RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SYNE4Q8N205 404 aa26.61■■□□□ 1.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTLL11Q8NHH1 800 aa26.61■■□□□ 1.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF609O15014 1411 aa26.6■■□□□ 1.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP5JP18859 108 aa26.6■■□□□ 1.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLEC4GQ6UXB4 293 aa26.6■■□□□ 1.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF652Q9Y2D9 606 aa26.6■■□□□ 1.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM182BQ5T319 152 aa26.59■■□□□ 1.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RABEP1Q15276 862 aa26.58■■□□□ 1.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRC24Q50LG9 513 aa26.58■■□□□ 1.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SGSM2O43147 1006 aa26.58■■□□□ 1.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HSCBQ8IWL3 235 aa26.58■■□□□ 1.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SH3TC1Q8TE82 1336 aa26.58■■□□□ 1.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRP5O75197 1615 aa26.57■■□□□ 1.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SUSD4Q5VX71 490 aa26.57■■□□□ 1.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BRWD3Q6RI45 1802 aa26.57■■□□□ 1.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DBNDD2Q9BQY9 259 aa26.56■■□□□ 1.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HIP1O00291 1037 aa26.56■■□□□ 1.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RUFY2Q8WXA3 655 aa26.55■■□□□ 1.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BOLA2Q9H3K6 86 aa26.55■■□□□ 1.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GREM2Q9H772 168 aa26.55■■□□□ 1.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANO2Q9NQ90 1003 aa26.55■■□□□ 1.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa26.55■■□□□ 1.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RPS6KA4O75676 772 aa26.54■■□□□ 1.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ITGA6P23229 1130 aa26.54■■□□□ 1.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TAF7LQ5H9L4 462 aa26.54■■□□□ 1.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IL17RAQ96F46 866 aa26.54■■□□□ 1.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IL25Q9H293 177 aa26.54■■□□□ 1.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CEP126Q9P2H0 1117 aa26.54■■□□□ 1.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP26.54■■□□□ 1.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa26.53■■□□□ 1.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NTSR2O95665 410 aa26.53■■□□□ 1.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MCCP23508 829 aa26.53■■□□□ 1.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNQ4P56696 695 aa26.53■■□□□ 1.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C4BP0C0L5 1744 aa26.53■■□□□ 1.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RFX7Q2KHR2 1363 aa26.53■■□□□ 1.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANAPC15P60006 121 aa26.53■■□□□ 1.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RIC1Q4ADV7 1423 aa26.52■■□□□ 1.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPEF2Q9C093 1822 aa26.52■■□□□ 1.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AKAP2Q9Y2D5 859 aa26.52■■□□□ 1.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HAUS7Q99871 368 aa26.51■■□□□ 1.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa26.51■■□□□ 1.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RTL9Q8NET4 1388 aa26.51■■□□□ 1.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAD50Q92878 1312 aa26.51■■□□□ 1.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COL24A1Q17RW2 1714 aa26.5■■□□□ 1.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A1B0GUL7 405 aa26.5■■□□□ 1.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SNRKQ9NRH2 765 aa26.5■■□□□ 1.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TIMM10P62072 90 aa26.49■■□□□ 1.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TICAM2Q86XR7 235 aa26.49■■□□□ 1.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NEUROD6Q96NK8 337 aa26.49■■□□□ 1.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANTXR1Q9H6X2 564 aa26.49■■□□□ 1.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NARFQ9UHQ1 456 aa26.49■■□□□ 1.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa26.48■■□□□ 1.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM196AQ6ZSG2 479 aa26.48■■□□□ 1.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C4AP0C0L4 1744 aa26.48■■□□□ 1.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP26.48■■□□□ 1.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FSD1Q9BTV5 496 aa26.48■■□□□ 1.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GNPATO15228 680 aa26.47■■□□□ 1.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HSPA4P34932 840 aa26.47■■□□□ 1.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NBR1Q14596 966 aa26.47■■□□□ 1.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CASZ1Q86V15 1759 aa26.47■■□□□ 1.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa26.46■■□□□ 1.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.46■■□□□ 1.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ABCC12Q96J65 1359 aa26.46■■□□□ 1.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IL27Q8NEV9 243 aa26.46■■□□□ 1.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.46■■□□□ 1.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARAP2Q8WZ64 1704 aa26.45■■□□□ 1.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC152Q4G0S7 254 aa26.44■■□□□ 1.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 METTL24Q5JXM2 366 aa26.44■■□□□ 1.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VGLL2Q8N8G2 317 aa26.44■■□□□ 1.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CNNM1Q9NRU3 951 aa26.44■■□□□ 1.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM177BA6PVY3 158 aa26.43■■□□□ 1.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PALD1Q9ULE6 856 aa26.43■■□□□ 1.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MED23Q9ULK4 1368 aa26.43■■□□□ 1.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ST18O60284 1047 aa26.43■■□□□ 1.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USPL1Q5W0Q7 1092 aa26.42■■□□□ 1.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 XAGE2Q96GT9 111 aa26.42■■□□□ 1.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM227BQ96M60 508 aa26.42■■□□□ 1.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MROH5Q6ZUA9 1318 aa26.42■■□□□ 1.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBR3Q6ZT12 1888 aa26.42■■□□□ 1.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZPR1O75312 459 aa26.41■■□□□ 1.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP2B3Q16720 1220 aa26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.3 ms