RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
PTPRB-201ENST00000261266 HELLSQ9NRZ9 838 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRB-201ENST00000261266 MYOM2P54296 1465 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRB-201ENST00000261266 TUBBP07437 444 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRB-201ENST00000261266 RBM25P49756 843 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM67Q5HYA8 995 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRB-201ENST00000261266 CCDC102BQ68D86 513 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRB-201ENST00000261266 ESR2Q92731 530 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRB-201ENST00000261266 CLIP2Q9UDT6 1046 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRB-201ENST00000261266 CALML3P27482 149 aa10.4□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF804AQ7Z570 1209 aa10.4□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 ZHX3Q9H4I2 956 aa10.4□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 SYNMO15061 1565 aa10.4□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 CEP170Q5SW79 1584 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 SHTN1A0MZ66 631 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 DCAF5Q96JK2 942 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 FERMT1Q9BQL6 677 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 MTMR7Q9Y216 660 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 CCDC184Q52MB2 194 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 BRAPQ7Z569 592 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 LINS1Q8NG48 757 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 TBC1D2Q9BYX2 928 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 HDAC9Q9UKV0 1011 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 CRACR2AQ9BSW2 395 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 GLT8D2Q9H1C3 349 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 MYO1BO43795 1136 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 PLVAPQ9BX97 442 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 VSIG10Q8N0Z9 540 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 FSIP1Q8NA03 581 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 LRSAM1Q6UWE0 723 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 SYCE3A1L190 88 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 ABCF2Q9UG63 623 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 GRM8O00222 908 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 TUBB2AQ13885 445 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 PPP2R5BQ15173 497 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 LRRC45Q96CN5 670 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 TUBB2BQ9BVA1 445 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 C19orf44Q9H6X5 657 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 USP16Q9Y5T5 823 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 KIAA0232Q92628 1395 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP10.38□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 TTLL5Q6EMB2 1281 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 DCTPP1Q9H773 170 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 WTAPQ15007 396 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 CCDC96Q2M329 555 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 NEFHP12036 1026 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 NEBLO76041 1014 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP10.37□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 PDE1AP54750 535 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 IP6K1Q92551 441 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 BICDL2A1A5D9 508 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 MINDY4BA8MYZ0 360 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 PARP10Q53GL7 1025 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 DNAJC5BQ9UF47 199 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 SMC5Q8IY18 1101 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 LMBR1Q8WVP7 490 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 SSH2Q76I76 1423 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 KIF4AO95239 1232 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 IL2RBP14784 551 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 ABCA8O94911 1581 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 EYA3Q99504 573 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 FEZ1Q99689 392 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 EXOC1Q9NV70 894 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 CEP128Q6ZU80 1094 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 TBC1D5Q92609 795 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 IQCDQ96DY2 449 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 MAST3O60307 1309 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 TTC37Q6PGP7 1564 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 ZBTB43O43298 467 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 ATP2B3Q16720 1220 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 USP25Q9UHP3 1055 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 A0A1W2PP64 1363 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 PI4KAP2A4QPH2 592 aa10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms