RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443090.1

GCSHP5-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 5, humanhuman

BASIC

Gene GCSHP5, Length 522 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP5-201ENST00000443090 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.97■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 GRAPQ13588 217 aa25.97■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 DUOX1Q9NRD9 1551 aa25.97■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP25.96■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa25.96■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 MPNDQ8N594 471 aa25.96■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 PLBD2Q8NHP8 589 aa25.96■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.95■■□□□ 1.74
GCSHP5-201ENST00000443090 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.94■■□□□ 1.74
GCSHP5-201ENST00000443090 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.94■■□□□ 1.74
GCSHP5-201ENST00000443090 CDHR2Q9BYE9 1310 aa25.93■■□□□ 1.74
GCSHP5-201ENST00000443090 TRAF5O00463 557 aa25.93■■□□□ 1.74
GCSHP5-201ENST00000443090 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
GCSHP5-201ENST00000443090 CST9Q5W186 159 aa25.93■■□□□ 1.74
GCSHP5-201ENST00000443090 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.93■■□□□ 1.74
GCSHP5-201ENST00000443090 TMC4Q7Z404 712 aa25.93■■□□□ 1.74
GCSHP5-201ENST00000443090 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
GCSHP5-201ENST00000443090 CIAPIN1Q6FI81 312 aa25.92■■□□□ 1.74
GCSHP5-201ENST00000443090 CFAP44Q96MT7 982 aa25.92■■□□□ 1.74
GCSHP5-201ENST00000443090 ZNF428Q96B54 188 aa25.91■■□□□ 1.74
GCSHP5-201ENST00000443090 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
GCSHP5-201ENST00000443090 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
GCSHP5-201ENST00000443090 PGAP2Q9UHJ9 254 aa25.9■■□□□ 1.74
GCSHP5-201ENST00000443090 YDJCA8MPS7 323 aa25.89■■□□□ 1.74
GCSHP5-201ENST00000443090 RAD17O75943 681 aa25.89■■□□□ 1.74
GCSHP5-201ENST00000443090 LBX1P52954 281 aa25.89■■□□□ 1.74
GCSHP5-201ENST00000443090 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.89■■□□□ 1.74
GCSHP5-201ENST00000443090 FAM89AQ96GI7 184 aa25.89■■□□□ 1.74
GCSHP5-201ENST00000443090 CAPNS2Q96L46 248 aa25.89■■□□□ 1.74
GCSHP5-201ENST00000443090 HYPKQ9NX55 129 aa25.89■■□□□ 1.74
GCSHP5-201ENST00000443090 COL4A1P02462 1669 aa25.89■■□□□ 1.73
GCSHP5-201ENST00000443090 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.88■■□□□ 1.73
GCSHP5-201ENST00000443090 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
GCSHP5-201ENST00000443090 TNIP1Q15025 636 aa25.88■■□□□ 1.73
GCSHP5-201ENST00000443090 MBIPQ9NS73 344 aa25.88■■□□□ 1.73
GCSHP5-201ENST00000443090 TLL2Q9Y6L7 1015 aa25.88■■□□□ 1.73
GCSHP5-201ENST00000443090 ZNF853P0CG23 659 aa25.87■■□□□ 1.73
GCSHP5-201ENST00000443090 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
GCSHP5-201ENST00000443090 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
GCSHP5-201ENST00000443090 ECE1P42892 770 aa25.86■■□□□ 1.73
GCSHP5-201ENST00000443090 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
GCSHP5-201ENST00000443090 CYP4F22Q6NT55 531 aa25.85■■□□□ 1.73
GCSHP5-201ENST00000443090 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
GCSHP5-201ENST00000443090 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.85■■□□□ 1.73
GCSHP5-201ENST00000443090 TRPM4Q8TD43 1214 aa25.84■■□□□ 1.73
GCSHP5-201ENST00000443090 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
GCSHP5-201ENST00000443090 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
GCSHP5-201ENST00000443090 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
GCSHP5-201ENST00000443090 SHTN1A0MZ66 631 aa25.82■■□□□ 1.72
GCSHP5-201ENST00000443090 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
GCSHP5-201ENST00000443090 CELF2O95319 508 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
GCSHP5-201ENST00000443090 WASHC4Q2M389 1173 aa25.82■■□□□ 1.72
GCSHP5-201ENST00000443090 SAPCD2Q86UD0 394 aa25.82■■□□□ 1.72
GCSHP5-201ENST00000443090 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
GCSHP5-201ENST00000443090 POLLQ9UGP5 575 aa25.82■■□□□ 1.72
GCSHP5-201ENST00000443090 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
GCSHP5-201ENST00000443090 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
GCSHP5-201ENST00000443090 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
GCSHP5-201ENST00000443090 IFT57Q9NWB7 429 aa25.81■■□□□ 1.72
GCSHP5-201ENST00000443090 GPSM2P81274 684 aa25.8■■□□□ 1.72
GCSHP5-201ENST00000443090 MICALL2Q8IY33 904 aa25.8■■□□□ 1.72
GCSHP5-201ENST00000443090 DPF2Q92785 391 aa25.8■■□□□ 1.72
GCSHP5-201ENST00000443090 HHIPL1Q96JK4 782 aa25.8■■□□□ 1.72
GCSHP5-201ENST00000443090 H7C1D1 291 aa25.79■■□□□ 1.72
GCSHP5-201ENST00000443090 PSMD14O00487 310 aa25.79■■□□□ 1.72
GCSHP5-201ENST00000443090 APAF1O14727 1248 aa25.79■■□□□ 1.72
GCSHP5-201ENST00000443090 GRM1Q13255 1194 aa25.79■■□□□ 1.72
GCSHP5-201ENST00000443090 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
GCSHP5-201ENST00000443090 DBNDD1Q9H9R9 158 aa25.79■■□□□ 1.72
GCSHP5-201ENST00000443090 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
GCSHP5-201ENST00000443090 MAP2K2P36507 400 aa25.78■■□□□ 1.72
GCSHP5-201ENST00000443090 RPS8P62241 208 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
GCSHP5-201ENST00000443090 GNAI1P63096 354 aa25.78■■□□□ 1.72
GCSHP5-201ENST00000443090 GOLGA2Q08379 1002 aa25.78■■□□□ 1.72
GCSHP5-201ENST00000443090 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.78■■□□□ 1.72
GCSHP5-201ENST00000443090 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.78■■□□□ 1.72
GCSHP5-201ENST00000443090 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
GCSHP5-201ENST00000443090 C6orf229H3BNL8 230 aa25.77■■□□□ 1.72
GCSHP5-201ENST00000443090 AOC2O75106 756 aa25.77■■□□□ 1.72
GCSHP5-201ENST00000443090 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
GCSHP5-201ENST00000443090 RTL9Q8NET4 1388 aa25.77■■□□□ 1.72
GCSHP5-201ENST00000443090 RIMBP2O15034 1052 aa25.76■■□□□ 1.71
GCSHP5-201ENST00000443090 TBC1D16Q8TBP0 767 aa25.76■■□□□ 1.71
GCSHP5-201ENST00000443090 EYA3Q99504 573 aa25.76■■□□□ 1.71
GCSHP5-201ENST00000443090 BEGAINQ9BUH8 593 aa25.76■■□□□ 1.71
GCSHP5-201ENST00000443090 SCN9AQ15858 1988 aa25.75■■□□□ 1.71
GCSHP5-201ENST00000443090 ECE2O60344 883 aa25.75■■□□□ 1.71
GCSHP5-201ENST00000443090 RPS12P25398 132 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
GCSHP5-201ENST00000443090 PODXL2Q9NZ53 605 aa25.75■■□□□ 1.71
GCSHP5-201ENST00000443090 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
GCSHP5-201ENST00000443090 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
GCSHP5-201ENST00000443090 SAMD7Q7Z3H4 446 aa25.74■■□□□ 1.71
GCSHP5-201ENST00000443090 CCDC191Q8NCU4 936 aa25.74■■□□□ 1.71
GCSHP5-201ENST00000443090 MYD88Q99836 296 aa25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms