RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 SNAP23O00161 211 aa21.63■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 MAP7D2Q96T17 732 aa21.63■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.63■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 CNTROBQ8N137 903 aa21.63■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.63■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 PALLDQ8WX93 1383 aa21.62■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 CERKQ8TCT0 537 aa21.62■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 PTH1RQ03431 593 aa21.62■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.62■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 GREM2Q9H772 168 aa21.62■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 NRAPQ86VF7 1730 aa21.61■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 JCADQ9P266 1359 aa21.61■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 MCM4P33991 863 aa21.6■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 NEK4P51957 841 aa21.6■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 BARGINQ6ZT62 677 aa21.6■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 AMIGO3Q86WK7 504 aa21.6■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 SNRKQ9NRH2 765 aa21.6■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 RASEFQ8IZ41 740 aa21.6■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa21.6■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC87Q9NVE4 849 aa21.6■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.59■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 ADORA1P30542 326 aa21.59■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 VPS72Q15906 364 aa21.59■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC57Q2TAC2 916 aa21.59■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.59■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 FSD1Q9BTV5 496 aa21.59■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 A0A0D9SFI3 127 aa21.58■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 FAM13BQ9NYF5 915 aa21.58■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 TTC41PQ6P2S7 1318 aa21.58■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 SGSM2O43147 1006 aa21.58■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 TRAK2O60296 914 aa21.58■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 SUSD4Q5VX71 490 aa21.58■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 NUP188Q5SRE5 1749 aa21.58■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 EIF5P55010 431 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 PI16Q6UXB8 463 aa21.57■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa21.57■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.57■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 GPATCH3Q96I76 525 aa21.57■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 TAF6LQ9Y6J9 622 aa21.57■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.57■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
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PDE4D-204ENST00000358923 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 CHAMP1Q96JM3 812 aa21.56■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 AOX1Q06278 1338 aa21.56■■□□□ 1.04
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PDE4D-204ENST00000358923 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 TJP1Q07157 1748 aa21.56■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 AFF2P51816 1311 aa21.56■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 EYA2O00167 538 aa21.55■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 PKP1Q13835 747 aa21.55■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 TTLL11Q8NHH1 800 aa21.55■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 SNX21Q969T3 373 aa21.55■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.55■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 A0A1B0GUL7 405 aa21.54■■□□□ 1.04
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PDE4D-204ENST00000358923 RABEP1Q15276 862 aa21.54■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.54■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
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PDE4D-204ENST00000358923 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 EVI5LQ96CN4 794 aa21.52■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 TCEANC2Q96MN5 208 aa21.52■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 AK9Q5TCS8 1911 aa21.52■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 SCARF1Q14162 830 aa21.52■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 ADCK5Q3MIX3 580 aa21.52■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa21.52■■□□□ 1.04
PDE4D-204ENST00000358923 CAMTA2O94983 1202 aa21.51■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 PHF14O94880 888 aa21.51■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 WNK3Q9BYP7 1800 aa21.5■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 TAF5LO75529 589 aa21.5■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 OFD1O75665 1012 aa21.5■■□□□ 1.03
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