.58
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 STAP2Q9UGK3 403 aa18.67■□□□□ 0.58
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa18.67■□□□□ 0.58
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TNNI3KQ59H18 835 aa18.66■□□□□ 0.58
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa18.66■□□□□ 0.58
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GPATCH3Q96I76 525 aa18.66■□□□□ 0.58
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa18.66■□□□□ 0.58
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa18.66■□□□□ 0.58
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 BMP2KLQ5H9B9 411 aa18.65■□□□□ 0.58
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 METTL24Q5JXM2 366 aa18.65■□□□□ 0.58
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TTC22Q5TAA0 569 aa18.65■□□□□ 0.58
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 AKAP2Q9Y2D5 859 aa18.65■□□□□ 0.58
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TTC41PQ6P2S7 1318 aa18.65■□□□□ 0.58
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MROH5Q6ZUA9 1318 aa18.65■□□□□ 0.58
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 BRIP1Q9BX63 1249 aa18.64■□□□□ 0.57
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CRY2Q49AN0 593 aa18.63■□□□□ 0.57
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
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