RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000274606.7

NHP2-201, Transcript of NHP2 ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NHP2, Length 865 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHP2-201ENST00000274606 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
NHP2-201ENST00000274606 SMC4Q9NTJ3 1288 aa16■□□□□ 0.15
NHP2-201ENST00000274606 CDHR2Q9BYE9 1310 aa15.99■□□□□ 0.15
NHP2-201ENST00000274606 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NHP2-201ENST00000274606 PDE8AO60658 829 aa15.99■□□□□ 0.15
NHP2-201ENST00000274606 NEFLP07196 543 aa15.99■□□□□ 0.15
NHP2-201ENST00000274606 SLC4A10Q6U841 1118 aa15.99■□□□□ 0.15
NHP2-201ENST00000274606 LINS1Q8NG48 757 aa15.99■□□□□ 0.15
NHP2-201ENST00000274606 SSH1Q8WYL5 1049 aa15.99■□□□□ 0.15
NHP2-201ENST00000274606 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
NHP2-201ENST00000274606 LRRC37AA6NMS7 1700 aa15.98■□□□□ 0.15
NHP2-201ENST00000274606 GCKRQ14397 625 aa15.98■□□□□ 0.15
NHP2-201ENST00000274606 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NHP2-201ENST00000274606 CCDC152Q4G0S7 254 aa15.98■□□□□ 0.15
NHP2-201ENST00000274606 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NHP2-201ENST00000274606 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NHP2-201ENST00000274606 SNED1Q8TER0 1413 aa15.98■□□□□ 0.15
NHP2-201ENST00000274606 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa15.98■□□□□ 0.15
NHP2-201ENST00000274606 COL4A1P02462 1669 aa15.98■□□□□ 0.15
NHP2-201ENST00000274606 KDM2BQ8NHM5 1336 aa15.97■□□□□ 0.15
NHP2-201ENST00000274606 BBOX1O75936 387 aa15.97■□□□□ 0.15
NHP2-201ENST00000274606 CTSWP56202 376 aa15.97■□□□□ 0.15
NHP2-201ENST00000274606 SPEF2Q9C093 1822 aa15.96■□□□□ 0.15
NHP2-201ENST00000274606 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
NHP2-201ENST00000274606 IARSP41252 1262 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
NHP2-201ENST00000274606 ALDH1L2Q3SY69 923 aa15.96■□□□□ 0.15
NHP2-201ENST00000274606 GRIPAP1Q4V328 841 aa15.96■□□□□ 0.15
NHP2-201ENST00000274606 ERICH6BQ5W0A0 696 aa15.96■□□□□ 0.15
NHP2-201ENST00000274606 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
NHP2-201ENST00000274606 PSMD1Q99460 953 aa15.96■□□□□ 0.15
NHP2-201ENST00000274606 PTPRCP08575 1304 aa15.95■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 BEND3Q5T5X7 828 aa15.95■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 TMC4Q7Z404 712 aa15.95■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 NMRK2Q9NPI5 230 aa15.95■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 SEC31BQ9NQW1 1179 aa15.95■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 H7C1W4 665 aa15.94■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 SP8Q8IXZ3 490 aa15.94■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa15.94■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 ZBED9Q6R2W3 1325 aa15.94■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 PPIP5K2O43314 1243 aa15.93■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 DPY19L2Q6NUT2 758 aa15.93■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 LARGE2Q8N3Y3 721 aa15.93■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 MPNDQ8N594 471 aa15.93■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 JDP2Q8WYK2 163 aa15.93■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 ANP32EQ9BTT0 268 aa15.93■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 DUOX1Q9NRD9 1551 aa15.92■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 GLTPD2A6NH11 291 aa15.92■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 GRM8O00222 908 aa15.92■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 ALDH1L1O75891 902 aa15.92■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 RPS8P62241 208 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa15.92■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 SUPT20HQ8NEM7 779 aa15.92■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 GREM2Q9H772 168 aa15.92■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 COL4A5P29400 1685 aa15.92■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 KIF3CO14782 793 aa15.91■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 CASP7P55210 303 aa15.91■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 AOC3Q16853 763 aa15.91■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 FAM161AQ3B820 660 aa15.91■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 NIM1KQ8IY84 436 aa15.91■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 TTLL11Q8NHH1 800 aa15.91■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 CHMP3Q9Y3E7 222 aa15.91■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 KIF16BQ96L93 1317 aa15.91■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 ZNF541Q9H0D2 1346 aa15.91■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 RTL9Q8NET4 1388 aa15.9■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 RARSP54136 660 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 PLA2G12BQ9BX93 195 aa15.9■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 RRAGCQ9HB90 399 aa15.9■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 WDR90Q96KV7 1748 aa15.9■□□□□ 0.14
NHP2-201ENST00000274606 LTBP1Q14766 1721 aa15.89■□□□□ 0.13
NHP2-201ENST00000274606 GPSM2P81274 684 aa15.89■□□□□ 0.13
NHP2-201ENST00000274606 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
NHP2-201ENST00000274606 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa15.89■□□□□ 0.13
NHP2-201ENST00000274606 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
NHP2-201ENST00000274606 C6orf229H3BNL8 230 aa15.88■□□□□ 0.13
NHP2-201ENST00000274606 DDNO94850 711 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
NHP2-201ENST00000274606 ITGA6P23229 1130 aa15.88■□□□□ 0.13
NHP2-201ENST00000274606 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
NHP2-201ENST00000274606 EIF6P56537 245 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
NHP2-201ENST00000274606 C1QTNF8P60827 252 aa15.88■□□□□ 0.13
NHP2-201ENST00000274606 UFL1O94874 794 aa15.87■□□□□ 0.13
NHP2-201ENST00000274606 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
NHP2-201ENST00000274606 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa15.86■□□□□ 0.13
NHP2-201ENST00000274606 FZD9O00144 591 aa15.86■□□□□ 0.13
NHP2-201ENST00000274606 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
NHP2-201ENST00000274606 KIAA2012Q0VF49 1180 aa15.86■□□□□ 0.13
NHP2-201ENST00000274606 SUCLG2Q96I99 432 aa15.86■□□□□ 0.13
NHP2-201ENST00000274606 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
NHP2-201ENST00000274606 EYA3Q99504 573 aa15.86■□□□□ 0.13
NHP2-201ENST00000274606 GGA1Q9UJY5 639 aa15.86■□□□□ 0.13
NHP2-201ENST00000274606 GJA3Q9Y6H8 435 aa15.86■□□□□ 0.13
NHP2-201ENST00000274606 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
NHP2-201ENST00000274606 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
NHP2-201ENST00000274606 FOXO4P98177 505 aa15.85■□□□□ 0.13
NHP2-201ENST00000274606 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
NHP2-201ENST00000274606 WASHC4Q2M389 1173 aa15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms