RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421046.5

UPP1-206, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene UPP1, Length 974 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-206ENST00000421046 SLC51AQ86UW1 340 aa24.44■■□□□ 1.5
UPP1-206ENST00000421046 SCN4AP35499 1836 aa24.43■■□□□ 1.5
UPP1-206ENST00000421046 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
UPP1-206ENST00000421046 SP8Q8IXZ3 490 aa24.43■■□□□ 1.5
UPP1-206ENST00000421046 IGKV5-2P06315 115 aa24.42■■□□□ 1.5
UPP1-206ENST00000421046 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
UPP1-206ENST00000421046 DDNO94850 711 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
UPP1-206ENST00000421046 TMC4Q7Z404 712 aa24.41■■□□□ 1.5
UPP1-206ENST00000421046 JDP2Q8WYK2 163 aa24.41■■□□□ 1.5
UPP1-206ENST00000421046 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
UPP1-206ENST00000421046 PDE8AO60658 829 aa24.4■■□□□ 1.5
UPP1-206ENST00000421046 CDHR2Q9BYE9 1310 aa24.39■■□□□ 1.5
UPP1-206ENST00000421046 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.39■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 MPNDQ8N594 471 aa24.39■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 SUPT20HQ8NEM7 779 aa24.39■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.39■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 COL4A1P02462 1669 aa24.39■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 COL4A5P29400 1685 aa24.38■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 POTECB2RU33 542 aa24.38■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 E9PSI1 815 aa24.38■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 FZD9O00144 591 aa24.38■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 HSPA6P17066 643 aa24.38■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 LARGE2Q8N3Y3 721 aa24.38■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 SPEF2Q9C093 1822 aa24.38■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 ZNF541Q9H0D2 1346 aa24.37■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.37■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 VPS33BQ9H267 617 aa24.37■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 PPIP5K2O43314 1243 aa24.36■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 FSTL1Q12841 308 aa24.36■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 EIF6P56537 245 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 SLFN5Q08AF3 891 aa24.35■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 RPS8P62241 208 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 AOC3Q16853 763 aa24.34■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 NIM1KQ8IY84 436 aa24.34■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 SMC1BQ8NDV3 1235 aa24.34■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 LINS1Q8NG48 757 aa24.34■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.34■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 DUOX1Q9NRD9 1551 aa24.33■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 LTBP1Q14766 1721 aa24.33■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 H7C1W4 665 aa24.33■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 GCKRQ14397 625 aa24.33■■□□□ 1.49
UPP1-206ENST00000421046 IQCA1LA6NCM1 817 aa24.32■■□□□ 1.48
UPP1-206ENST00000421046 F6X3S4 739 aa24.32■■□□□ 1.48
UPP1-206ENST00000421046 CTSWP56202 376 aa24.32■■□□□ 1.48
UPP1-206ENST00000421046 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.32■■□□□ 1.48
UPP1-206ENST00000421046 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
UPP1-206ENST00000421046 GPC2Q8N158 579 aa24.31■■□□□ 1.48
UPP1-206ENST00000421046 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
UPP1-206ENST00000421046 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24.3■■□□□ 1.48
UPP1-206ENST00000421046 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.3■■□□□ 1.48
UPP1-206ENST00000421046 MIER1Q8N108 512 aa24.29■■□□□ 1.48
UPP1-206ENST00000421046 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.29■■□□□ 1.48
UPP1-206ENST00000421046 GJA3Q9Y6H8 435 aa24.29■■□□□ 1.48
UPP1-206ENST00000421046 GPSM2P81274 684 aa24.28■■□□□ 1.48
UPP1-206ENST00000421046 BEND3Q5T5X7 828 aa24.28■■□□□ 1.48
UPP1-206ENST00000421046 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.28■■□□□ 1.48
UPP1-206ENST00000421046 HACL1Q9UJ83 578 aa24.28■■□□□ 1.48
UPP1-206ENST00000421046 APLP1P51693 650 aa24.27■■□□□ 1.48
UPP1-206ENST00000421046 CASP7P55210 303 aa24.27■■□□□ 1.48
UPP1-206ENST00000421046 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
UPP1-206ENST00000421046 PLA2G12BQ9BX93 195 aa24.27■■□□□ 1.48
UPP1-206ENST00000421046 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
UPP1-206ENST00000421046 C6orf229H3BNL8 230 aa24.26■■□□□ 1.47
UPP1-206ENST00000421046 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
UPP1-206ENST00000421046 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
UPP1-206ENST00000421046 GREM2Q9H772 168 aa24.26■■□□□ 1.47
UPP1-206ENST00000421046 ZNRF3Q9ULT6 936 aa24.26■■□□□ 1.47
UPP1-206ENST00000421046 RTL9Q8NET4 1388 aa24.26■■□□□ 1.47
UPP1-206ENST00000421046 WASHC4Q2M389 1173 aa24.25■■□□□ 1.47
UPP1-206ENST00000421046 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.25■■□□□ 1.47
UPP1-206ENST00000421046 POLLQ9UGP5 575 aa24.25■■□□□ 1.47
UPP1-206ENST00000421046 EYA3Q99504 573 aa24.24■■□□□ 1.47
UPP1-206ENST00000421046 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.24■■□□□ 1.47
UPP1-206ENST00000421046 POTEIP0CG38 1075 aa24.23■■□□□ 1.47
UPP1-206ENST00000421046 POTEJP0CG39 1038 aa24.23■■□□□ 1.47
UPP1-206ENST00000421046 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
UPP1-206ENST00000421046 EPHX2P34913 555 aa24.23■■□□□ 1.47
UPP1-206ENST00000421046 CHADLQ6NUI6 762 aa24.23■■□□□ 1.47
UPP1-206ENST00000421046 TBC1D16Q8TBP0 767 aa24.23■■□□□ 1.47
UPP1-206ENST00000421046 SSH1Q8WYL5 1049 aa24.23■■□□□ 1.47
UPP1-206ENST00000421046 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.23■■□□□ 1.47
UPP1-206ENST00000421046 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa24.23■■□□□ 1.47
UPP1-206ENST00000421046 RIMBP2O15034 1052 aa24.22■■□□□ 1.47
UPP1-206ENST00000421046 ALDH1L1O75891 902 aa24.22■■□□□ 1.47
UPP1-206ENST00000421046 CXCL9Q07325 125 aa24.22■■□□□ 1.47
UPP1-206ENST00000421046 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
UPP1-206ENST00000421046 PTPRCP08575 1304 aa24.21■■□□□ 1.47
UPP1-206ENST00000421046 CSF1RP07333 972 aa24.21■■□□□ 1.47
UPP1-206ENST00000421046 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.21■■□□□ 1.47
UPP1-206ENST00000421046 CIAPIN1Q6FI81 312 aa24.21■■□□□ 1.47
UPP1-206ENST00000421046 LDHDQ86WU2 507 aa24.21■■□□□ 1.47
UPP1-206ENST00000421046 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24.21■■□□□ 1.47
UPP1-206ENST00000421046 GGA1Q9UJY5 639 aa24.21■■□□□ 1.47
UPP1-206ENST00000421046 XDHP47989 1333 aa24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms