RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 CCDC57Q2TAC2 916 aa27.46■■□□□ 1.99
CTU2-201ENST00000312060 MSL1Q68DK7 614 aa27.46■■□□□ 1.99
CTU2-201ENST00000312060 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
CTU2-201ENST00000312060 FAM161AQ3B820 660 aa27.46■■□□□ 1.99
CTU2-201ENST00000312060 CCDC24Q8N4L8 307 aa27.46■■□□□ 1.99
CTU2-201ENST00000312060 KLHDC4Q8TBB5 520 aa27.46■■□□□ 1.99
CTU2-201ENST00000312060 APBB1O00213 710 aa27.45■■□□□ 1.98
CTU2-201ENST00000312060 NUCB1Q02818 461 aa27.45■■□□□ 1.98
CTU2-201ENST00000312060 PRR5LQ6MZQ0 368 aa27.45■■□□□ 1.98
CTU2-201ENST00000312060 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
CTU2-201ENST00000312060 COPRSQ9NQ92 184 aa27.45■■□□□ 1.98
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CTU2-201ENST00000312060 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
CTU2-201ENST00000312060 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa27.44■■□□□ 1.98
CTU2-201ENST00000312060 GREM2Q9H772 168 aa27.44■■□□□ 1.98
CTU2-201ENST00000312060 MMP10P09238 476 aa27.43■■□□□ 1.98
CTU2-201ENST00000312060 NLRP3Q96P20 1036 aa27.43■■□□□ 1.98
CTU2-201ENST00000312060 RAB11FIP3O75154 756 aa27.43■■□□□ 1.98
CTU2-201ENST00000312060 ITGA6P23229 1130 aa27.43■■□□□ 1.98
CTU2-201ENST00000312060 ST5P78524 1137 aa27.43■■□□□ 1.98
CTU2-201ENST00000312060 CCDC152Q4G0S7 254 aa27.43■■□□□ 1.98
CTU2-201ENST00000312060 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
CTU2-201ENST00000312060 PARP3Q9Y6F1 533 aa27.43■■□□□ 1.98
CTU2-201ENST00000312060 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP27.42■■□□□ 1.98
CTU2-201ENST00000312060 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
CTU2-201ENST00000312060 CHD1LQ86WJ1 897 aa27.42■■□□□ 1.98
CTU2-201ENST00000312060 SLC16A10Q8TF71 515 aa27.42■■□□□ 1.98
CTU2-201ENST00000312060 SIL1Q9H173 461 aa27.42■■□□□ 1.98
CTU2-201ENST00000312060 NRXN2Q9P2S2 1712 aa27.42■■□□□ 1.98
CTU2-201ENST00000312060 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa27.41■■□□□ 1.98
CTU2-201ENST00000312060 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
CTU2-201ENST00000312060 LNPKQ9C0E8 428 aa27.41■■□□□ 1.98
CTU2-201ENST00000312060 C3orf67Q6ZVT6 689 aa27.4■■□□□ 1.98
CTU2-201ENST00000312060 SKAP1Q86WV1 359 aa27.4■■□□□ 1.98
CTU2-201ENST00000312060 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
CTU2-201ENST00000312060 LRRCC1Q9C099 1032 aa27.4■■□□□ 1.98
CTU2-201ENST00000312060 TAF7LQ5H9L4 462 aa27.4■■□□□ 1.98
CTU2-201ENST00000312060 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
CTU2-201ENST00000312060 ERC1Q8IUD2 1116 aa27.39■■□□□ 1.97
CTU2-201ENST00000312060 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
CTU2-201ENST00000312060 RHPN1Q8TCX5 695 aa27.38■■□□□ 1.97
CTU2-201ENST00000312060 RTL9Q8NET4 1388 aa27.38■■□□□ 1.97
CTU2-201ENST00000312060 TAF1P21675 1872 aa27.38■■□□□ 1.97
CTU2-201ENST00000312060 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
CTU2-201ENST00000312060 KIF1BPQ96EK5 621 aa27.37■■□□□ 1.97
CTU2-201ENST00000312060 RIC1Q4ADV7 1423 aa27.37■■□□□ 1.97
CTU2-201ENST00000312060 BCL11AQ9H165 835 aa27.36■■□□□ 1.97
CTU2-201ENST00000312060 SEC31BQ9NQW1 1179 aa27.36■■□□□ 1.97
CTU2-201ENST00000312060 SPEF2Q9C093 1822 aa27.36■■□□□ 1.97
CTU2-201ENST00000312060 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa27.35■■□□□ 1.97
CTU2-201ENST00000312060 EYA2O00167 538 aa27.35■■□□□ 1.97
CTU2-201ENST00000312060 RGS3P49796 1198 aa27.35■■□□□ 1.97
CTU2-201ENST00000312060 FBXO3Q9UK99 471 aa27.34■■□□□ 1.97
CTU2-201ENST00000312060 CIAO1O76071 339 aa27.33■■□□□ 1.97
CTU2-201ENST00000312060 SASH1O94885 1247 aa27.33■■□□□ 1.97
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CTU2-201ENST00000312060 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa27.33■■□□□ 1.97
CTU2-201ENST00000312060 PDE4AP27815 886 aa27.33■■□□□ 1.97
CTU2-201ENST00000312060 IL15P40933 162 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
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CTU2-201ENST00000312060 ATG9AQ7Z3C6 839 aa27.33■■□□□ 1.97
CTU2-201ENST00000312060 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
CTU2-201ENST00000312060 BRIP1Q9BX63 1249 aa27.32■■□□□ 1.96
CTU2-201ENST00000312060 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
CTU2-201ENST00000312060 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
CTU2-201ENST00000312060 CNNM1Q9NRU3 951 aa27.3■■□□□ 1.96
CTU2-201ENST00000312060 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
CTU2-201ENST00000312060 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
CTU2-201ENST00000312060 MPHOSPH8Q99549 860 aa27.3■■□□□ 1.96
CTU2-201ENST00000312060 ZBTB7AO95365 584 aa27.29■■□□□ 1.96
CTU2-201ENST00000312060 CRY2Q49AN0 593 aa27.29■■□□□ 1.96
CTU2-201ENST00000312060 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
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CTU2-201ENST00000312060 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa27.28■■□□□ 1.96
CTU2-201ENST00000312060 MTFR1LQ9H019 292 aa27.28■■□□□ 1.96
CTU2-201ENST00000312060 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa27.28■■□□□ 1.96
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CTU2-201ENST00000312060 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
CTU2-201ENST00000312060 LRP5O75197 1615 aa27.27■■□□□ 1.96
CTU2-201ENST00000312060 COL4A1P02462 1669 aa27.27■■□□□ 1.96
CTU2-201ENST00000312060 PDE6BP35913 854 aa27.27■■□□□ 1.96
CTU2-201ENST00000312060 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
CTU2-201ENST00000312060 CEP126Q9P2H0 1117 aa27.26■■□□□ 1.95
CTU2-201ENST00000312060 RPS8P62241 208 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
CTU2-201ENST00000312060 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
CTU2-201ENST00000312060 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
CTU2-201ENST00000312060 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa27.24■■□□□ 1.95
CTU2-201ENST00000312060 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
CTU2-201ENST00000312060 METTL24Q5JXM2 366 aa27.24■■□□□ 1.95
CTU2-201ENST00000312060 AACSQ86V21 672 aa27.23■■□□□ 1.95
CTU2-201ENST00000312060 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
CTU2-201ENST00000312060 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
CTU2-201ENST00000312060 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
CTU2-201ENST00000312060 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
CTU2-201ENST00000312060 GRAPQ13588 217 aa27.22■■□□□ 1.95
CTU2-201ENST00000312060 TNNI3KQ59H18 835 aa27.22■■□□□ 1.95
CTU2-201ENST00000312060 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
CTU2-201ENST00000312060 GPR108Q9NPR9 543 aa27.22■■□□□ 1.95
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