RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 PDE8AO60658 829 aa31.82■■■□□ 2.68
HTATSF1-202ENST00000425695 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa31.82■■■□□ 2.68
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC4A10Q6U841 1118 aa31.81■■■□□ 2.68
HTATSF1-202ENST00000425695 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa31.81■■■□□ 2.68
HTATSF1-202ENST00000425695 CDHR2Q9BYE9 1310 aa31.8■■■□□ 2.68
HTATSF1-202ENST00000425695 H7C1W4 665 aa31.8■■■□□ 2.68
HTATSF1-202ENST00000425695 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
HTATSF1-202ENST00000425695 BEND3Q5T5X7 828 aa31.79■■■□□ 2.68
HTATSF1-202ENST00000425695 SP8Q8IXZ3 490 aa31.78■■■□□ 2.68
HTATSF1-202ENST00000425695 SEC31BQ9NQW1 1179 aa31.78■■■□□ 2.68
HTATSF1-202ENST00000425695 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC152Q4G0S7 254 aa31.77■■■□□ 2.68
HTATSF1-202ENST00000425695 PSMD1Q99460 953 aa31.77■■■□□ 2.68
HTATSF1-202ENST00000425695 SMC4Q9NTJ3 1288 aa31.77■■■□□ 2.68
HTATSF1-202ENST00000425695 SNED1Q8TER0 1413 aa31.76■■■□□ 2.68
HTATSF1-202ENST00000425695 ALDH1L2Q3SY69 923 aa31.76■■■□□ 2.67
HTATSF1-202ENST00000425695 NMRK2Q9NPI5 230 aa31.76■■■□□ 2.67
HTATSF1-202ENST00000425695 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
HTATSF1-202ENST00000425695 TIAM2Q8IVF5 1701 aa31.75■■■□□ 2.67
HTATSF1-202ENST00000425695 IARSP41252 1262 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
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HTATSF1-202ENST00000425695 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP31.74■■■□□ 2.67
HTATSF1-202ENST00000425695 CTSWP56202 376 aa31.74■■■□□ 2.67
HTATSF1-202ENST00000425695 RPS8P62241 208 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
HTATSF1-202ENST00000425695 COL4A1P02462 1669 aa31.73■■■□□ 2.67
HTATSF1-202ENST00000425695 CASP7P55210 303 aa31.73■■■□□ 2.67
HTATSF1-202ENST00000425695 GLTPD2A6NH11 291 aa31.72■■■□□ 2.67
HTATSF1-202ENST00000425695 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
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HTATSF1-202ENST00000425695 MPNDQ8N594 471 aa31.72■■■□□ 2.67
HTATSF1-202ENST00000425695 TTLL11Q8NHH1 800 aa31.72■■■□□ 2.67
HTATSF1-202ENST00000425695 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa31.72■■■□□ 2.67
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HTATSF1-202ENST00000425695 RRAGCQ9HB90 399 aa31.71■■■□□ 2.67
HTATSF1-202ENST00000425695 DPY19L2Q6NUT2 758 aa31.7■■■□□ 2.67
HTATSF1-202ENST00000425695 KIF3CO14782 793 aa31.69■■■□□ 2.66
HTATSF1-202ENST00000425695 ALDH1L1O75891 902 aa31.69■■■□□ 2.66
HTATSF1-202ENST00000425695 GREM2Q9H772 168 aa31.69■■■□□ 2.66
HTATSF1-202ENST00000425695 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP31.69■■■□□ 2.66
HTATSF1-202ENST00000425695 MYH3P11055 1940 aa31.69■■■□□ 2.66
HTATSF1-202ENST00000425695 LARGE2Q8N3Y3 721 aa31.68■■■□□ 2.66
HTATSF1-202ENST00000425695 RARSP54136 660 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
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HTATSF1-202ENST00000425695 PLA2G12BQ9BX93 195 aa31.67■■■□□ 2.66
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HTATSF1-202ENST00000425695 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
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HTATSF1-202ENST00000425695 PPIP5K2O43314 1243 aa31.66■■■□□ 2.66
HTATSF1-202ENST00000425695 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa31.66■■■□□ 2.66
HTATSF1-202ENST00000425695 SUPT20HQ8NEM7 779 aa31.66■■■□□ 2.66
HTATSF1-202ENST00000425695 DDNO94850 711 aaPredicted RBP31.65■■■□□ 2.66
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HTATSF1-202ENST00000425695 AOC3Q16853 763 aa31.65■■■□□ 2.66
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HTATSF1-202ENST00000425695 COL4A5P29400 1685 aa31.62■■■□□ 2.65
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM161AQ3B820 660 aa31.62■■■□□ 2.65
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF541Q9H0D2 1346 aa31.62■■■□□ 2.65
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HTATSF1-202ENST00000425695 C6orf229H3BNL8 230 aa31.61■■■□□ 2.65
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HTATSF1-202ENST00000425695 CSF1RP07333 972 aa31.61■■■□□ 2.65
HTATSF1-202ENST00000425695 FOXO4P98177 505 aa31.61■■■□□ 2.65
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HTATSF1-202ENST00000425695 CHMP3Q9Y3E7 222 aa31.61■■■□□ 2.65
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HTATSF1-202ENST00000425695 EPHA10Q5JZY3 1008 aa31.6■■■□□ 2.65
HTATSF1-202ENST00000425695 RTL9Q8NET4 1388 aa31.59■■■□□ 2.65
HTATSF1-202ENST00000425695 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
HTATSF1-202ENST00000425695 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
HTATSF1-202ENST00000425695 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
HTATSF1-202ENST00000425695 VPS33BQ9H267 617 aa31.59■■■□□ 2.65
HTATSF1-202ENST00000425695 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa31.59■■■□□ 2.65
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HTATSF1-202ENST00000425695 RIMBP2O15034 1052 aa31.58■■■□□ 2.65
HTATSF1-202ENST00000425695 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP31.58■■■□□ 2.65
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HTATSF1-202ENST00000425695 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP31.58■■■□□ 2.65
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HTATSF1-202ENST00000425695 BCAR3O75815 825 aa31.57■■■□□ 2.64
HTATSF1-202ENST00000425695 KIAA2012Q0VF49 1180 aa31.57■■■□□ 2.64
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HTATSF1-202ENST00000425695 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
HTATSF1-202ENST00000425695 GJA3Q9Y6H8 435 aa31.56■■■□□ 2.64
HTATSF1-202ENST00000425695 DUOX1Q9NRD9 1551 aa31.56■■■□□ 2.64
HTATSF1-202ENST00000425695 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa31.55■■■□□ 2.64
HTATSF1-202ENST00000425695 TOMM70O94826 608 aa31.54■■■□□ 2.64
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HTATSF1-202ENST00000425695 WDR90Q96KV7 1748 aa31.53■■■□□ 2.64
HTATSF1-202ENST00000425695 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
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