RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376303.6

SYP-202, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 2

Gene SYP, Length 858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-202ENST00000376303 GOLGA2Q08379 1002 aa22.79■■□□□ 1.24
SYP-202ENST00000376303 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SYP-202ENST00000376303 LTBP1Q14766 1721 aa22.78■■□□□ 1.24
SYP-202ENST00000376303 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SYP-202ENST00000376303 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.78■■□□□ 1.24
SYP-202ENST00000376303 ZNF428Q96B54 188 aa22.78■■□□□ 1.24
SYP-202ENST00000376303 SCNN1DP51172 638 aa22.77■■□□□ 1.24
SYP-202ENST00000376303 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SYP-202ENST00000376303 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.77■■□□□ 1.24
SYP-202ENST00000376303 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.77■■□□□ 1.23
SYP-202ENST00000376303 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.76■■□□□ 1.23
SYP-202ENST00000376303 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.76■■□□□ 1.23
SYP-202ENST00000376303 CNTROBQ8N137 903 aa22.76■■□□□ 1.23
SYP-202ENST00000376303 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.76■■□□□ 1.23
SYP-202ENST00000376303 CCDC184Q52MB2 194 aa22.75■■□□□ 1.23
SYP-202ENST00000376303 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.75■■□□□ 1.23
SYP-202ENST00000376303 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SYP-202ENST00000376303 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SYP-202ENST00000376303 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SYP-202ENST00000376303 EPS15P42566 896 aa22.74■■□□□ 1.23
SYP-202ENST00000376303 CCDC27Q2M243 656 aa22.74■■□□□ 1.23
SYP-202ENST00000376303 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SYP-202ENST00000376303 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SYP-202ENST00000376303 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SYP-202ENST00000376303 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SYP-202ENST00000376303 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SYP-202ENST00000376303 CXCL9Q07325 125 aa22.73■■□□□ 1.23
SYP-202ENST00000376303 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SYP-202ENST00000376303 CNTNAP1P78357 1384 aa22.73■■□□□ 1.23
SYP-202ENST00000376303 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SYP-202ENST00000376303 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.72■■□□□ 1.23
SYP-202ENST00000376303 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SYP-202ENST00000376303 MYD88Q99836 296 aa22.72■■□□□ 1.23
SYP-202ENST00000376303 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.72■■□□□ 1.23
SYP-202ENST00000376303 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.71■■□□□ 1.23
SYP-202ENST00000376303 GPRC5DQ9NZD1 345 aa22.71■■□□□ 1.23
SYP-202ENST00000376303 TNIP1Q15025 636 aa22.7■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 WWC1Q8IX03 1113 aa22.7■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.69■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.69■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 TSPYL6Q8N831 410 aa22.69■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 WASHC4Q2M389 1173 aa22.68■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 CACNA1FO60840 1977 aa22.67■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 RAD17O75943 681 aa22.67■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 IL16Q14005 1332 aa22.66■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 COL4A1P02462 1669 aa22.66■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 ANP32CO43423 234 aa22.66■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.66■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 STK31Q9BXU1 1019 aa22.66■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 MRS2Q9HD23 443 aa22.66■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 RASSF10A6NK89 507 aa22.65■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 YDJCA8MPS7 323 aa22.65■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 C6orf229H3BNL8 230 aa22.65■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 PDE8AO60658 829 aa22.65■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 VEGFBP49765 207 aa22.65■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 GPSM2P81274 684 aa22.65■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.65■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 KSR2Q6VAB6 950 aa22.65■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 EYA3Q99504 573 aa22.65■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.65■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 MYH3P11055 1940 aa22.65■■□□□ 1.22
SYP-202ENST00000376303 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.64■■□□□ 1.21
SYP-202ENST00000376303 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
SYP-202ENST00000376303 POLLQ9UGP5 575 aa22.64■■□□□ 1.21
SYP-202ENST00000376303 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.63■■□□□ 1.21
SYP-202ENST00000376303 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.63■■□□□ 1.21
SYP-202ENST00000376303 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.63■■□□□ 1.21
SYP-202ENST00000376303 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.63■■□□□ 1.21
SYP-202ENST00000376303 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SYP-202ENST00000376303 RIMBP2O15034 1052 aa22.62■■□□□ 1.21
SYP-202ENST00000376303 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.62■■□□□ 1.21
SYP-202ENST00000376303 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.62■■□□□ 1.21
SYP-202ENST00000376303 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SYP-202ENST00000376303 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.61■■□□□ 1.21
SYP-202ENST00000376303 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.61■■□□□ 1.21
SYP-202ENST00000376303 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SYP-202ENST00000376303 H7C1D1 291 aa22.6■■□□□ 1.21
SYP-202ENST00000376303 IGKV5-2P06315 115 aa22.6■■□□□ 1.21
SYP-202ENST00000376303 TNS4Q8IZW8 715 aa22.6■■□□□ 1.21
SYP-202ENST00000376303 DPF2Q92785 391 aa22.6■■□□□ 1.21
SYP-202ENST00000376303 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SYP-202ENST00000376303 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SYP-202ENST00000376303 TRAF5O00463 557 aa22.59■■□□□ 1.21
SYP-202ENST00000376303 PSMD14O00487 310 aa22.59■■□□□ 1.21
SYP-202ENST00000376303 ECE2O60344 883 aa22.59■■□□□ 1.21
SYP-202ENST00000376303 SLC4A2P04920 1241 aa22.59■■□□□ 1.21
SYP-202ENST00000376303 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
SYP-202ENST00000376303 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.59■■□□□ 1.21
SYP-202ENST00000376303 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
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