RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 DUOX1Q9NRD9 1551 aa9.86□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 WDR63Q8IWG1 891 aa9.85□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 MYD88Q99836 296 aa9.85□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa9.85□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF541Q9H0D2 1346 aa9.84□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa9.84□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 CCER2I3L3R5 266 aa9.84□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 DDNO94850 711 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 FSTL1Q12841 308 aa9.84□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 GRAPQ13588 217 aa9.84□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa9.84□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 POTECB2RU33 542 aa9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 BBOX1O75936 387 aa9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 KSR2Q6VAB6 950 aa9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC191Q8NCU4 936 aa9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 SMC1BQ8NDV3 1235 aa9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 JDP2Q8WYK2 163 aa9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 PI4KAP2A4QPH2 592 aa9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 IQCA1LA6NCM1 817 aa9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 FZD9O00144 591 aa9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 G2E3Q7L622 706 aa9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 TMC4Q7Z404 712 aa9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 SP8Q8IXZ3 490 aa9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 LARGE2Q8N3Y3 721 aa9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 MYH16Q9H6N6 1097 aa9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1B0GUL6 1792 aa9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 SPDYE4A6NLX3 237 aa9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 PPIP5K2O43314 1243 aa9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV5-2P06315 115 aa9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 HTRA3P83110 453 aa9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 NEXNQ0ZGT2 675 aa9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 FLIIQ13045 1269 aa9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 AOC3Q16853 763 aa9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 GPC2Q8N158 579 aa9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 SUPT20HQ8NEM7 779 aa9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 PSME4Q14997 1843 aa9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF521Q96K83 1311 aa9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 CDHR2Q9BYE9 1310 aa9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 VAMP4O75379 141 aa9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 CAPN15O75808 1086 aa9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 EIF6P56537 245 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 NIM1KQ8IY84 436 aa9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 MPNDQ8N594 471 aa9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 VPS33BQ9H267 617 aa9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 NEURL1BA8MQ27 555 aa9.79□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 PDE8AO60658 829 aa9.79□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 POTEIP0CG38 1075 aa9.79□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 POTEJP0CG39 1038 aa9.79□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC152Q4G0S7 254 aa9.79□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 HACL1Q9UJ83 578 aa9.79□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 FBXO3Q9UK99 471 aa9.79□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 GJA3Q9Y6H8 435 aa9.79□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 SCN9AQ15858 1988 aa9.79□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 KIAA2012Q0VF49 1180 aa9.78□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 CHADLQ6NUI6 762 aa9.78□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 LDHDQ86WU2 507 aa9.78□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 DNAAF4Q8WXU2 420 aa9.78□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 SEC31BQ9NQW1 1179 aa9.78□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 RTL9Q8NET4 1388 aa9.77□□□□□ -0.84
SGMS1-201ENST00000361543 TRPM7Q96QT4 1865 aa9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-201ENST00000361543 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-201ENST00000361543 EPHX2P34913 555 aa9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-201ENST00000361543 CTSWP56202 376 aa9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-201ENST00000361543 RPS8P62241 208 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-201ENST00000361543 GCKRQ14397 625 aa9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-201ENST00000361543 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-201ENST00000361543 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-201ENST00000361543 MIER1Q8N108 512 aa9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-201ENST00000361543 KLRG1Q96E93 195 aa9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-201ENST00000361543 ZNRF3Q9ULT6 936 aa9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-201ENST00000361543 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-201ENST00000361543 SCNN1DP51172 638 aa9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms