RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 RTKN2Q8IZC4 609 aa19.03■□□□□ 0.64
CSAG1-201ENST00000361211 LINS1Q8NG48 757 aa19.03■□□□□ 0.64
CSAG1-201ENST00000361211 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
CSAG1-201ENST00000361211 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa19.02■□□□□ 0.64
CSAG1-201ENST00000361211 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa19.02■□□□□ 0.64
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
CSAG1-201ENST00000361211 SEC31BQ9NQW1 1179 aa19.02■□□□□ 0.64
CSAG1-201ENST00000361211 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa19.02■□□□□ 0.64
CSAG1-201ENST00000361211 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
CSAG1-201ENST00000361211 H7C1W4 665 aa19.01■□□□□ 0.63
CSAG1-201ENST00000361211 CASP7P55210 303 aa19.01■□□□□ 0.63
CSAG1-201ENST00000361211 PSMD1Q99460 953 aa19.01■□□□□ 0.63
CSAG1-201ENST00000361211 NMRK2Q9NPI5 230 aa19.01■□□□□ 0.63
CSAG1-201ENST00000361211 LRRC37AA6NMS7 1700 aa19■□□□□ 0.63
CSAG1-201ENST00000361211 BBOX1O75936 387 aa19■□□□□ 0.63
CSAG1-201ENST00000361211 CTSWP56202 376 aa19■□□□□ 0.63
CSAG1-201ENST00000361211 COL4A5P29400 1685 aa19■□□□□ 0.63
CSAG1-201ENST00000361211 KIF3CO14782 793 aa18.99■□□□□ 0.63
CSAG1-201ENST00000361211 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
CSAG1-201ENST00000361211 IARSP41252 1262 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
CSAG1-201ENST00000361211 ALDH1L2Q3SY69 923 aa18.99■□□□□ 0.63
CSAG1-201ENST00000361211 SLC4A10Q6U841 1118 aa18.99■□□□□ 0.63
CSAG1-201ENST00000361211 SP8Q8IXZ3 490 aa18.99■□□□□ 0.63
CSAG1-201ENST00000361211 SMC4Q9NTJ3 1288 aa18.99■□□□□ 0.63
CSAG1-201ENST00000361211 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC152Q4G0S7 254 aa18.98■□□□□ 0.63
CSAG1-201ENST00000361211 MYH3P11055 1940 aa18.98■□□□□ 0.63
CSAG1-201ENST00000361211 DUOX1Q9NRD9 1551 aa18.98■□□□□ 0.63
CSAG1-201ENST00000361211 GLTPD2A6NH11 291 aa18.97■□□□□ 0.63
CSAG1-201ENST00000361211 TTLL11Q8NHH1 800 aa18.97■□□□□ 0.63
CSAG1-201ENST00000361211 PTPRCP08575 1304 aa18.97■□□□□ 0.63
CSAG1-201ENST00000361211 RPS8P62241 208 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
CSAG1-201ENST00000361211 GRIPAP1Q4V328 841 aa18.96■□□□□ 0.63
CSAG1-201ENST00000361211 PLA2G12BQ9BX93 195 aa18.96■□□□□ 0.63
CSAG1-201ENST00000361211 GREM2Q9H772 168 aa18.96■□□□□ 0.63
CSAG1-201ENST00000361211 KDM2BQ8NHM5 1336 aa18.96■□□□□ 0.63
CSAG1-201ENST00000361211 RARSP54136 660 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 TMC4Q7Z404 712 aa18.95■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 MPNDQ8N594 471 aa18.95■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa18.95■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 ZBED9Q6R2W3 1325 aa18.95■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF541Q9H0D2 1346 aa18.95■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 LTBP1Q14766 1721 aa18.94■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 ALDH1L1O75891 902 aa18.94■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 AOC3Q16853 763 aa18.94■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 RRAGCQ9HB90 399 aa18.94■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 GRM8O00222 908 aa18.93■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 DDNO94850 711 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 GPSM2P81274 684 aa18.93■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 LARGE2Q8N3Y3 721 aa18.93■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 RTL9Q8NET4 1388 aa18.93■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 WDR90Q96KV7 1748 aa18.92■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 FZD9O00144 591 aa18.92■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 PPIP5K2O43314 1243 aa18.92■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 C1QTNF8P60827 252 aa18.92■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 FOXO4P98177 505 aa18.92■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 FAM161AQ3B820 660 aa18.92■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 EPHA10Q5JZY3 1008 aa18.92■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 SPEF2Q9C093 1822 aa18.92■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 POTECB2RU33 542 aa18.91■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 CSF1RP07333 972 aa18.91■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 DPY19L2Q6NUT2 758 aa18.91■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa18.91■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 SUPT20HQ8NEM7 779 aa18.91■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 ITGA6P23229 1130 aa18.9■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 JDP2Q8WYK2 163 aa18.9■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 SUCLG2Q96I99 432 aa18.9■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 POLLQ9UGP5 575 aa18.9■□□□□ 0.62
CSAG1-201ENST00000361211 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
CSAG1-201ENST00000361211 KIAA2012Q0VF49 1180 aa18.89■□□□□ 0.61
CSAG1-201ENST00000361211 NIM1KQ8IY84 436 aa18.88■□□□□ 0.61
CSAG1-201ENST00000361211 KAZALD1Q96I82 304 aa18.88■□□□□ 0.61
CSAG1-201ENST00000361211 UTYO14607 1347 aa18.88■□□□□ 0.61
CSAG1-201ENST00000361211 BCAR3O75815 825 aa18.87■□□□□ 0.61
CSAG1-201ENST00000361211 LMBR1LQ6UX01 489 aa18.87■□□□□ 0.61
CSAG1-201ENST00000361211 TBC1D16Q8TBP0 767 aa18.87■□□□□ 0.61
CSAG1-201ENST00000361211 VPS33BQ9H267 617 aa18.87■□□□□ 0.61
CSAG1-201ENST00000361211 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
CSAG1-201ENST00000361211 PODXL2Q9NZ53 605 aa18.87■□□□□ 0.61
CSAG1-201ENST00000361211 KIF16BQ96L93 1317 aa18.86■□□□□ 0.61
CSAG1-201ENST00000361211 C6orf229H3BNL8 230 aa18.86■□□□□ 0.61
CSAG1-201ENST00000361211 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
CSAG1-201ENST00000361211 EIF6P56537 245 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
CSAG1-201ENST00000361211 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
CSAG1-201ENST00000361211 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
CSAG1-201ENST00000361211 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa18.86■□□□□ 0.61
CSAG1-201ENST00000361211 MINPP1Q9UNW1 487 aa18.86■□□□□ 0.61
CSAG1-201ENST00000361211 TNNQ9UQP3 1299 aa18.86■□□□□ 0.61
CSAG1-201ENST00000361211 CHMP3Q9Y3E7 222 aa18.86■□□□□ 0.61
CSAG1-201ENST00000361211 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
CSAG1-201ENST00000361211 RIMBP2O15034 1052 aa18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.5 ms