RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395436.6

SUMF2-204, Transcript of sulfatase modifying factor 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUMF2, Length 1,683 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF2-204ENST00000395436 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.631e-13■■□□□ 13.2
SUMF2-204ENST00000395436 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SUMF2-204ENST00000395436 TTC22Q5TAA0 569 aa25.26■■□□□ 1.63
SUMF2-204ENST00000395436 AKT1S1Q96B36 256 aa25.26■■□□□ 1.63
SUMF2-204ENST00000395436 NYXQ9GZU5 481 aa25.26■■□□□ 1.63
SUMF2-204ENST00000395436 STAP2Q9UGK3 403 aa25.26■■□□□ 1.63
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SUMF2-204ENST00000395436 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
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SUMF2-204ENST00000395436 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
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SUMF2-204ENST00000395436 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
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SUMF2-204ENST00000395436 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.19■■□□□ 1.62
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SUMF2-204ENST00000395436 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa25.16■■□□□ 1.62
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SUMF2-204ENST00000395436 ECHDC1Q9NTX5 307 aa25.14■■□□□ 1.62
SUMF2-204ENST00000395436 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SUMF2-204ENST00000395436 CEP126Q9P2H0 1117 aa25.13■■□□□ 1.61
SUMF2-204ENST00000395436 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.13■■□□□ 1.61
SUMF2-204ENST00000395436 ERC2O15083 957 aa25.13■■□□□ 1.61
SUMF2-204ENST00000395436 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.12■■□□□ 1.61
SUMF2-204ENST00000395436 NLRP3Q96P20 1036 aa25.12■■□□□ 1.61
SUMF2-204ENST00000395436 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.12■■□□□ 1.61
SUMF2-204ENST00000395436 CDC45O75419 566 aa25.11■■□□□ 1.61
SUMF2-204ENST00000395436 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
SUMF2-204ENST00000395436 CNBD1Q8NA66 436 aa25.11■■□□□ 1.61
SUMF2-204ENST00000395436 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.11■■□□□ 1.61
SUMF2-204ENST00000395436 NPHP1O15259 732 aa25.1■■□□□ 1.61
SUMF2-204ENST00000395436 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.1■■□□□ 1.61
SUMF2-204ENST00000395436 NLGN1Q8N2Q7 840 aa25.1■■□□□ 1.61
SUMF2-204ENST00000395436 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.1■■□□□ 1.61
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SUMF2-204ENST00000395436 MSH5O43196 834 aa25.09■■□□□ 1.61
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SUMF2-204ENST00000395436 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa25.08■■□□□ 1.61
SUMF2-204ENST00000395436 CCDC125Q86Z20 511 aa25.08■■□□□ 1.61
SUMF2-204ENST00000395436 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.08■■□□□ 1.61
SUMF2-204ENST00000395436 PRR5LQ6MZQ0 368 aa25.07■■□□□ 1.6
SUMF2-204ENST00000395436 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SUMF2-204ENST00000395436 MROH5Q6ZUA9 1318 aa25.07■■□□□ 1.6
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