RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.91■■□□□ 1.74
ANKRD39-201ENST00000393537 SP8Q8IXZ3 490 aa25.91■■□□□ 1.74
ANKRD39-201ENST00000393537 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
ANKRD39-201ENST00000393537 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF541Q9H0D2 1346 aa25.89■■□□□ 1.74
ANKRD39-201ENST00000393537 POTECB2RU33 542 aa25.89■■□□□ 1.74
ANKRD39-201ENST00000393537 HSPA6P17066 643 aa25.89■■□□□ 1.74
ANKRD39-201ENST00000393537 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
ANKRD39-201ENST00000393537 JDP2Q8WYK2 163 aa25.89■■□□□ 1.74
ANKRD39-201ENST00000393537 COL4A5P29400 1685 aa25.88■■□□□ 1.73
ANKRD39-201ENST00000393537 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
ANKRD39-201ENST00000393537 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
ANKRD39-201ENST00000393537 COL4A1P02462 1669 aa25.87■■□□□ 1.73
ANKRD39-201ENST00000393537 NEURL1BA8MQ27 555 aa25.87■■□□□ 1.73
ANKRD39-201ENST00000393537 FZD9O00144 591 aa25.87■■□□□ 1.73
ANKRD39-201ENST00000393537 TMC4Q7Z404 712 aa25.87■■□□□ 1.73
ANKRD39-201ENST00000393537 LARGE2Q8N3Y3 721 aa25.87■■□□□ 1.73
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRC37AA6NMS7 1700 aa25.87■■□□□ 1.73
ANKRD39-201ENST00000393537 PDE8AO60658 829 aa25.86■■□□□ 1.73
ANKRD39-201ENST00000393537 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
ANKRD39-201ENST00000393537 MPNDQ8N594 471 aa25.86■■□□□ 1.73
ANKRD39-201ENST00000393537 CDHR2Q9BYE9 1310 aa25.86■■□□□ 1.73
ANKRD39-201ENST00000393537 PPIP5K2O43314 1243 aa25.85■■□□□ 1.73
ANKRD39-201ENST00000393537 SUPT20HQ8NEM7 779 aa25.85■■□□□ 1.73
ANKRD39-201ENST00000393537 DNAAF4Q8WXU2 420 aa25.85■■□□□ 1.73
ANKRD39-201ENST00000393537 FSTL1Q12841 308 aa25.84■■□□□ 1.73
ANKRD39-201ENST00000393537 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
ANKRD39-201ENST00000393537 MYH3P11055 1940 aa25.83■■□□□ 1.73
ANKRD39-201ENST00000393537 AOC3Q16853 763 aa25.83■■□□□ 1.73
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.83■■□□□ 1.73
ANKRD39-201ENST00000393537 NIM1KQ8IY84 436 aa25.83■■□□□ 1.73
ANKRD39-201ENST00000393537 SMC1BQ8NDV3 1235 aa25.83■■□□□ 1.73
ANKRD39-201ENST00000393537 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
ANKRD39-201ENST00000393537 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.83■■□□□ 1.73
ANKRD39-201ENST00000393537 SCN4AP35499 1836 aa25.83■■□□□ 1.73
ANKRD39-201ENST00000393537 E9PSI1 815 aa25.82■■□□□ 1.72
ANKRD39-201ENST00000393537 RPS8P62241 208 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
ANKRD39-201ENST00000393537 EIF6P56537 245 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
ANKRD39-201ENST00000393537 GCKRQ14397 625 aa25.81■■□□□ 1.72
ANKRD39-201ENST00000393537 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa25.81■■□□□ 1.72
ANKRD39-201ENST00000393537 VPS33BQ9H267 617 aa25.81■■□□□ 1.72
ANKRD39-201ENST00000393537 DUOX1Q9NRD9 1551 aa25.81■■□□□ 1.72
ANKRD39-201ENST00000393537 IQCA1LA6NCM1 817 aa25.8■■□□□ 1.72
ANKRD39-201ENST00000393537 F6X3S4 739 aa25.8■■□□□ 1.72
ANKRD39-201ENST00000393537 LINS1Q8NG48 757 aa25.8■■□□□ 1.72
ANKRD39-201ENST00000393537 H7C1W4 665 aa25.79■■□□□ 1.72
ANKRD39-201ENST00000393537 CTSWP56202 376 aa25.79■■□□□ 1.72
ANKRD39-201ENST00000393537 SLFN5Q08AF3 891 aa25.79■■□□□ 1.72
ANKRD39-201ENST00000393537 GPC2Q8N158 579 aa25.79■■□□□ 1.72
ANKRD39-201ENST00000393537 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
ANKRD39-201ENST00000393537 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
ANKRD39-201ENST00000393537 GJA3Q9Y6H8 435 aa25.78■■□□□ 1.72
ANKRD39-201ENST00000393537 APLP1P51693 650 aa25.77■■□□□ 1.72
ANKRD39-201ENST00000393537 GPSM2P81274 684 aa25.77■■□□□ 1.72
ANKRD39-201ENST00000393537 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.77■■□□□ 1.72
ANKRD39-201ENST00000393537 CDCA7LQ96GN5 454 aa25.77■■□□□ 1.72
ANKRD39-201ENST00000393537 TTLL11Q8NHH1 800 aa25.76■■□□□ 1.71
ANKRD39-201ENST00000393537 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
ANKRD39-201ENST00000393537 HACL1Q9UJ83 578 aa25.76■■□□□ 1.71
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNRF3Q9ULT6 936 aa25.76■■□□□ 1.71
ANKRD39-201ENST00000393537 LTBP1Q14766 1721 aa25.76■■□□□ 1.71
ANKRD39-201ENST00000393537 SPEF2Q9C093 1822 aa25.74■■□□□ 1.71
ANKRD39-201ENST00000393537 C6orf229H3BNL8 230 aa25.74■■□□□ 1.71
ANKRD39-201ENST00000393537 POTEIP0CG38 1075 aa25.74■■□□□ 1.71
ANKRD39-201ENST00000393537 POTEJP0CG39 1038 aa25.74■■□□□ 1.71
ANKRD39-201ENST00000393537 CASP7P55210 303 aa25.74■■□□□ 1.71
ANKRD39-201ENST00000393537 BEND3Q5T5X7 828 aa25.74■■□□□ 1.71
ANKRD39-201ENST00000393537 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.74■■□□□ 1.71
ANKRD39-201ENST00000393537 MIER1Q8N108 512 aa25.74■■□□□ 1.71
ANKRD39-201ENST00000393537 GREM2Q9H772 168 aa25.74■■□□□ 1.71
ANKRD39-201ENST00000393537 PLA2G12BQ9BX93 195 aa25.73■■□□□ 1.71
ANKRD39-201ENST00000393537 POLLQ9UGP5 575 aa25.73■■□□□ 1.71
ANKRD39-201ENST00000393537 EPHX2P34913 555 aa25.72■■□□□ 1.71
ANKRD39-201ENST00000393537 CXCL9Q07325 125 aa25.72■■□□□ 1.71
ANKRD39-201ENST00000393537 WASHC4Q2M389 1173 aa25.72■■□□□ 1.71
ANKRD39-201ENST00000393537 CHADLQ6NUI6 762 aa25.72■■□□□ 1.71
ANKRD39-201ENST00000393537 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
ANKRD39-201ENST00000393537 RTL9Q8NET4 1388 aa25.71■■□□□ 1.71
ANKRD39-201ENST00000393537 RIMBP2O15034 1052 aa25.71■■□□□ 1.71
ANKRD39-201ENST00000393537 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
ANKRD39-201ENST00000393537 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
ANKRD39-201ENST00000393537 TBC1D16Q8TBP0 767 aa25.71■■□□□ 1.71
ANKRD39-201ENST00000393537 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.71■■□□□ 1.71
ANKRD39-201ENST00000393537 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.7■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 LDHDQ86WU2 507 aa25.7■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 EYA3Q99504 573 aa25.7■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 PODXL2Q9NZ53 605 aa25.7■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 SCNN1DP51172 638 aa25.69■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 SSH1Q8WYL5 1049 aa25.69■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 YDJCA8MPS7 323 aa25.68■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 RAD17O75943 681 aa25.68■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 UFL1O94874 794 aa25.68■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 HTRA3P83110 453 aa25.68■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 CIAPIN1Q6FI81 312 aa25.68■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa25.67■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM161AQ3B820 660 aa25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms