RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 PDE1AP54750 535 aa18.3■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 KIF5AQ12840 1032 aa18.3■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 POTEJP0CG39 1038 aa18.3■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 PCK1P35558 622 aa18.3■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 PPFIBP2Q8ND30 876 aa18.3■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 AIDAQ96BJ3 306 aa18.3■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 SELENOOQ9BVL4 669 aa18.3■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 KDM2BQ8NHM5 1336 aa18.29■□□□□ 0.52
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CTIF-201ENST00000256413 SLC12A7Q9Y666 1083 aa18.29■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa18.29■□□□□ 0.52
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CTIF-201ENST00000256413 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
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CTIF-201ENST00000256413 HOMER2Q9NSB8 354 aa18.25■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 IMPACTQ9P2X3 320 aa18.25■□□□□ 0.51
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CTIF-201ENST00000256413 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa18.24■□□□□ 0.51
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CTIF-201ENST00000256413 FGD5Q6ZNL6 1462 aa18.23■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 AFMP43652 599 aa18.23■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 GAS2L3Q86XJ1 694 aa18.23■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 ANKLE2Q86XL3 938 aa18.23■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 RAB34Q9BZG1 259 aa18.23■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 HPDP32754 393 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
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