RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447950.1

PTPRD-AS1-202, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD-AS1, Length 1,668 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 APLP1P51693 650 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 AOC3Q16853 763 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SP8Q8IXZ3 490 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa18.6■□□□□ 0.57
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 STK31Q9BXU1 1019 aa18.59■□□□□ 0.57
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.57
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GPC2Q8N158 579 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CHMP4AQ9BY43 222 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GJA3Q9Y6H8 435 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NEURL1BA8MQ27 555 aa18.54■□□□□ 0.56
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GPSM2P81274 684 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HACL1Q9UJ83 578 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CDHR2Q9BYE9 1310 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IQCA1LA6NCM1 817 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PDE8AO60658 829 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CHADLQ6NUI6 762 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 EPHX2P34913 555 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SCNN1DP51172 638 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KIAA2012Q0VF49 1180 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SUPT20HQ8NEM7 779 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MYH16Q9H6N6 1097 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNRF3Q9ULT6 936 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CCDC152Q4G0S7 254 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GCKRQ14397 625 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RIMBP2O15034 1052 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RAD17O75943 681 aa18.47■□□□□ 0.55
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GREM2Q9H772 168 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PASKQ96RG2 1323 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRPM7Q96QT4 1865 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TBC1D16Q8TBP0 767 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KLRG1Q96E93 195 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DBNDD1Q9H9R9 158 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SHTN1A0MZ66 631 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C6orf229H3BNL8 230 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 WASHC4Q2M389 1173 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CIAPIN1Q6FI81 312 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LINS1Q8NG48 757 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KCNQ5Q9NR82 932 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CLEC11AQ9Y240 323 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DOK7Q18PE1 504 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BEND3Q5T5X7 828 aa18.44■□□□□ 0.54
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