RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640421.1

SPIN3-238, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 1,872 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-238	ENST00000640421	TSPAN31	Q12999	210 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	SELENBP1	Q13228	472 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	FHL1	Q13642	323 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	KIF18B	Q86Y91	864 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	EXD3	Q8N9H8	876 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	STK35	Q8TDR2	534 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	UCK2	Q9BZX2	261 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	TOR3A	Q9H497	397 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	C8orf4	Q9NR00	106 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421		H0YC42	278 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	BGLAP	P02818	100 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	FXYD6P3	P58550	94 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF74	Q16587	644 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	TRIL	Q7L0X0	811 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	SGTB	Q96EQ0	304 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	SFXN2	Q96NB2	322 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	VCX	Q9H320	206 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421		A0A1W2PNR3	127 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	ACOT7	O00154	380 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	IGF2	P01344	180 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	IMPDH2	P12268	514 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF24	P17028	368 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	STAR	P49675	285 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	GXYLT1	Q4G148	440 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	15.98	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421		Q8NA96	180 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	DDIT4L	Q96D03	193 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421		H0YJX3	145 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	OR7A10	O76100	309 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	TFPI	P10646	304 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	MAP2K6	P52564	334 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	CLDN20	P56880	219 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	MYBPH	Q13203	477 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	SLC10A1	Q14973	349 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	PARP8	Q8N3A8	854 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	SMPDL3B	Q92485	455 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	CLDN15	P56746	228 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	RAC1	P63000	192 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	SLC36A3	Q495N2	470 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	GGN	Q86UU5	652 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	SIAH3	Q8IW03	269 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	CDK20	Q8IZL9	346 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	OR5B2	Q96R09	309 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	UNC119B	A6NIH7	251 aa		15.96	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	CHM	P24386	653 aa		15.96	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	15.96	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	COX10	Q12887	443 aa		15.96	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	15.96	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		15.96	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	OR51A7	Q8NH64	312 aa		15.96	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	LIPH	Q8WWY8	451 aa		15.96	■□□□□ 0.15
SPIN3-238	ENST00000640421	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		15.96	■□□□□ 0.15

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