RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413409.6

PTPRC-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,338 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-206ENST00000413409 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PTPRC-206ENST00000413409 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PTPRC-206ENST00000413409 TRPM7Q96QT4 1865 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRC-206ENST00000413409 SNED1Q8TER0 1413 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRC-206ENST00000413409 SAPCD2Q86UD0 394 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRC-206ENST00000413409 HEG1Q9ULI3 1381 aa21.58■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 SOX10P56693 466 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 DCTN1Q14203 1278 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 CIAPIN1Q6FI81 312 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 TSPYL6Q8N831 410 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 IGHDP01880 384 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 PDE4AP27815 886 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 ZIC5Q96T25 663 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 BACH2Q9BYV9 841 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 MCM10Q7L590 875 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 JDP2Q8WYK2 163 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 ABCC4O15439 1325 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 EIF6P56537 245 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF790Q6PG37 636 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 PSMD1Q99460 953 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 BCORQ6W2J9 1755 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 CELF2O95319 508 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRC-206ENST00000413409 SLC51AQ86UW1 340 aa21.52■■□□□ 1.03
PTPRC-206ENST00000413409 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRC-206ENST00000413409 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PTPRC-206ENST00000413409 HHIPL1Q96JK4 782 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRC-206ENST00000413409 ALDH1B1P30837 517 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRC-206ENST00000413409 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRC-206ENST00000413409 IL17REQ8NFR9 667 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRC-206ENST00000413409 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PTPRC-206ENST00000413409 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRC-206ENST00000413409 KCNQ3O43525 872 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRC-206ENST00000413409 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PTPRC-206ENST00000413409 FAM177BA6PVY3 158 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRC-206ENST00000413409 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRC-206ENST00000413409 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRC-206ENST00000413409 SKAP1Q86WV1 359 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRC-206ENST00000413409 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRC-206ENST00000413409 USP16Q9Y5T5 823 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRC-206ENST00000413409 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRC-206ENST00000413409 LARGE2Q8N3Y3 721 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRC-206ENST00000413409 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRC-206ENST00000413409 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PTPRC-206ENST00000413409 GPRC5DQ9NZD1 345 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRC-206ENST00000413409 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
PTPRC-206ENST00000413409 PTPRCP08575 1304 aa21.45■■□□□ 1.03
PTPRC-206ENST00000413409 PGAP2Q9UHJ9 254 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRC-206ENST00000413409 KDM3BQ7LBC6 1761 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRC-206ENST00000413409 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRC-206ENST00000413409 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PTPRC-206ENST00000413409 TEFQ10587 303 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRC-206ENST00000413409 NOGQ13253 232 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRC-206ENST00000413409 CRY2Q49AN0 593 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRC-206ENST00000413409 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PTPRC-206ENST00000413409 RGS3P49796 1198 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRC-206ENST00000413409 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRC-206ENST00000413409 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRC-206ENST00000413409 DLK2Q6UY11 383 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRC-206ENST00000413409 CACNA1FO60840 1977 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRC-206ENST00000413409 ABCC12Q96J65 1359 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRC-206ENST00000413409 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PTPRC-206ENST00000413409 NBPF26B4DH59 902 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRC-206ENST00000413409 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PTPRC-206ENST00000413409 HLFQ16534 295 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRC-206ENST00000413409 C8orf34Q49A92 452 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRC-206ENST00000413409 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PTPRC-206ENST00000413409 SMC5Q8IY18 1101 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRC-206ENST00000413409 NBPF15Q8N660 670 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRC-206ENST00000413409 CXCL9Q07325 125 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRC-206ENST00000413409 KRT24Q2M2I5 525 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRC-206ENST00000413409 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PTPRC-206ENST00000413409 NIM1KQ8IY84 436 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRC-206ENST00000413409 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PTPRC-206ENST00000413409 HUNKP57058 714 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRC-206ENST00000413409 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PTPRC-206ENST00000413409 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRC-206ENST00000413409 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PTPRC-206ENST00000413409 RNF186Q9NXI6 227 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRC-206ENST00000413409 RGL2O15211 777 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRC-206ENST00000413409 PPIP5K2O43314 1243 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRC-206ENST00000413409 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
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