RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa10.37□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 UNC5CLQ8IV45 518 aa10.37□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP10.37□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 ATP5JP18859 108 aa10.37□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 FOSBP53539 338 aa10.37□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP10.37□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 GCKRQ14397 625 aa10.37□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa10.37□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 TNNI3KQ59H18 835 aa10.37□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 WASF1Q92558 559 aa10.37□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 C19orf44Q9H6X5 657 aa10.37□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa10.37□□□□□ -0.75
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HERC3-201ENST00000264345 PDCL2Q8N4E4 241 aa10.36□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 PLBD2Q8NHP8 589 aa10.36□□□□□ -0.75
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HERC3-201ENST00000264345 TYRO3Q06418 890 aa10.36□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 Q6ZUG5 572 aa10.36□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 ARHGEF25Q86VW2 580 aa10.36□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 CCDC112Q8NEF3 446 aa10.36□□□□□ -0.75
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HERC3-201ENST00000264345 DACH1Q9UI36 760 aa10.35□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 ZDHHC9Q9Y397 364 aa10.35□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 ELP1O95163 1332 aa10.35□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 NEURL1BA8MQ27 555 aa10.35□□□□□ -0.75
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HERC3-201ENST00000264345 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 TOMM22Q9NS69 142 aa10.35□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 TAOK2Q9UL54 1235 aa10.35□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 MTMR6Q9Y217 621 aa10.35□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa10.35□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 XBP1P17861 261 aa10.35□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP10.35□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 TFCP2Q12800 502 aa10.35□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 RFX7Q2KHR2 1363 aa10.35□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 CNNM1Q9NRU3 951 aa10.35□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 CLIP2Q9UDT6 1046 aa10.35□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 GOLIM4O00461 696 aa10.35□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 STARD3NLO95772 234 aa10.35□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 ZNF165P49910 485 aa10.35□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 CADPS2Q86UW7 1296 aa10.35□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 CLSTN2Q9H4D0 955 aa10.35□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 PAG1Q9NWQ8 432 aa10.35□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 PRDM11Q9NQV5 511 aa10.34□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 SLIT1O75093 1534 aa10.34□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 SALL3Q9BXA9 1300 aa10.34□□□□□ -0.75
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HERC3-201ENST00000264345 PTH1RQ03431 593 aa10.34□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 BRF1Q92994 677 aa10.34□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 C8orf76Q96K31 380 aa10.34□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 COPRSQ9NQ92 184 aa10.34□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa10.34□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 CKAP2LQ8IYA6 745 aa10.34□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa10.34□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 TTC14Q96N46 770 aa10.34□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 DACT1Q9NYF0 836 aa10.34□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa10.34□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 SMC2O95347 1197 aa10.34□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 TPM1P09493 284 aa10.34□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 SLC39A6Q13433 755 aa10.34□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 ME3Q16798 604 aa10.34□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 ANO6Q4KMQ2 910 aa10.34□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 FAM227BQ96M60 508 aa10.34□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 NACAP1Q9BZK3 213 aa10.34□□□□□ -0.75
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HERC3-201ENST00000264345 UBR1Q8IWV7 1749 aa10.33□□□□□ -0.76
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HERC3-201ENST00000264345 DSCC1Q9BVC3 393 aa10.33□□□□□ -0.76
HERC3-201ENST00000264345 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
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HERC3-201ENST00000264345 KCNG4Q8TDN1 519 aa10.33□□□□□ -0.76
HERC3-201ENST00000264345 GPR108Q9NPR9 543 aa10.33□□□□□ -0.76
HERC3-201ENST00000264345 TUBB4AP04350 444 aa10.33□□□□□ -0.76
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HERC3-201ENST00000264345 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
HERC3-201ENST00000264345 BRMS1Q9HCU9 246 aa10.33□□□□□ -0.76
HERC3-201ENST00000264345 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa10.32□□□□□ -0.76
HERC3-201ENST00000264345 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa10.32□□□□□ -0.76
HERC3-201ENST00000264345 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa10.32□□□□□ -0.76
HERC3-201ENST00000264345 ZNF213O14771 459 aa10.32□□□□□ -0.76
HERC3-201ENST00000264345 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
HERC3-201ENST00000264345 HOMER1Q86YM7 354 aa10.32□□□□□ -0.76
HERC3-201ENST00000264345 KBTBD3Q8NAB2 608 aa10.32□□□□□ -0.76
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