RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428075.5

TRIOBP-209, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene TRIOBP, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-209ENST00000428075 CCDC30Q5VVM6 783 aa36.07■■■■□ 3.36
TRIOBP-209ENST00000428075 GJA3Q9Y6H8 435 aa36.07■■■■□ 3.36
TRIOBP-209ENST00000428075 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
TRIOBP-209ENST00000428075 MPNDQ8N594 471 aa36.06■■■■□ 3.36
TRIOBP-209ENST00000428075 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
TRIOBP-209ENST00000428075 MYD88Q99836 296 aa36.06■■■■□ 3.36
TRIOBP-209ENST00000428075 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
TRIOBP-209ENST00000428075 VPS33BQ9H267 617 aa36.06■■■■□ 3.36
TRIOBP-209ENST00000428075 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
TRIOBP-209ENST00000428075 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
TRIOBP-209ENST00000428075 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
TRIOBP-209ENST00000428075 NIM1KQ8IY84 436 aa36.05■■■■□ 3.36
TRIOBP-209ENST00000428075 PASKQ96RG2 1323 aa36.05■■■■□ 3.36
TRIOBP-209ENST00000428075 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
TRIOBP-209ENST00000428075 SCNN1DP51172 638 aa36.04■■■■□ 3.36
TRIOBP-209ENST00000428075 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
TRIOBP-209ENST00000428075 DUOX1Q9NRD9 1551 aa36.04■■■■□ 3.36
TRIOBP-209ENST00000428075 PCNTO95613 3336 aa36.04■■■■□ 3.36
TRIOBP-209ENST00000428075 LRRC37AA6NMS7 1700 aa36.03■■■■□ 3.36
TRIOBP-209ENST00000428075 IL16Q14005 1332 aa36.03■■■■□ 3.36
TRIOBP-209ENST00000428075 SUPT20HQ8NEM7 779 aa36.02■■■■□ 3.36
TRIOBP-209ENST00000428075 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
TRIOBP-209ENST00000428075 KIAA2012Q0VF49 1180 aa36.01■■■■□ 3.36
TRIOBP-209ENST00000428075 EPS15P42566 896 aa36■■■■□ 3.35
TRIOBP-209ENST00000428075 TMC4Q7Z404 712 aa36■■■■□ 3.35
TRIOBP-209ENST00000428075 CCDC191Q8NCU4 936 aa36■■■■□ 3.35
TRIOBP-209ENST00000428075 CXCL9Q07325 125 aa35.99■■■■□ 3.35
TRIOBP-209ENST00000428075 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
TRIOBP-209ENST00000428075 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNRF3Q9ULT6 936 aa35.99■■■■□ 3.35
TRIOBP-209ENST00000428075 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP35.98■■■■□ 3.35
TRIOBP-209ENST00000428075 CHMP4AQ9BY43 222 aa35.98■■■■□ 3.35
TRIOBP-209ENST00000428075 CREBZFQ9NS37 354 aa35.98■■■■□ 3.35
TRIOBP-209ENST00000428075 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa35.98■■■■□ 3.35
TRIOBP-209ENST00000428075 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
TRIOBP-209ENST00000428075 G2E3Q7L622 706 aa35.97■■■■□ 3.35
TRIOBP-209ENST00000428075 CLEC11AQ9Y240 323 aa35.97■■■■□ 3.35
TRIOBP-209ENST00000428075 DDX58O95786 925 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
TRIOBP-209ENST00000428075 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
TRIOBP-209ENST00000428075 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
TRIOBP-209ENST00000428075 PI4KAP2A4QPH2 592 aa35.95■■■■□ 3.35
TRIOBP-209ENST00000428075 IGKV5-2P06315 115 aa35.95■■■■□ 3.35
TRIOBP-209ENST00000428075 KSR2Q6VAB6 950 aa35.95■■■■□ 3.35
TRIOBP-209ENST00000428075 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa35.95■■■■□ 3.35
TRIOBP-209ENST00000428075 SEC31BQ9NQW1 1179 aa35.95■■■■□ 3.35
TRIOBP-209ENST00000428075 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
TRIOBP-209ENST00000428075 FANCIQ9NVI1 1328 aa35.94■■■■□ 3.34
TRIOBP-209ENST00000428075 YDJCA8MPS7 323 aa35.93■■■■□ 3.34
TRIOBP-209ENST00000428075 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
TRIOBP-209ENST00000428075 RPS8P62241 208 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
TRIOBP-209ENST00000428075 GPSM2P81274 684 aa35.93■■■■□ 3.34
TRIOBP-209ENST00000428075 CNTROBQ8N137 903 aa35.93■■■■□ 3.34
TRIOBP-209ENST00000428075 STK31Q9BXU1 1019 aa35.92■■■■□ 3.34
TRIOBP-209ENST00000428075 POLLQ9UGP5 575 aa35.92■■■■□ 3.34
TRIOBP-209ENST00000428075 WDR63Q8IWG1 891 aa35.91■■■■□ 3.34
TRIOBP-209ENST00000428075 GPRC5DQ9NZD1 345 aa35.91■■■■□ 3.34
TRIOBP-209ENST00000428075 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
TRIOBP-209ENST00000428075 PDE8AO60658 829 aa35.9■■■■□ 3.34
TRIOBP-209ENST00000428075 SLC4A2P04920 1241 aa35.9■■■■□ 3.34
TRIOBP-209ENST00000428075 RAD17O75943 681 aa35.89■■■■□ 3.34
TRIOBP-209ENST00000428075 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
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TRIOBP-209ENST00000428075 CIAPIN1Q6FI81 312 aa35.88■■■■□ 3.33
TRIOBP-209ENST00000428075 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
TRIOBP-209ENST00000428075 CDHR2Q9BYE9 1310 aa35.86■■■■□ 3.33
TRIOBP-209ENST00000428075 VAMP4O75379 141 aa35.86■■■■□ 3.33
TRIOBP-209ENST00000428075 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
TRIOBP-209ENST00000428075 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
TRIOBP-209ENST00000428075 IFFO2Q5TF58 517 aa35.86■■■■□ 3.33
TRIOBP-209ENST00000428075 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
TRIOBP-209ENST00000428075 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
TRIOBP-209ENST00000428075 TMEM88BA6NKF7 163 aa35.85■■■■□ 3.33
TRIOBP-209ENST00000428075 WASHC4Q2M389 1173 aa35.85■■■■□ 3.33
TRIOBP-209ENST00000428075 CCDC152Q4G0S7 254 aa35.85■■■■□ 3.33
TRIOBP-209ENST00000428075 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP35.85■■■■□ 3.33
TRIOBP-209ENST00000428075 NEURL1BA8MQ27 555 aa35.84■■■■□ 3.33
TRIOBP-209ENST00000428075 TBC1D16Q8TBP0 767 aa35.84■■■■□ 3.33
TRIOBP-209ENST00000428075 CNTNAP1P78357 1384 aa35.84■■■■□ 3.33
TRIOBP-209ENST00000428075 C6orf229H3BNL8 230 aa35.83■■■■□ 3.33
TRIOBP-209ENST00000428075 RIMBP2O15034 1052 aa35.83■■■■□ 3.33
TRIOBP-209ENST00000428075 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
TRIOBP-209ENST00000428075 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP35.83■■■■□ 3.33
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TRIOBP-209ENST00000428075 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
TRIOBP-209ENST00000428075 FLIIQ13045 1269 aa35.82■■■■□ 3.32
TRIOBP-209ENST00000428075 TNIP1Q15025 636 aa35.82■■■■□ 3.32
TRIOBP-209ENST00000428075 DBNDD1Q9H9R9 158 aa35.82■■■■□ 3.32
TRIOBP-209ENST00000428075 PODXL2Q9NZ53 605 aa35.82■■■■□ 3.32
TRIOBP-209ENST00000428075 SHTN1A0MZ66 631 aa35.81■■■■□ 3.32
TRIOBP-209ENST00000428075 CTSWP56202 376 aa35.8■■■■□ 3.32
TRIOBP-209ENST00000428075 KCNQ5Q9NR82 932 aa35.8■■■■□ 3.32
TRIOBP-209ENST00000428075 NEXNQ0ZGT2 675 aa35.79■■■■□ 3.32
TRIOBP-209ENST00000428075 TTLL11Q8NHH1 800 aa35.79■■■■□ 3.32
TRIOBP-209ENST00000428075 H7C1W4 665 aa35.78■■■■□ 3.32
TRIOBP-209ENST00000428075 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
TRIOBP-209ENST00000428075 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
TRIOBP-209ENST00000428075 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
TRIOBP-209ENST00000428075 DOK7Q18PE1 504 aa35.78■■■■□ 3.32
TRIOBP-209ENST00000428075 PSMD14O00487 310 aa35.77■■■■□ 3.32
TRIOBP-209ENST00000428075 BCL2L13Q9BXK5 485 aa35.77■■■■□ 3.32
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