RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa11.73□□□□□ -0.53
APOBEC1-201ENST00000229304 FBXO22Q8NEZ5 403 aa11.73□□□□□ -0.53
APOBEC1-201ENST00000229304 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
APOBEC1-201ENST00000229304 COPRSQ9NQ92 184 aa11.73□□□□□ -0.53
APOBEC1-201ENST00000229304 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC1-201ENST00000229304 ERVV-1B6SEH8 477 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC1-201ENST00000229304 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
APOBEC1-201ENST00000229304 SDSP20132 328 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC1-201ENST00000229304 HSPA1LP34931 641 aa11.72□□□□□ -0.53
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APOBEC1-201ENST00000229304 SIK1P57059 783 aa11.71□□□□□ -0.53
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APOBEC1-201ENST00000229304 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
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APOBEC1-201ENST00000229304 ZBTB3Q9H5J0 574 aa11.71□□□□□ -0.53
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APOBEC1-201ENST00000229304 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa11.7□□□□□ -0.54
APOBEC1-201ENST00000229304 PALLDQ8WX93 1383 aa11.69□□□□□ -0.54
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APOBEC1-201ENST00000229304 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
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APOBEC1-201ENST00000229304 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
APOBEC1-201ENST00000229304 ACSBG1Q96GR2 724 aa11.69□□□□□ -0.54
APOBEC1-201ENST00000229304 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
APOBEC1-201ENST00000229304 MFRPQ9BY79 579 aa11.69□□□□□ -0.54
APOBEC1-201ENST00000229304 CCDC87Q9NVE4 849 aa11.69□□□□□ -0.54
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APOBEC1-201ENST00000229304 ATP6V1AP38606 617 aa11.68□□□□□ -0.54
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APOBEC1-201ENST00000229304 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
APOBEC1-201ENST00000229304 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
APOBEC1-201ENST00000229304 PI4K2BQ8TCG2 481 aa11.68□□□□□ -0.54
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APOBEC1-201ENST00000229304 LMBR1LQ6UX01 489 aa11.67□□□□□ -0.54
APOBEC1-201ENST00000229304 NUTM1Q86Y26 1132 aa11.67□□□□□ -0.54
APOBEC1-201ENST00000229304 GPATCH3Q96I76 525 aa11.67□□□□□ -0.54
APOBEC1-201ENST00000229304 ECHDC1Q9NTX5 307 aa11.67□□□□□ -0.54
APOBEC1-201ENST00000229304 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
APOBEC1-201ENST00000229304 ITGB4P16144 1822 aa11.67□□□□□ -0.54
APOBEC1-201ENST00000229304 AFF2P51816 1311 aa11.66□□□□□ -0.54
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APOBEC1-201ENST00000229304 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
APOBEC1-201ENST00000229304 KCNQ2O43526 872 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC1-201ENST00000229304 CIAO1O76071 339 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC1-201ENST00000229304 HLFQ16534 295 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC1-201ENST00000229304 NLRP10Q86W26 655 aa11.66□□□□□ -0.54
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APOBEC1-201ENST00000229304 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC1-201ENST00000229304 GPR108Q9NPR9 543 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC1-201ENST00000229304 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC1-201ENST00000229304 REC8O95072 547 aa11.65□□□□□ -0.54
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APOBEC1-201ENST00000229304 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
APOBEC1-201ENST00000229304 ERICH6Q7L0X2 663 aa11.65□□□□□ -0.54
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APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF34Q8IZ26 560 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC1-201ENST00000229304 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
APOBEC1-201ENST00000229304 AK7Q96M32 723 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC1-201ENST00000229304 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
APOBEC1-201ENST00000229304 NUP188Q5SRE5 1749 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC1-201ENST00000229304 DOT1LQ8TEK3 1739 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC1-201ENST00000229304 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC1-201ENST00000229304 CHMLP26374 656 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC1-201ENST00000229304 IL15P40933 162 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
APOBEC1-201ENST00000229304 PARP10Q53GL7 1025 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC1-201ENST00000229304 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
APOBEC1-201ENST00000229304 TSHZ3Q63HK5 1081 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC1-201ENST00000229304 CNTROBQ8N137 903 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC1-201ENST00000229304 USP26Q9BXU7 913 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC1-201ENST00000229304 BCL11AQ9H165 835 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC1-201ENST00000229304 TJP1Q07157 1748 aa11.63□□□□□ -0.55
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