RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317378.5

TRAPPC5-201, Transcript of trafficking protein particle complex 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC5, Length 790 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC5-201ENST00000317378 TMEM88BA6NKF7 163 aa26.44■■□□□ 1.82
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TRAPPC5-201ENST00000317378 EPS15P42566 896 aa26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC5-201ENST00000317378 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC5-201ENST00000317378 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC5-201ENST00000317378 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC5-201ENST00000317378 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC5-201ENST00000317378 CNTNAP1P78357 1384 aa26.44■■□□□ 1.82
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TRAPPC5-201ENST00000317378 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC5-201ENST00000317378 KIAA2012Q0VF49 1180 aa26.43■■□□□ 1.82
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TRAPPC5-201ENST00000317378 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC5-201ENST00000317378 C8orf58Q8NAV2 365 aa26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC5-201ENST00000317378 TAF1P21675 1872 aa26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC5-201ENST00000317378 ZNF428Q96B54 188 aa26.41■■□□□ 1.82
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TRAPPC5-201ENST00000317378 GPRC5DQ9NZD1 345 aa26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC5-201ENST00000317378 LRRC37AA6NMS7 1700 aa26.39■■□□□ 1.81
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TRAPPC5-201ENST00000317378 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC5-201ENST00000317378 CCDC191Q8NCU4 936 aa26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC5-201ENST00000317378 CDHR2Q9BYE9 1310 aa26.35■■□□□ 1.81
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TRAPPC5-201ENST00000317378 TNIP1Q15025 636 aa26.34■■□□□ 1.81
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TRAPPC5-201ENST00000317378 MYD88Q99836 296 aa26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC5-201ENST00000317378 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC5-201ENST00000317378 PGAP2Q9UHJ9 254 aa26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC5-201ENST00000317378 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC5-201ENST00000317378 COL4A1P02462 1669 aa26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC5-201ENST00000317378 RAD17O75943 681 aa26.32■■□□□ 1.8
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TRAPPC5-201ENST00000317378 PODXL2Q9NZ53 605 aa26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC5-201ENST00000317378 PDE8AO60658 829 aa26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC5-201ENST00000317378 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC5-201ENST00000317378 KSR2Q6VAB6 950 aa26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC5-201ENST00000317378 TBC1D16Q8TBP0 767 aa26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC5-201ENST00000317378 DPF2Q92785 391 aa26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC5-201ENST00000317378 IL16Q14005 1332 aa26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC5-201ENST00000317378 C6orf229H3BNL8 230 aa26.26■■□□□ 1.79
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TRAPPC5-201ENST00000317378 CCDC152Q4G0S7 254 aa26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC5-201ENST00000317378 EYA3Q99504 573 aa26.26■■□□□ 1.79
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TRAPPC5-201ENST00000317378 DBNDD1Q9H9R9 158 aa26.25■■□□□ 1.79
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TRAPPC5-201ENST00000317378 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC5-201ENST00000317378 PRDM10Q9NQV6 1147 aa26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC5-201ENST00000317378 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC5-201ENST00000317378 TLL2Q9Y6L7 1015 aa26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC5-201ENST00000317378 SHTN1A0MZ66 631 aa26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC5-201ENST00000317378 ECE2O60344 883 aa26.21■■□□□ 1.79
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