RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 RAD17O75943 681 aa25.22■■□□□ 1.63
UBXN4-202ENST00000415164 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
UBXN4-202ENST00000415164 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa25.22■■□□□ 1.63
UBXN4-202ENST00000415164 CIAPIN1Q6FI81 312 aa25.22■■□□□ 1.63
UBXN4-202ENST00000415164 CYP4F22Q6NT55 531 aa25.22■■□□□ 1.63
UBXN4-202ENST00000415164 SP8Q8IXZ3 490 aa25.22■■□□□ 1.63
UBXN4-202ENST00000415164 CAPNS2Q96L46 248 aa25.22■■□□□ 1.63
UBXN4-202ENST00000415164 VPS33BQ9H267 617 aa25.22■■□□□ 1.63
UBXN4-202ENST00000415164 GRAPQ13588 217 aa25.21■■□□□ 1.63
UBXN4-202ENST00000415164 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
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UBXN4-202ENST00000415164 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
UBXN4-202ENST00000415164 ECE1P42892 770 aa25.2■■□□□ 1.62
UBXN4-202ENST00000415164 BEGAINQ9BUH8 593 aa25.2■■□□□ 1.62
UBXN4-202ENST00000415164 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF408Q9H9D4 720 aa25.2■■□□□ 1.62
UBXN4-202ENST00000415164 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
UBXN4-202ENST00000415164 CHL1O00533 1208 aa25.18■■□□□ 1.62
UBXN4-202ENST00000415164 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.18■■□□□ 1.62
UBXN4-202ENST00000415164 CST9Q5W186 159 aa25.18■■□□□ 1.62
UBXN4-202ENST00000415164 RUNDC1Q96C34 613 aa25.18■■□□□ 1.62
UBXN4-202ENST00000415164 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.17■■□□□ 1.62
UBXN4-202ENST00000415164 CELF2O95319 508 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
UBXN4-202ENST00000415164 TNIP1Q15025 636 aa25.17■■□□□ 1.62
UBXN4-202ENST00000415164 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
UBXN4-202ENST00000415164 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
UBXN4-202ENST00000415164 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa25.17■■□□□ 1.62
UBXN4-202ENST00000415164 FAM89AQ96GI7 184 aa25.16■■□□□ 1.62
UBXN4-202ENST00000415164 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.16■■□□□ 1.62
UBXN4-202ENST00000415164 TLL2Q9Y6L7 1015 aa25.16■■□□□ 1.62
UBXN4-202ENST00000415164 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.15■■□□□ 1.62
UBXN4-202ENST00000415164 PLBD2Q8NHP8 589 aa25.15■■□□□ 1.62
UBXN4-202ENST00000415164 LAMB2P55268 1798 aa25.15■■□□□ 1.62
UBXN4-202ENST00000415164 RIMBP2O15034 1052 aa25.14■■□□□ 1.62
UBXN4-202ENST00000415164 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
UBXN4-202ENST00000415164 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
UBXN4-202ENST00000415164 SHTN1A0MZ66 631 aa25.13■■□□□ 1.61
UBXN4-202ENST00000415164 C6orf229H3BNL8 230 aa25.13■■□□□ 1.61
UBXN4-202ENST00000415164 AOC2O75106 756 aa25.13■■□□□ 1.61
UBXN4-202ENST00000415164 TRPM4Q8TD43 1214 aa25.13■■□□□ 1.61
UBXN4-202ENST00000415164 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
UBXN4-202ENST00000415164 TSKSQ9UJT2 592 aa25.13■■□□□ 1.61
UBXN4-202ENST00000415164 YDJCA8MPS7 323 aa25.12■■□□□ 1.61
UBXN4-202ENST00000415164 H7C1D1 291 aa25.12■■□□□ 1.61
UBXN4-202ENST00000415164 TMC4Q7Z404 712 aa25.12■■□□□ 1.61
UBXN4-202ENST00000415164 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
UBXN4-202ENST00000415164 DBNDD1Q9H9R9 158 aa25.12■■□□□ 1.61
UBXN4-202ENST00000415164 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.12■■□□□ 1.61
UBXN4-202ENST00000415164 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
UBXN4-202ENST00000415164 WASHC4Q2M389 1173 aa25.11■■□□□ 1.61
UBXN4-202ENST00000415164 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.11■■□□□ 1.61
UBXN4-202ENST00000415164 MICALL2Q8IY33 904 aa25.11■■□□□ 1.61
UBXN4-202ENST00000415164 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
UBXN4-202ENST00000415164 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.1■■□□□ 1.61
UBXN4-202ENST00000415164 HYPKQ9NX55 129 aa25.1■■□□□ 1.61
UBXN4-202ENST00000415164 CDHR2Q9BYE9 1310 aa25.1■■□□□ 1.61
UBXN4-202ENST00000415164 TAF1P21675 1872 aa25.09■■□□□ 1.61
UBXN4-202ENST00000415164 HOXB7P09629 217 aa25.09■■□□□ 1.61
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UBXN4-202ENST00000415164 SAPCD2Q86UD0 394 aa25.09■■□□□ 1.61
UBXN4-202ENST00000415164 PSMD14O00487 310 aa25.08■■□□□ 1.61
UBXN4-202ENST00000415164 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
UBXN4-202ENST00000415164 GPSM2P81274 684 aa25.08■■□□□ 1.61
UBXN4-202ENST00000415164 DOK7Q18PE1 504 aa25.08■■□□□ 1.61
UBXN4-202ENST00000415164 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.08■■□□□ 1.61
UBXN4-202ENST00000415164 ABHD8Q96I13 439 aa25.08■■□□□ 1.61
UBXN4-202ENST00000415164 MBIPQ9NS73 344 aa25.08■■□□□ 1.61
UBXN4-202ENST00000415164 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.08■■□□□ 1.61
UBXN4-202ENST00000415164 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
UBXN4-202ENST00000415164 GOLGA2Q08379 1002 aa25.07■■□□□ 1.6
UBXN4-202ENST00000415164 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
UBXN4-202ENST00000415164 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
UBXN4-202ENST00000415164 USP48Q86UV5 1035 aa25.07■■□□□ 1.6
UBXN4-202ENST00000415164 CFAP44Q96MT7 982 aa25.07■■□□□ 1.6
UBXN4-202ENST00000415164 DUOX1Q9NRD9 1551 aa25.06■■□□□ 1.6
UBXN4-202ENST00000415164 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
UBXN4-202ENST00000415164 SAMD7Q7Z3H4 446 aa25.06■■□□□ 1.6
UBXN4-202ENST00000415164 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
UBXN4-202ENST00000415164 DLK2Q6UY11 383 aa25.05■■□□□ 1.6
UBXN4-202ENST00000415164 EYA3Q99504 573 aa25.05■■□□□ 1.6
UBXN4-202ENST00000415164 POLLQ9UGP5 575 aa25.05■■□□□ 1.6
UBXN4-202ENST00000415164 PGAP2Q9UHJ9 254 aa25.05■■□□□ 1.6
UBXN4-202ENST00000415164 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
UBXN4-202ENST00000415164 G3V3G9 751 aa25.04■■□□□ 1.6
UBXN4-202ENST00000415164 ECE2O60344 883 aa25.04■■□□□ 1.6
UBXN4-202ENST00000415164 MAP2K2P36507 400 aa25.04■■□□□ 1.6
UBXN4-202ENST00000415164 DCAF8Q5TAQ9 597 aa25.04■■□□□ 1.6
UBXN4-202ENST00000415164 MYD88Q99836 296 aa25.04■■□□□ 1.6
UBXN4-202ENST00000415164 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
UBXN4-202ENST00000415164 THSD7BQ9C0I4 1608 aa25.03■■□□□ 1.6
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC85CA6NKD9 419 aa25.02■■□□□ 1.6
UBXN4-202ENST00000415164 RPS8P62241 208 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
UBXN4-202ENST00000415164 KCNQ5Q9NR82 932 aa25.02■■□□□ 1.6
UBXN4-202ENST00000415164 HUNKP57058 714 aa25.01■■□□□ 1.59
UBXN4-202ENST00000415164 TBC1D16Q8TBP0 767 aa25.01■■□□□ 1.59
UBXN4-202ENST00000415164 DPF2Q92785 391 aa25.01■■□□□ 1.59
UBXN4-202ENST00000415164 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
UBXN4-202ENST00000415164 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.01■■□□□ 1.59
UBXN4-202ENST00000415164 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.01■■□□□ 1.59
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