RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261556.10

TMEM260-201, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TMEM260, Length 4,264 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-201ENST00000261556 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa14.94□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 BIN1O00499 593 aa14.94□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 FAM173BQ6P4H8 233 aa14.94□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa14.94□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa14.93□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 ZSCAN12O43309 604 aa14.93□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 HDXQ7Z353 690 aa14.93□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 CCDC114Q96M63 670 aa14.93□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 USP26Q9BXU7 913 aa14.93□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 AFAP1L1Q8TED9 768 aa14.93□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 ADAMTS2O95450 1211 aa14.93□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 GNAT3A8MTJ3 354 aa14.92□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 BRD1O95696 1058 aa14.92□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 PLA2G4AP47712 749 aa14.92□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 CEP85LQ5SZL2 805 aa14.92□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.92□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 KARSQ15046 597 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 LRRC8AQ8IWT6 810 aa14.92□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 KIRREL3Q8IZU9 778 aa14.92□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 SGSM3Q96HU1 749 aa14.92□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 MED4Q9NPJ6 270 aa14.92□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 AOPEPQ8N6M6 819 aa14.91□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 ATRIPQ8WXE1 791 aa14.91□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa14.91□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 PARD3Q8TEW0 1356 aa14.91□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 SDSP20132 328 aa14.91□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 ME1P48163 572 aa14.91□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 CUL7Q14999 1698 aa14.91□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 POTEDQ86YR6 584 aa14.91□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 ENO4A6NNW6 628 aa14.9□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 NDUFAB1O14561 156 aa14.9□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa14.9□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 MPHOSPH8Q99549 860 aa14.9□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 SAMM50Q9Y512 469 aa14.9□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 FBLN1P23142 703 aa14.9□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 PAX7P23759 505 aa14.9□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 CCDC57Q2TAC2 916 aa14.9□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 KIF1BPQ96EK5 621 aa14.9□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 ZNF446Q9NWS9 450 aa14.9□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 NOS1P29475 1434 aa14.9□□□□□ -0.02
TMEM260-201ENST00000261556 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 GJB2P29033 226 aa14.89□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 F13A1P00488 732 aa14.89□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 SYT1P21579 422 aa14.89□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 MICALCLQ6ZW33 695 aa14.89□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 FAM204AQ9H8W3 233 aa14.89□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 ZDHHC9Q9Y397 364 aa14.89□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 FAM160A1Q05DH4 1040 aa14.89□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 LONRF2Q1L5Z9 754 aa14.89□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 CEP112Q8N8E3 955 aa14.89□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 CABS1Q96KC9 395 aa14.89□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa14.89□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 ELF1P32519 619 aa14.89□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 CCDC158Q5M9N0 1113 aa14.89□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 BCAS4Q8TDM0 211 aa14.89□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 NBPF6Q5VWK0 638 aa14.88□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 NBPF4Q96M43 638 aa14.88□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 SETSIPP0DME0 302 aa14.88□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 DDIT3P35638 169 aa14.88□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 WWC2Q6AWC2 1192 aa14.88□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 FOXR1Q6PIV2 292 aa14.88□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa14.88□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 GOPCQ9HD26 462 aa14.88□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.88□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 BICDL1Q6ZP65 573 aa14.88□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 ANO10Q9NW15 660 aa14.88□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 FHOD1Q9Y613 1164 aa14.88□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 TTC22Q5TAA0 569 aa14.87□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 KIF14Q15058 1648 aa14.87□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 TOP1P11387 765 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 PSMA5P28066 241 aa14.87□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 NBPF20Q3BBV1 942 aa14.87□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 SLFNL1Q499Z3 407 aa14.87□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 IFNKQ9P0W0 207 aa14.87□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 HSPA4P34932 840 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 GRIPAP1Q4V328 841 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 CCDC150Q8NCX0 1101 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1008.2 ms