RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	TREM2	Q9NZC2	230 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	C1RL	Q9NZP8	487 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	RNF14	Q9UBS8	474 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF69	Q9UC07	566 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	DHRS7	Q9Y394	339 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	PKHD1	P08F94	4074 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM247	A6NEH6	219 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	FAM159B	A6NKW6	160 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	WNT9B	O14905	357 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	TTC4	O95801	387 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	SLC16A8	O95907	504 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	LCAT	P04180	440 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	CRYBA1	P05813	215 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	DAO	P14920	347 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	IL10	P22301	178 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	MT3	P25713	68 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	GIF	P27352	417 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	PAFAH1B1	P43034	410 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	PCP4	P48539	62 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	ARL4C	P56559	192 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	CLDN18	P56856	261 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	TAS2R39	P59534	338 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	TMED2	Q15363	201 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	GUSBP1	Q15486	140 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	SAXO2	Q658L1	398 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	GALNT7	Q86SF2	657 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	CARM1	Q86X55	608 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	PDIK1L	Q8N165	341 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM163	Q8TC26	289 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	LRRC39	Q96DD0	335 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	PANX3	Q96QZ0	392 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	ASCL2	Q99929	193 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	PINK1	Q9BXM7	581 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	OR10A4	Q9H209	315 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	RNF122	Q9H9V4	155 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	CNIH4	Q9P003	139 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	TAC3	Q9UHF0	121 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	PDE10A	Q9Y233	779 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768		E5RI56	91 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768		H0YL77	283 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	CLDN34	H7C241	214 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	CLPX	O76031	633 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	RPN2	P04844	631 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	MPC1L	P0DKB6	136 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF708	P17019	499 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	HTR3A	P46098	478 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	PLTP	P55058	493 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	SELENOV	P59797	346 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	DLG1	Q12959	904 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	FGFBP1	Q14512	234 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	PON3	Q15166	354 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	DEFB134	Q4QY38	66 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	PIGG	Q5H8A4	983 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM64	Q6YI46	380 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768		Q6ZSR9	355 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	RNF144B	Q7Z419	303 aa		4.12	□□□□□ -1.75

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