RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364043.1

SNORD46-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 46, humanhuman

BASIC

Gene SNORD46, Length 104 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD46-201ENST00000364043 PLA2G5P39877 138 aa10.28□□□□□ -0.76
SNORD46-201ENST00000364043 TM4SF4P48230 202 aa10.28□□□□□ -0.76
SNORD46-201ENST00000364043 FKBP1BP68106 108 aa10.28□□□□□ -0.76
SNORD46-201ENST00000364043 Q7L0L9 218 aa10.28□□□□□ -0.76
SNORD46-201ENST00000364043 DEFB123Q8N688 67 aa10.28□□□□□ -0.76
SNORD46-201ENST00000364043 H7C1D1 291 aa10.27□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 AOC3Q16853 763 aa10.27□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 SLC52A2Q9HAB3 445 aa10.27□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 PTPN22Q9Y2R2 807 aa10.27□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 RAD17O75943 681 aa10.26□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 SREBF2Q12772 1141 aa10.26□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 TNIP1Q15025 636 aa10.26□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 CRY2Q49AN0 593 aa10.26□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 ERICH6BQ5W0A0 696 aa10.26□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 TPTE2Q6XPS3 522 aa10.26□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 SAMD7Q7Z3H4 446 aa10.26□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 FAM9BQ8IZU0 186 aa10.26□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 MYCP01106 439 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa10.25□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 CLEC4GQ6UXB4 293 aa10.25□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 MICALL2Q8IY33 904 aa10.25□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 FAM122AQ96E09 287 aa10.25□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 ZNF333Q96JL9 665 aa10.25□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 ZNF609O15014 1411 aa10.24□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 CACNA1AO00555 2505 aa10.24□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 PIEZO1Q92508 2521 aa10.24□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 FAM177BA6PVY3 158 aa10.24□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 ALDH1A1P00352 501 aa10.24□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 EGFRP00533 1210 aa10.24□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 MOB2Q70IA6 237 aa10.24□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 SULF1Q8IWU6 871 aa10.24□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 UBR2Q8IWV8 1755 aa10.24□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 SUPT20HQ8NEM7 779 aa10.23□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 CDCA5Q96FF9 252 aa10.23□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 ERO1AQ96HE7 468 aa10.23□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 PANK3Q9H999 370 aa10.23□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 LGR6Q9HBX8 967 aa10.23□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 MTMR10Q9NXD2 777 aa10.23□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 ZNF652Q9Y2D9 606 aa10.23□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 RGL2O15211 777 aa10.22□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 DPF2Q92785 391 aa10.22□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 NR2E3Q9Y5X4 410 aa10.22□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 RIC1Q4ADV7 1423 aa10.22□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 UBE2Q2LH0YL09 131 aa10.21□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 NBPF11Q86T75 865 aa10.21□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 CD99L2Q8TCZ2 262 aa10.21□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 POLKQ9UBT6 870 aa10.21□□□□□ -0.77
SNORD46-201ENST00000364043 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa10.2□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 HTATIP2Q9BUP3 242 aa10.2□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 EFCC1Q9HA90 598 aa10.2□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 STAP2Q9UGK3 403 aa10.2□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 LAMB4A4D0S4 1761 aa10.19□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 A1BGP04217 495 aa10.19□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 CAP1Q01518 475 aa10.19□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 KIAA2012Q0VF49 1180 aa10.19□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa10.19□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 AEBP1Q8IUX7 1158 aa10.19□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 TTC5Q8N0Z6 440 aa10.19□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 CRAMP1Q96RY5 1269 aa10.19□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 GGA3Q9NZ52 723 aa10.19□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP10.19□□□□□ -0.785e-26■■■■■ 57.8
SNORD46-201ENST00000364043 HEG1Q9ULI3 1381 aa10.18□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 RPS12P25398 132 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 NUDCQ9Y266 331 aa10.18□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 KNSTRNQ9Y448 316 aa10.18□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 KDM3BQ7LBC6 1761 aa10.18□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 ABCC12Q96J65 1359 aa10.17□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 YDJCA8MPS7 323 aa10.17□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 RNMTO43148 476 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 RPTORQ8N122 1335 aa10.16□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
SNORD46-201ENST00000364043 INHBEP58166 350 aa10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms