RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418207.1

RPSAP9-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 9, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP9, Length 888 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP9-201ENST00000418207 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
RPSAP9-201ENST00000418207 RTKN2Q8IZC4 609 aa13.23□□□□□ -0.29
RPSAP9-201ENST00000418207 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
RPSAP9-201ENST00000418207 ABCC4O15439 1325 aa13.22□□□□□ -0.29
RPSAP9-201ENST00000418207 LTBP3Q9NS15 1303 aa13.22□□□□□ -0.29
RPSAP9-201ENST00000418207 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa13.22□□□□□ -0.29
RPSAP9-201ENST00000418207 PDE8AO60658 829 aa13.21□□□□□ -0.29
RPSAP9-201ENST00000418207 BBOX1O75936 387 aa13.21□□□□□ -0.29
RPSAP9-201ENST00000418207 PRELPP51888 382 aa13.21□□□□□ -0.29
RPSAP9-201ENST00000418207 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP13.21□□□□□ -0.29
RPSAP9-201ENST00000418207 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
RPSAP9-201ENST00000418207 SLC4A10Q6U841 1118 aa13.21□□□□□ -0.29
RPSAP9-201ENST00000418207 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa13.21□□□□□ -0.29
RPSAP9-201ENST00000418207 LINS1Q8NG48 757 aa13.21□□□□□ -0.29
RPSAP9-201ENST00000418207 SSH1Q8WYL5 1049 aa13.21□□□□□ -0.29
RPSAP9-201ENST00000418207 BCL2L13Q9BXK5 485 aa13.21□□□□□ -0.29
RPSAP9-201ENST00000418207 GRAPQ13588 217 aa13.2□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 GCKRQ14397 625 aa13.2□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 GRIPAP1Q4V328 841 aa13.2□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 SMC4Q9NTJ3 1288 aa13.2□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa13.2□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 KDM2BQ8NHM5 1336 aa13.19□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 CDHR2Q9BYE9 1310 aa13.19□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 SPEF2Q9C093 1822 aa13.19□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 ALDH1L2Q3SY69 923 aa13.19□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 CCDC152Q4G0S7 254 aa13.19□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 H7C1W4 665 aa13.18□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 CTSWP56202 376 aa13.18□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 BEND3Q5T5X7 828 aa13.18□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 TMC4Q7Z404 712 aa13.18□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 SLC51AQ86UW1 340 aa13.18□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 SP8Q8IXZ3 490 aa13.18□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 PSMD1Q99460 953 aa13.18□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 PTPRCP08575 1304 aa13.17□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 RPS8P62241 208 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 DPY19L2Q6NUT2 758 aa13.17□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa13.17□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 SEC31BQ9NQW1 1179 aa13.17□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 IARSP41252 1262 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 MPNDQ8N594 471 aa13.16□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 JDP2Q8WYK2 163 aa13.16□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 NMRK2Q9NPI5 230 aa13.16□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 GLTPD2A6NH11 291 aa13.15□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 GRM8O00222 908 aa13.15□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 ALDH1L1O75891 902 aa13.15□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa13.15□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 LARGE2Q8N3Y3 721 aa13.15□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 SUPT20HQ8NEM7 779 aa13.15□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 TTLL11Q8NHH1 800 aa13.15□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 LRRC37AA6NMS7 1700 aa13.15□□□□□ -0.3
RPSAP9-201ENST00000418207 COL4A1P02462 1669 aa13.15□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 ZBED9Q6R2W3 1325 aa13.14□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 SNED1Q8TER0 1413 aa13.14□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 PPIP5K2O43314 1243 aa13.14□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 RARSP54136 660 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 GREM2Q9H772 168 aa13.14□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 RRAGCQ9HB90 399 aa13.14□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 C6orf229H3BNL8 230 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 CASP7P55210 303 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 AOC3Q16853 763 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 PLA2G12BQ9BX93 195 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 CHMP3Q9Y3E7 222 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 KIF3CO14782 793 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 DDNO94850 711 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 GPSM2P81274 684 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 NIM1KQ8IY84 436 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 RTL9Q8NET4 1388 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 ITGA6P23229 1130 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 EIF6P56537 245 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 C1QTNF8P60827 252 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 FAM161AQ3B820 660 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 VPS33BQ9H267 617 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 KIF16BQ96L93 1317 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 WDR90Q96KV7 1748 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 COL4A5P29400 1685 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 FZD9O00144 591 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 CSF1RP07333 972 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 FOXO4P98177 505 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
RPSAP9-201ENST00000418207 WASHC4Q2M389 1173 aa13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms