RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614837.1

ATP5D-209, Transcript of ATP synthase subunit delta, mitochondrial, human

TSL 2

Gene ATP5D, Length 343 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP5D-209	ENST00000614837	H3F3A	P84243	136 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	CEACAM7	Q14002	265 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	PDK3	Q15120	406 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	DUSP7	Q16829	419 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	TREML1	Q86YW5	311 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	SH3GL1	Q99961	368 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	MED18	Q9BUE0	208 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	GID8	Q9NWU2	228 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	PRSS50	Q9UI38	385 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837		A0A1B0GWA3	101 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	LIPT2	A6NK58	231 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	CASK	O14936	926 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	TPST2	O60704	377 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	NPIPB7	O75200	414 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	LGI1	O95970	557 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	COX4I1	P13073	169 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	NTF4	P34130	210 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	OR3A2	P47893	321 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	EGR4	Q05215	589 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	POU4F3	Q15319	338 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	OR7A5	Q15622	319 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	CDC20B	Q86Y33	519 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	TMEM99	Q8N816	258 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	PIGX	Q8TBF5	258 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	TAMM41	Q96BW9	452 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	ZNF583	Q96ND8	569 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	ARHGDIG	Q99819	225 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	CAD	P27708	2225 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ATP5D-209	ENST00000614837	GMNC	A6NCL1	334 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837		M0R3H8	397 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	DYNC1I1	O14576	645 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	SIAH2	O43255	324 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	SNX3	O60493	162 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	AKR7A3	O95154	331 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	HRG	P04196	525 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	GPI	P06744	558 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	THBD	P07204	575 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	CD247	P20963	164 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	CRYBA2	P53672	197 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	SLC16A1	P53985	500 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	GNGT1	P63211	74 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	OR1Q1	Q15612	314 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	TSC22D1	Q15714	1073 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	NRF1	Q16656	503 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	CCDC80	Q76M96	950 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	CDH24	Q86UP0	819 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	ELOA3	Q8NG57	546 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	STK35	Q8TDR2	534 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	TRIM2	Q9C040	744 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	LIME1	Q9H400	295 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	FANCF	Q9NPI8	374 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	EMC3	Q9P0I2	261 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837		A0A1W2PPR1	153 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	AIM2	O14862	343 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	GOSR1	O95249	250 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	ADA	P00813	363 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	C8B	P07358	591 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	CRYGS	P22914	178 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	NCALD	P61601	193 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	NPTX1	Q15818	432 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP5D-209	ENST00000614837	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms