RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 FAM171A2A8MVW0 826 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 SEC14L2O76054 403 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 GCH1P30793 250 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 FOXK2Q01167 660 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 DUSP8Q13202 625 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 RHEBQ15382 184 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 EMC4Q5J8M3 183 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 VASNQ6EMK4 673 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 LINC00299Q6ZSB3 139 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 BHLHA9Q7RTU4 235 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
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PDE4D-228ENST00000636120 PPP1R35Q8TAP8 253 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 HCAR1Q9BXC0 346 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 GAREM1Q9H706 876 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 NRIP3Q9NQ35 241 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 A0A1B0GWA3 101 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 RFXAPO00287 272 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 HMGN4O00479 90 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 IFNA1P01562 189 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 ITGB2P05107 769 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 ATP1B3P54709 279 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 SPCS2Q15005 226 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 NKAIN2Q5VXU1 208 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 FAM217AQ8IXS0 508 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF683Q8IZ20 524 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 POGLUT1Q8NBL1 392 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 OR5J2Q8NH18 312 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 SLC37A2Q8TED4 501 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 IER2Q9BTL4 223 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 SLC6A17Q9H1V8 727 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 C1orf198Q9H425 327 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 TCRBV5S2A0A599 114 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 GOSR2O14653 212 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 HPGDSO60760 199 aa5.99□□□□□ -1.45
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PDE4D-228ENST00000636120 CCR2P41597 374 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 TAS2R19P59542 299 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 PPA1Q15181 289 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 YIF1BQ5BJH7 314 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 HBMQ6B0K9 141 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 CAMKMTQ7Z624 323 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 OR4F15Q8NGB8 312 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 OR52I1Q8NGK6 324 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
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PDE4D-228ENST00000636120 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa5.99□□□□□ -1.45
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PDE4D-228ENST00000636120 ELOVL3Q9HB03 270 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 FGF21Q9NSA1 209 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 PLEK2Q9NYT0 353 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF175Q9Y473 711 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 A6NLC8 198 aa5.99□□□□□ -1.45
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PDE4D-228ENST00000636120 F5H5P2 479 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 B4GAT1O43505 415 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 PRKACBP22694 351 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 TNFSF4P23510 183 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 CTGFP29279 349 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 PSMB10P40306 273 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 LSSP48449 732 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 P2RX1P51575 399 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 PRKXP51817 358 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 DEFA5Q01523 94 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 COL28A1Q2UY09 1125 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF767PQ75MW2 155 aa5.99□□□□□ -1.45
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PDE4D-228ENST00000636120 PARP16Q8N5Y8 322 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 OR1J2Q8NGS2 313 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 ALG12Q9BV10 488 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 BEX2Q9BXY8 128 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 BEX1Q9HBH7 125 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 NLKQ9UBE8 527 aa5.99□□□□□ -1.45
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PDE4D-228ENST00000636120 A3GALT2U3KPV4 340 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 PRAMEF25A6NGN4 478 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF749O43361 778 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 RAB3DO95716 219 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 SERPINA5P05154 406 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 SBK3P0C264 359 aa5.99□□□□□ -1.45
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