RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361716.7

VAMP1-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP1, Length 3,449 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1-201ENST00000361716 ME3Q16798 604 aa14.85□□□□□ -0.03
VAMP1-201ENST00000361716 SDF4Q9BRK5 362 aa14.85□□□□□ -0.03
VAMP1-201ENST00000361716 USP44Q9H0E7 712 aa14.85□□□□□ -0.03
VAMP1-201ENST00000361716 MED14O60244 1454 aa14.85□□□□□ -0.03
VAMP1-201ENST00000361716 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
VAMP1-201ENST00000361716 STK11IPQ8N1F8 1099 aa14.85□□□□□ -0.03
VAMP1-201ENST00000361716 KLHDC4Q8TBB5 520 aa14.85□□□□□ -0.03
VAMP1-201ENST00000361716 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa14.85□□□□□ -0.03
VAMP1-201ENST00000361716 GPATCH3Q96I76 525 aa14.85□□□□□ -0.03
VAMP1-201ENST00000361716 CARD6Q9BX69 1037 aa14.85□□□□□ -0.03
VAMP1-201ENST00000361716 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
VAMP1-201ENST00000361716 CHPF2Q9P2E5 772 aa14.85□□□□□ -0.03
VAMP1-201ENST00000361716 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa14.84□□□□□ -0.03
VAMP1-201ENST00000361716 GNAT3A8MTJ3 354 aa14.84□□□□□ -0.03
VAMP1-201ENST00000361716 MYO1CO00159 1063 aa14.84□□□□□ -0.03
VAMP1-201ENST00000361716 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa14.84□□□□□ -0.03
VAMP1-201ENST00000361716 PLA2G4DQ86XP0 818 aa14.84□□□□□ -0.03
VAMP1-201ENST00000361716 TXLNBQ8N3L3 684 aa14.84□□□□□ -0.03
VAMP1-201ENST00000361716 ABTB2Q8N961 1025 aa14.84□□□□□ -0.03
VAMP1-201ENST00000361716 KIF1BPQ96EK5 621 aa14.84□□□□□ -0.03
VAMP1-201ENST00000361716 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
VAMP1-201ENST00000361716 FAM227BQ96M60 508 aa14.84□□□□□ -0.03
VAMP1-201ENST00000361716 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
VAMP1-201ENST00000361716 USP32Q8NFA0 1604 aa14.84□□□□□ -0.03
VAMP1-201ENST00000361716 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
VAMP1-201ENST00000361716 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
VAMP1-201ENST00000361716 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa14.83□□□□□ -0.03
VAMP1-201ENST00000361716 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
VAMP1-201ENST00000361716 PHACTR2O75167 634 aa14.83□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 PLA2G4AP47712 749 aa14.83□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 MCM6Q14566 821 aa14.83□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa14.83□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa14.83□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 FHOD1Q9Y613 1164 aa14.83□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 ROBO2Q9HCK4 1378 aa14.83□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 KINO60870 393 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 MYL6BP14649 208 aa14.82□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa14.82□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 SGSM2O43147 1006 aa14.82□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 KCNQ3O43525 872 aa14.82□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa14.82□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 AK7Q96M32 723 aa14.82□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 CLSTN2Q9H4D0 955 aa14.82□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 HYPKQ9NX55 129 aa14.82□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 TULP2O00295 520 aa14.82□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 GOLGA8FQ08AF8 430 aa14.82□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa14.82□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 SART3Q15020 963 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 E2F4Q16254 413 aa14.82□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 LEKR1Q6ZMV7 388 aa14.82□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa14.82□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 PNPLA6Q8IY17 1366 aa14.82□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 ATP10DQ9P241 1426 aa14.82□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 ME1P48163 572 aa14.81□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 ALKQ9UM73 1620 aa14.81□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 TPCN1Q9ULQ1 816 aa14.81□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 PTPRMP28827 1452 aa14.81□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 EVCP57679 992 aa14.8□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 PIK3R4Q99570 1358 aa14.8□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 CCT2P78371 535 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 PDILTQ8N807 584 aa14.8□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 IFNKQ9P0W0 207 aa14.8□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 NPHP3Q7Z494 1330 aa14.8□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 JAK2O60674 1132 aa14.8□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 PDCP20941 246 aa14.8□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 RNF20Q5VTR2 975 aa14.8□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 OSBPL3Q9H4L5 887 aa14.8□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 ANKLE2Q86XL3 938 aa14.79□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 VPS18Q9P253 973 aa14.79□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 TTLL5Q6EMB2 1281 aa14.79□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 DNAAF4Q8WXU2 420 aa14.79□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 NEUROD6Q96NK8 337 aa14.79□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 UBR1Q8IWV7 1749 aa14.79□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 NEMFO60524 1076 aa14.79□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 CHST3Q7LGC8 479 aa14.79□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 CEP57L1Q8IYX8 460 aa14.79□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 RGS22Q8NE09 1264 aa14.79□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa14.79□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 TTC14Q96N46 770 aa14.79□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 LGR6Q9HBX8 967 aa14.79□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 PRR36Q9H6K5 1346 aa14.78□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 STX1AQ16623 288 aa14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms